Сретенская церковь. 2018 годТроицкая церковь. 2018 год
Первое упоминание о селе Микшино в писцовой книге 1545 года. В селе находились деревянная церковь Йокима и Анны, господский двор и 5 семей дворовых людей.
В 1768 году в село Микшино из села Знаменское Новоторжского уезда была перевезена деревянная Троицкая церковь.
В 1845 году построена каменная Троицкая церковь. В её приход входили ещё 9 карельских деревень (Сошники, Луги, Комариха, Гурилиха, Бабье, Колодово, Заболотье (Гокко), Прядчиха, Рычково).
В 1859 году в карельском казенном селе Микшино было 105 дворов, 577 жителей, православная церковь.
В 1871 году в селе была построена вторая каменная Сретенская церковь
В 1873 году открыта Микшинская земская школа (в 1887 году 98 учащихся, 61 мальчик, 37 девочек, из Микшина и соседних деревень Рычково, Бабье, Прядиха, Доманиха).
В 1887 году село Микшино одноименной волости и прихода Бежецкого уезда, имеет 122 двора, 124 семьи, 608 жителей.
В конце XIX века — в начале XX века село славилось торговлей, было много купцов и предпринимателей. Это Семеновы, Кузнецовы, Степановы, Мельниковы, Фомины и другие. Купец I гильдии Юрасов А. Н., карел по национальности, имел доход свыше 1 миллиона рублей. Он скупал лен со всей округи и зимой отправлял по 300—400 подвод в Бежецк.
В начале XX века в селе действовали 6 магазинов, 5 чайных, 2 колбасных цеха, 3 пекарни, маслосырзавод, ткацко-вязальная фабрика, льномаслобойня, мельница, крупорушка. Вблизи села — кирпичный и свечной заводы.
В 1937 году большой пожар уничтожил большую часть строений села.
В годы Великой Отечественной войны 150 жителей села не вернулись с фронта, многие женщины и подростки направлялись на строительство оборонительных сооружений.