После окончания карьеры возглавил клуб «Мирандела», в котором доигрывал последние годы карьеры игрока[1].
4 июля 2023 года Боржеш стал главным тренером «Морейренсе», который вернулся в высшую лигу[2]. По итогам сезона, «Морейренсе» занял 6 место в чемпионате[3].
28 мая 2024 года «Витория» подписала контракт с Боржешем на замену уволенному Руй Кунье[4].
26 декабря 2024 года лиссабонский «Спортинг» выкупил у «Витории» Боржеша за 4,1 миллион евро[5][6]. Сразу же в первом сезоне он выиграл с лиссабонской командой чемпионат страны[7], а также кубок страны[англ.][8], опередив в обоих турнирах «Бенфику».