Компьютерный синтез

Компьютерный синтез (англ. Computer Assisted Synthesis Design) — область хемоинформатики, охватывающая методы, алгоритмы и реализующие их компьютерные программы, оказывающие помощь химику в планировании синтеза органических соединений, прогнозировании результатов и дизайне новых типов органических реакций на основе обобщения данных по известным синтетическим превращениям^[1]. В более узком смысле, под компьютерным синтезом понимается проведение с помощью компьютера ретросинтетического анализа с целью выработки оптимальной схемы синтеза заданного химического соединения.

Компьютерные программы, реализующие эмпирический подход к компьютерному синтезу:

• LHASA (Logic and Heuristic Applied to Synthetic Analysis)
• SECS (Simulation and Evaluation of Chemical Synthesis)
• REACT (REACTion path synthesis program for the petrochemical industry)
• SynGen (SYNthesis GENeration)
• SYNCHEM (SYNthetic CHEMistry)
• WODCA (Workbench for the Organization of Data for Chemical Applications) ^[2]
• OSET (Organic Synthesis Exploration Tool)

Компьютерные программы, реализующие неэмпирический подход к компьютерному синтезу:

• EROS (Elaboration of Reactions for Organic Synthesis)
• TOSCA (Topological Synthesis design by Computer Application)
• FLAMINCOES (Formal-Logical Approach to Molecular Interconversions)
• COMPASS (COMputer-ASsisted organic Synthesis)

Синтез "вперёд" предсказывает результат органических реакций для заданных исходных веществ, реагентов и условий проведения реакций. Предсказания даются на основе подробного рассмотрения механизмов реакций.

Компьютерные программы, реализующие синтез "вперёд":

• CAMEO (Computer Assisted Mechanistic Evaluation of Organic reactions)
• ICAR

Компьютерные программы, предназначенные для дизайна новых типов органических реакций путём формального перечисления различных способов перераспределения связей:

• IGOR (Interactive Generation of Organic Reactions)
• SYMBEQ (SYMBolic EQuations)^[3]
• ARGENT

1. ↑ R. Barone and M. Chanon. "Computer-Assisted Synthesis Design (CASD)". In “Chemoinformatics. From data to knowledge”, J. Gasteiger, T. Engel Eds, J. Wiley, 2003, pp. 1428-1456
2. ↑ M. Phoetner and M. Sitzmann. "Computer-Assisted Synthesis Design by WODCA (CASD)" In “Chemoinformatics. From data to knowledge”, J. Gasteiger, T. Engel Eds, J. Wiley, 2003, pp. 1457-1507
3. ↑ N. S. Zefirov, I. I. Baskin, V. A. Palyulin. SYMBEQ Program and Its Application in Computer-Assisted Reaction Design (англ.) // J. Chem. Inf. Comput. Sci. : journal. — 1994. — Vol. 34, no. 4. — P. 994—999. — doi:10.1021/ci00020a038.

• Статья КОМПЬЮТЕРНЫЙ СИНТЕЗ (ЗЕФИРОВ Н. С. , 1997)