ハプログループM7a (mtDNA)

ハプログループM7a (mtDNA)(ハプログループM7a (ミトコンドリアDNA)、: Haplogroup M7a (mtDNA))とは、分子人類学で用いられる、人類ミトコンドリアDNAハプログループ(型集団)の分類のうち、ハプログループMを祖先に持ち「ハプログループM7」より分岐したものである。

把握済みの全てのハプログループM7aのミトコンドリアDNAの最も近い共通祖先はBehar et al. (2012)によれば今より22707.1 (SD 5385.6)年前[1]と、FTDNAによれば今より22,766 (99% CI 26,827 - 19,094)年前[2]と推定されている。

概略

起源

約4万年以上前に誕生したアジア最大の母系グループ[3]である「M」型から分岐したM7より分岐したグループで、約2万5000年前に「スンダランド」で誕生し北上して日本列島に到達した系統にあたる[4]とする見方がある一方で、シベリア南部 - 極東あたりで発生したとする見方もある[5]

古人骨

2010年までに沖縄県石垣島白保竿根田原洞穴遺跡から発掘された、旧石器時代人骨国立科学博物館が分析した結果、国内最古の人骨(約2万-1万年前)とされた4点のうち2点は、このハプログループM7aと呼ばれる系統であることが明らかとなった[6]

分布

日本人の約7.6%がこの型に属し、沖縄(26%)、本州(7%)の他、北海道アイヌ(16%)や、縄文人の人骨からも検出されている。韓国人のサンプルでも1.90%~4%確認され[7][8][9]、日本から移住し在住・帰化している日本人であると思われる。現代中国では漢族の0.134%がmtDNAハプログループM7aに属している。[10]

系統樹

ハプログループM7のサブクレードの系統樹は、マニス・バン・オーブンマンフレッド・カイザーの論文に基づく[11]

    • M7
      • M7a
        • M7a1 日本(東北・関東甲信越・沖縄・中部北陸等・計7.0%[12])、中国(山東省漢族2人・江蘇省漢族1人等・計0.129%[10]
          • M7a1a 日本(6.4%[12])、韓国[2]、中国(河北省漢族5人・河南省漢族2人・北京市漢族1人・上海市漢族1人・四川省漢族1人・山東省漢族1人等・計0.115%[10]
            • M7a1a1 日本(中部北陸等・計1.4%[12])、韓国[13]、中国(吉林省漢族1人・河南省漢族1人・山東省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.018%[10]
              • M7a1a1a (M7a1a1+A9299G) 日本[2](北海道・東北・関東甲信越・中部北陸・九州・計1.2%[12]、岐阜県・愛知県・東京都等[13]
              • M7a1a1b (M7a1a1+G10589A) 日本[2][13]、韓国[2]、カザフスタン[2]
                • M7a1a1b1 (M7a1a1b+T12477C) アメリカ合衆国(ユタ州[13]
            • M7a1a2 日本(東北・中部北陸・計0.1%[12]、中国(上海市漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.009%[10]
            • M7a1a3 日本(北海道・東北・中部北陸・計0.3%[12]
            • M7a1a4 日本(北海道・九州・中部北陸・計0.6%[12])、中国(山東省漢族1人・浙江省漢族1人・計0.009%[10]
              • M7a1a4a 日本(北海道・中部北陸・計0.3%[12]
            • M7a1a5 日本(東京都[13])、韓国[13]
              • M7a1a5a (M7a1a5+G7852A) 日本(東京都・愛知県等[13]、中部北陸・計0.2%[12])、中国(天津市漢族1人・計0.0046%[10]
            • M7a1a6 日本[13](東北・九州・計0.2%[12])、中国(山西省漢族1人・山東省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.014%[10])、フィリピン[13]
              • M7a1a6a (M7a1a6+T152C!+T16223C) 日本(千葉県等[13]
            • M7a1a7 日本(東北・関東甲信越・中部北陸・近畿・九州・計1.6%[12])、韓国[13]、スコットランド[2]
              • M7a1a7a (M7a1a7+T14581C) 中国(ウイグル族[13]
              • M7a1a7b (M7a1a7+A955AC) 日本(東京都・愛知県[13]
              • M7a1a7c (M7a1a7+T14180C) 日本(東京都[13]
            • M7a1a8 日本[13](九州・中部北陸・計0.1%[12])、中国(江蘇省漢族1人[10]
              • M7a1a8a (M7a1a8+A4395G) 日本(千葉県・東京都[13]
            • M7a1a9 日本(千葉県・東京都[13]
              • M7a1a9a (M7a1a9+T14025C) 韓国[13]、中国(天津市漢族1人・計0.0046%[10]
          • M7a1b
            • M7a1b1 日本(北海道・東北・中部北陸・計0.2%[12]、鹿児島県・東京都等[13])、中国(黒竜江省漢族1人・計0.0046%[10])、台湾(閩南語話者の漢族1人[13]
              • M7a1b1a (M7a1b1+T5108C) 日本(東京都・愛知県[13]
            • M7a1b2 日本[13]
        • M7a2 日本(静岡県等[13]、近畿等・計0.2%[12]
          • M7a2a
            • M7a2a1 日本(千葉県・愛知県[13]
            • M7a2a2 日本[13]
              • M7a2a2a (M7a2a2+C2218T) 日本(群馬県[13]
                • M7a2a2a1 (M7a2a2+A4435G) 日本(愛知県[13]
            • M7a2a3 (M7a2a+G1888A+A4093G+T10966C+C16187T!)
              • M7a2a3a (M7a2a3+T15449C) ロシア(ウデヘ[13]
              • M7a2a3b (M7a2a3+C15379T) ロシア(ブリヤート・ニュクジャ川流域エヴェンキ[13]
            • M7a2a4 (M7a2a+A10730G) 日本[13]
          • M7a2b
          • M7a2c (M7a2+C13596T+C16167T+C16234T) 日本[2]

脚注

  1. ^ Behar DM, van Oven M, Rosset S, Metspalu M, Loogväli EL, Silva NM, Kivisild T, Torroni A, Villems R. A "Copernican" reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Am J Hum Genet. 2012 Apr 6;90(4):675-84. doi:10.1016/j.ajhg.2012.03.002. Erratum in: Am J Hum Genet. 2012 May 4;90(5):936. PMID 22482806; PMC PMC3322232.
  2. ^ a b c d e f g h FamilyTreeDNAによるハプログループM7aの系統樹
  3. ^ Ghezzi et al. (2005), Mitochondrial DNA haplogroup K is associated with a lower risk of Parkinson's disease in Italians, European Journal of Human Genetics (2005) 13, 748–752.
  4. ^ 『Discover Japan』(2012年8月号)42-43頁より
  5. ^ 崎谷満『新日本人の起源』勉誠出版、2009年、P45
  6. ^ 『白保竿根田原洞穴:旧石器人骨からDNA…国内で最古』”. 毎日新聞 (2013年12月2日). 2013年12月2日閲覧。
  7. ^ Noriyuki Fuku, Kyong Soo Park, Yoshiji Yamada et al., "Mitochondrial Haplogroup N9a Confers Resistance against Type 2 Diabetes in Asians", Am. J. Hum. Genet. 2007; 80:407–415. DOI: 10.1086/512202
  8. ^ Tanaka Masashi, Cabrera Vicente M., González Ana M. et al., Larruga JM, Takeyasu T, Fuku N, Guo LJ, Hirose R et al. (2004). “Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan”. Genome Research 14 (10A): 1832–1850. doi:10.1101/gr.2286304. PMC 524407. PMID 15466285. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC524407/. 
  9. ^ Jin H-J, Tyler-Smith C, and Kim W (2009), "The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers. PLoS ONE 4(1): e4210.doi:10.1371/journal.pone.0004210
  10. ^ a b c d e f g h i j k Yu-Chun Li, Wei-Jian Ye, Chuan-Gui Jiang, Zhen Zeng, Jiao-Yang Tian, Li-Qin Yang, Kai-Jun Liu, and Qing-Peng Kong, "River Valleys Shaped the Maternal Genetic Landscape of Han Chinese," Molecular Biology and Evolution, Volume 36, Issue 8, August 2019, Pages 1643–1652, https://doi.org/10.1093/molbev/msz072
  11. ^ van Oven et al., M; Kayser, M (2009). “Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation”. Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. 
  12. ^ a b c d e f g h i j k l m n Yamamoto, K., Sakaue, S., Matsuda, K. et al. "Genetic and phenotypic landscape of the mitochondrial genome in the Japanese population." Commun Biol 3, 104 (2020). https://doi.org/10.1038/s42003-020-0812-9
  13. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae YFullによるmtDNAハプログループM7aの系統樹

ヒトミトコンドリアDNAハプログループ系統樹

  ミトコンドリア・イブ (L)    
L0 L1 L5 L2 L6 L4 L3  
  M   N  
M7   M8   M9   D G Q N1   N2   N9   A O S X   R  
M7a C Z E I W Y R0   R9   B JT P  U
HV F J T K
H V
Prefix: a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9

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