18 октября 1891 — Флаг-офицер берегового штаба старшего флагмана 1-й флотской дивизии.
14 марта 1892 — Флаг-офицер штаба командующего Практической эскадрой Балтийского моря.
12 марта 1893 — Старший флаг-офицер при начальнике Эскадры Атлантического океана.
18 октября 1893 — Флаг-офицер берегового штаба старшего флагмана 1-й флотской дивизии.
1894—1895 — Старший офицер минного крейсера «Лейтенант Ильин».
1895—1896 — Старший офицер мореходной канонерской лодки «Грозящий». 6 декабря 1895 года за отличие Клапье де Колонг был произведён в чин капитана 2-го ранга.
Штаб превратился в средостение между флотом и командующим, стал его походной канцелярией. В особенности пришлось унижаться перед ним флаг-капитану, или, выражаясь, по-сухопутному, начальнику штаба, капитану 1-го ранга Клапье-де-Колонгу. По смыслу военно-морского устава после командующего он являлся первым лицом, на эскадре. На обязанности флаг-капитана лежало проводить в жизнь все идеи своего начальника, а для этого он должен быть знаком с его оперативными планами. Но что сделал с ним Рожественский? Он не признавал в нем своего заместителя, он низвел его до степени раболепствующего лакея.
14-15 мая 1905 — Участвовал в Цусимском сражении на борту флагманского эскадренного броненосца «Князь Суворов» и миноносца «Бедовый».
15 мая 1905 — Сдался в плен вместе с командующим и чинами штаба.
26 июня 1906 — Решением военно-морского суда в Кронштадте признан виновным в сдаче врагу без боя.
Капитан 1 ранга Клапье де Колонг, полковник Филипповский и капитан 2 ранга Баранов признаны виновными в том, что, находясь на поврежденном миноносце «Буйный», умыслили, в случае встречи с неприятелем, сдаться без боя и, перейдя на миноносец «Бедовый» вполне способный к бою, спустили флаг … все трое … подлежат смертной казни через расстреляние.
2 октября 1906 года Константин Клапье де Колонг взамен определённого наказания приговорён к исключению из службы без лишения чинов.
Всемилостивейше повелено: согласно ходатайства особого присутствия Кронштадтского военно-морского суда, осужден по делу о сдаче 15.05.05. неприятелю, без боя, миноносца «БЕДОВЫЙ», взамен определенного ему наказания, к исключению из службы без лишения чинов, с законными последствиями сего наказания
6 мая 1909 года всемилостливейше повелено считать Клапье де Колонга уволенным от службы.
Проживал в Эстляндии в собственном имении «Онтика» на берегу Нарвского залива. После революции, оставшись без каких-либо средств, организовал из бывших офицеров русского флота рыбацкую артель. В конце 30-х годов выехал на жительство в Германию. По некоторым данным умер от разрыва сердца и был похоронен в Бойценбурге.
ЦусимаАрхивная копия от 23 мая 2015 на Wayback Machine // С эскадрой адмирала Рожественского. Сборник статей, посвященных 25-летию похода II-й эскадры Тихого Океана.
