В 1950 году устроился во Всесоюзный институт геологии (ВСЕГЕИ), где до 1953 года занимал должность библиографа, а потом — начальника справочно-библиографического отдела. В 1957 году переведен на должность младшего научного сотрудника сектора тюркологии и монголистики Ленинградского отделения Института востоковедения АН СССР. С 1960 по 1962 годы заведовал библиотекой ЛО ИВАН СССР[1].
В 1962 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Древнетюркские рунические памятники как источник по истории Средней Азии» (научные руководители — А. Н. Бернштам и С. Е. Малов). В 1963 году стал заведующим сектором тюркологии и монголистики ЛО ИВАН СССР (впоследствии СПб ФИВ РАН) и занимал данную должность до 2013 года. Принимал активное участие в археологических экспедициях[1].
С 1964 года — сотрудник сектора. C 1969 года — преподаватель кафедры Тюркской филологии ЛГУ, с 1995 — преподаватель кафедры Центральной Азии и Кавказа СПбГУ. С 1992 года — профессор[1].
С 2013 года был ведущим сотрудником сектора Центральной Азии и отделом Центральной и Южной Азии ИВР РАН. В 2014 году вышел на пенсию. Ушёл из жизни 21 сентября того же года[1].
В 2005 году награждён Золотой медалью Постоянной международной алтаистической конференции (Gold Medal of the Permanent International Altaistic Conference).
Основные публикации
Кляшторный С. Г. Древнетюркские рунические памятники как источник по истории Средней Азии / С. Г. Кляшторный. — М., 1964.
Кляшторный С. Г., Колесников А. А. Восточный Туркестан глазами русских путешественников (вторая половина XIX в.) / С. Г. Кляшторный, А. А. Колесников. — Алма-Ата: Издательство «Наука» Казахской ССР, 1988.
Кляшторный С. Г., Колесников А. А., Басханов М. К. Восточный Туркестан глазами европейских путешественников / С. Г. Кляшторный, А. А. Колесников, М. К. Басханов; Институт уйгуроведения АН КазССР. — Алма-Ата: Гылым, 1991. — 184, [16] с.
Кляшторный С. Г., Султанов Т. И. Казахстан: Летопись трёх тысячелетий / С. Г. Кляшторный, Т. И. Султанов. — Алма-Ата: Рауан, 1992. — 376 с.
Кляшторный С. Г. История Центральной Азии и памятники рунического письма / С. Г. Кляшторный; Филологический факультет СПбГУ. — СПб., 2003. — 560 с. — (Азиатика). — 1000 экз. — ISBN 5-8465-0106-0. (в пер.)
Кляшторный С. Г., Султанов Т. И. Государства и народы Евразийских степей: Древность и средневековье / С. Г. Кляшторный, Т. И. Султанов. — СПб.: Петербургское востоковедение, 2004. — 368 с. — (Orientalia). — 1500 экз. — ISBN 5-85803-255-9. (в пер.)
Кляшторный С. Г. Памятники древнетюркской письменности и этнокультурная история Центральной Азии / С. Г. Кляшторный; Институт востоковедения РАН, Санкт-Петербург. филиал. — М.: Наука, 2006. — 592 с. — (Восток: Общество, культура, религия). — 1200 экз. — ISBN 5-02-027060-1. (в пер.)
Кляшторный С. Г., Султанов Т. И. Государства и народы Евразийских степей: От древности к Новому времени / С. Г. Кляшторный, Т. И. Султанов. — СПб.: Петербургское востоковедение, 2009. — 432 с. — (Orientalia). — 1000 экз. — ISBN 978-5-85803-411-7.
Кляшторный С. Г. Рунические памятники Уйгурского каганата и история евразийских степей / С. Г. Кляшторный. — СПб.: Петербургское востоковедение, 2010. — 352 с. — 500 экз. — ISBN 978-5-85803-433-9. (в пер.)
