Находясь у истоков создания «Партии перемен» — бывшая партия «Гражданская инициатива», Вихарева входила в состав политического совета московского отделения «Партии перемен»[6]. На высшие посты партии были назначены Дмитрий Гудков и Ксения Собчак[7][8].
В 2018 году вела работу в команде оппозиционного политика Дмитрия и Геннадия Гудковых, после чего организовала и модерировала партийный лекторий, объединяющий людей демократических взглядов и лидеров общественных мнений — журналистов, философов, публицистов, политиков, политологов, социологов, правозащитников[9]. В партийном лектории выступили Виктор Шендерович[10], Андрей Кураев[11], Юрий Кобаладзе, Алексей Кондауров, Геннадий Гудков[12], Марк Фейгин[13], Лев Рубинштейн[14], Станислав Белковский[15], Алексей Венедиктов[16], Евгений Шестаков, Екатерина Шульман[17], Валерий Соловей[18], Ирина Прохорова[19], Евгения Альбац[20], Дмитрий Гудков, Николай Карлович Сванидзе[21], Наталья Зубаревич[22], Леонид Гозман[23], Дмитрий Орешкин с целью предоставления объективной информации об устройстве различных социо-экономических процессов[24].
В августе 2019 года власти согласовали проведение массового мероприятия на проспекте Сахарова. Вихарева была ведущей митинга. В 2019 году она была одной из организаторов митинга на проспекте Сахарова состоявшегося 10 августа 2019 года[25]. Митинг «Вернём себе право на выбор» 10 августа 2019 года, по оценкам Белого счётчика, собрал до 60 тысяч человек и стал крупнейшим с 2011 года[26]. Все организаторы были вызваны на беседу в полицию накануне, несмотря на это, митинг состоялся в назначенный день[27]. Помимо Эльвиры Вихаревой, в организации акции участвовали муниципальные депутаты: Илья Азар, Денис Шендерович, Андрей Морев, Елена Русакова, Елена Филина, а также член «Открытой России» Татьяна Усманова, активист Сергей Рахновский и член «Солидарности» Надежда Митюшкина. Организаторы митинга «Вернём себе право на выбор», прошедшего 10 августа 2019 года, передали резолюцию в приемную президента России. В резолюции требовалось допустить оппозиционных политиков к выборам или отменить их, прекратить дела, возбужденные после акций 14 июля 2019 года, 27 июля 2019 года и 3 августа 2019 года, и отменить муниципальный фильтр на осенних выборах. Также выдвигалось требование привлечь к ответственности силовиков, избивавших протестующих, и запретить переброску сил МВД и Росгвардии из других регионов. Документ передали депутаты Елена Филина, Андрей Морев и Елена Русакова, а подписали документ также Илья Азар и Эльвира Вихарева[28].
В 2019 году возглавила предвыборный штаб Геннадия Гудкова на выборах в Московскую городскую думу. Власти отказали в регистрации политика, после чего Вихарева заявила, что подала уведомление на проведение митинга и шествия в Москве 14 сентября 2019 года с целью допуска независимых оппозиционных кандидатов[29][30]. В том же месяце трижды пыталась организовать митинги на том же месте, но эти планы не получили согласования[31]. 19 сентября 2019 года полиция вынесла Вихаревой предостережение о незаконности проведения несогласованных акций[32].
C марта 2020 года Вихарева стала вести собственный YouTube-канал общественно-политической тематики[33].
31 мая 2022 заявила о намерении участвовать в выборах в муниципальные депутаты по району Якиманка. 27 июля 2022 года Замоскворецкий суд снял кандидата Эльвиру Вихареву с выборов в округе Якиманка[38]. После этого на двери политиков Эльвиры Вихаревой и Нодари Хананашвили повесили листовки с их фото и надписью «Поддерживает украинских нацистов»[39]. В октябре 2022 года Эльвира Вихарева, несмотря на угрозы и давление, продолжила обходить дома в своем районе на севере Москвы с предложением помочь в решении различных социальных проблем[40].
24 марта 2023 года выступала на CNN с Эрин Бёрнетт после предположительного отравления в России[41]. В её крови были обнаружены следы токсичного дихромата калия, и она начала испытывать первые болезненные симптомы в ноябре 2022 года, которые усилились в декабре 2022 и феврале 2023 года. Симптомы включали сильные боли в животе, учащённое сердцебиение, онемение конечностей, мышечные спазмы, обмороки и выпадение волос[42][43].
Минобороны России в ответ на вопрос активистки Эльвиры Вихаревой, почему власти не издали указ об окончании мобилизации, заявило, что отмена указа может привести к нарушению прав мобилизованных[45]. Ответ министерства она опубликовала в соцсетях[46][47].
22 марта 2024 года совместно с другими «иноагентами», телеведущей Татьяной Лазаревой, журналистом Сергеем Маркеловым, активисткой Дарьей Серенко и экономистом Владиславом Иноземцевым, Эльвира Вихарева выступила с инициативой выдвинуть свои кандидатуры на сентябрьских выборах в Мосгордуму[48]. Предполагалось, что в этой кампании примут участие 45 «иноагентов», по числу избирательных округов в Москве. Оппозиционеры намеревались таким образом показать несогласие с политической системой, создавая дискомфорт «тем, кто наносит непоправимый урон стране». Государственная дума незамедлительно отреагировала на эту инициативу. Сразу в трёх чтениях 6 мая был принят проект поправок, запрещающий иностранным агентам и Вихаревой в частности выдвигать свои кандидатуры[49]. 15 мая 2024 года Владимир Путин подписал закон, запрещающий иноагентам участвовать в выборах всех уровней, а также выступать наблюдателями и доверенными лицами кандидатов[50].
