С 1902 года участвовал с сестрой Верой в экспедициях по Южному Уралу, изучал растительность края. Результаты исследований обобщил и опубликовал. Проявлял интерес к этнографии и фольклористике, в 1904 году опубликовал собранные им в посёлке Сосновка Челябинского уезда казачьи песни и духовные стихи. В 1905 году Московским обществом любителей естествознания, антропологии и этнографии командирован для исследания озёр Зауралья.
Окончив Московское реальное училище в 1905 году, поступил поступил на химическое отделение Московского высшего технического института. В 1908 году перевёлся на естественное отделение физико-математического факультета Императорского Московского университета, которое окончил в 1914 году по специальности «геология». В 1916 году получил диплом 1-й степени. В 1909 году исследовал бассейн Аргуни.
Всего опубликовал около 100 работ, посвященных различным вопросам физической и ботанической географии и вопросам связей в развитии формы и растительности с эволюцией ландшафтов в их целом.
Крашенинников И. М. Хороводные и плясовые песни казачьего посёлка Сосновка Челябинского уезда Оренбургской губернии. — М., 1904. — 17 с.[4]
Ипп. М.и В. М. Крашенинниковы. Сосновые боры Челябинского уезда. — СПб.: типо.-лит. «Герольд», 1905. — 10 с.[5]
Крашенинниковъ И. М. Къ характеристикѣ ландшафтовъ Восточного Забайкалья. — М.: типо.-лит. т-ва И. Н. Кушнеревъ и Кo, 1913. — 105 с.[6]
Крашенинников И. М. К тектонике Челябинского гранитного массива. — Юрьев: тип. К. Маттисена, 1914. — 28 с.[7]
Крашенинников И. М. Киргизские степи, как объект ботанико-географического анализа и синтеза. — М., 1923. — 31 с.[8]
Крашенинников И. М. Растительный покров Киргизской республики. — Оренбург, 1925. — 106 с.[9]
Крашенинников И. М., Ильин М. М. Геоботанический очерк горной части Стерлитамакского кантона Башкирской республики. — Л.: Башкирск. нар. ком. зем., 1926. — 56 с.[10]
Крашенинников И. М. Из истории развития ландшафтов Южного Урала. — Л.: Башкирский нар. ком. зем., тип. Главн. ботан. сада, 1927. — 28 с. — 1000 экз.[11]
Крашенинников И. М.Ч. 1 // Физикоггеографические районы Южного Урала. — М.—Л.: Изд-во Акад. наук СССР. Напеч. в Мск., 1939. — 110 с. — 750 экз.[12]
Опыт филогенетического анализа некоторых евразиатских групп рода Artemisia в связи с особенностями палеогеографии Евразии. 1946.
Крашенинников И. М. Географические работы. Урал и Приуралье — Сибирь и Средняя Азия / Сост., ред. и вступит. статья, с. 3—25, А. И. Соловьёва. — М.: Географгиз, 1951. — 600 с. — 5000 экз.[13]
Крашенинников И. М. Географические работы. Урал и Приуралье — Сибирь и Средняя Азия / Подготовка к изд. и вступит. статья, с. 3—24, чл.-кор. АПН РСФСР А. И. Соловьёва. — 2-е изд.. — М.: Географгиз, 1954. — 612 с. — 3000 экз.[14]
Роль и значение ангарского флористического центра в филогенетическом развитии основных евразиатских групп Польшей подрода Euartemisia. 1958.
Отец, Михаил Николаевич Крашенинников (1848, Челябинск — конец 1920-х, Харбин), русский купец, Городской голова Челябинска (1885—1888), купец 2-й гильдии (1905—1913), потомственный почётный гражданин (с 1913).
Сестра, Вера Михайловна (в замужестве Криштафович; 16 (28) августа 1887 года, Челябинск — ?), ботаник, переводчик научных трудов зарубежных ботаников, жила в Ленинграде.
Крашенинников, Ипполит Михайлович // Корзинка — Кукунор. — М. : Советская энциклопедия, 1953. — С. 296. — (Большая советская энциклопедия : [в 51 т.] / гл. ред. Б. А. Введенский ; 1949—1958, т. 23).
Боже. В. С. Летописцы земли уральской: материалы к истории челябинского краеведения / Центр ист.-культ. наследия г. Челябинска. — Челябинск, 1997. — С. 151. — 173 с.
Гуков, Г. В.Ипполит Михайлович Крашенинников // Чьё имя ты носишь, растение?. — Владивосток: Дальнаука, 2001. — С. 232—234. — 398 с.