노선 명칭상은 가미쿠마모토역이 기점이 되어 있지만, 운행 계통은 후지사키구마에-기타쿠마모토-미요시간, 가미쿠마모토-기타쿠마모토간이라고 할 수 있어 미요시 방면에의 열차는 후지사키 선의 후지사키구마에 역을 터미널로 하고 있다. 후지사키구마에-미요시간은 혼잡시 15분 간격, 한산시 30분 간격, 가미쿠마모토-기타쿠마모토간은 종일 30분 간격으로 운행되고 있다.
폐지 구간인 미요시-기쿠치간에 대해서는, 폐지 직전에 혼잡시 대개 30분 간격, 한산시 대개 1시간 간격의 운행이었다.
2001년 2월 개정 시점의 막차는 후지사키구마에-미요시간, 가미쿠마모토-기타쿠마모토간이 20시대였지만, 2009년4월 1일부터 후지사키구마에-미요시간의 막차를 22시대, 가미쿠마모토-기타쿠마모토간의 막차를 21시대로 늦추었다(다만 휴일은 제외).
고시 시(구 기쿠치 군 니시고시 정)의 미요시 역부터, 기쿠치 시 와이후의 기쿠치 역까지의 13.5km는 모터라제이션의 진전에 의한 승객 감소 등을 배경으로 1986년2월 15일의 운행을 마지막으로 폐지되었다. 운행 마지막 날은 전선으로 무료 승차가 실시되어 이별을 아쉬워하는 많은 승객으로 떠들썩했다.
폐지 구간 각 역의 상황은 다음과 같다.
미요시 역:현재의 종점. 이전에는 교차 설비가 있었지만 부분 폐지 후 철거되었다.
오이케 역:역 앞은 버스 맞이방이 있다. 이 구간까지는 후술과 같이 노선 부활 계획이 있어, 지금도 구마모토 전철이 부지를 소유하고 있다.