1889년 4월 1일 - 정촌제 시행으로 현재의 시역에 구마군 히토요시정, 니시세촌, 나카하라촌, 아이다촌, 오촌이 성립하였다.
1933년 4월 1일 - 히토요시정이 오촌을 편입하였다.
1942년 2월 11일 - 히토요시정·니시세촌·나카하라촌·아이다촌이 대등 합병해 히토요시시가 성립하였다.
지리
구마모토현 남부에 있고 구마모토시에서 직선 거리로 남쪽으로 약 70km 떨어진 곳에 위치한다. 북부와 남부는 규슈 산지의 일부를 이루는 산지이다. 남부는 해발 1,000m급 산지로 미야자키현에비노시와 가고시마현이사시와 접한다. 중심부는 히토요시 분지의 서단으로 구마강이 동쪽에서 서쪽으로 가로지른다. 시내에서는 마에강·야마다강·가노메강 등 다수의 지류가 구마강으로 흘러든다.
중심부는 옛 성시(조카마치)의 상점가가 남아 있어 "작은 교토"(小京都)로 불린다.
기후
내륙 분지이기 때문에 연교차가 현저하고 여름철은 최고 기온 30℃ 이상에 이르는 폭염일이 70~80일 있고 겨울철은 최저 기온이 영하가 되는 한파일이 50일 정도 있다. 연평균 강수량은 2,500~3,000mm이다.
분지에는 큰 강이 있고 지류도 많은 지형 때문에 겨울에 맑은 날의 아침은 거의 100% 짙은 안개가 발생한다. 그 빈도는 안개 발생일수로 매년 일본 제일을 다툴 정도인데 이 안개가 고속도로의 속도 규제 등을 낳기도 한다. 발생한 안개도 지형적으로 거의 유출되지 않기 때문에 정오가 다 될 때까지 남아 있는 날도 드물지 않다. 연중 비가 많이 와 여름에 습도가 높고 겨울도 안개의 영향으로 습도가 별로 낮지 않다.