В 1953 году защитил кандидатскую диссертацию «Борьба за укрепление тыла Красной Армии и мобилизацию его материальных ресурсов на оборону в период иностранной интервенции и гражданской войны в 1918—1920 гг.»[2][5].
В 1971 году защитил докторскую диссертацию на тему «Партийное руководство социалистической индустриализации Марийской АССР (1926 — июнь 1941 гг.)»[6].
Известен как исследователь истории Марийского края первой половины XX века. Является автором более 60 научных работ, среди них: «Марийский край в годы гражданской войны»[7], «Солдаты революции»[8], «Осуществление ленинской политики индустриализации в Марийской АССР»[9] и др[1]. Занимался и исследованием исторических судеб известных людей Марийского края (С. П. Данилов, Т. П. Кочетов, В. А. Баринов, А. Г. Смирнов, А. Р. Романов и др.), историей исторической науки Республики Марий Эл.
Был инициатором издания учебного пособия по истории Марийского края для школ и вузов. В соавторстве с другими учёными подготовил и издал пособие по истории родного края для учащихся старших классов. Является одним из авторов учебного пособия «История Марийской АССР» (6 изданий). Был руководителем авторского коллектива, научным редактором «Очерков истории Марийской организации КПСС»[1].
Пашуков В. Ф. Борьба за укрепление тыла Красной Армии и мобилизацию его материальных ресурсов на оборону в период иностранной военной интервенции и Гражданской войны, 1918—1920 гг.: по материалам Марийского края: диссертация ... кандидата исторических наук: 07.00.00. — Казань, 1953. — 460 с.
Пашуков В. Ф. Марийский край в годы Гражданской войны. — Йошкар-Ола, 1965.
Пашуков В. Ф. Солдаты революции: (Очерки о сынах земли марийской - участниках борьбы за власть Советов). — Йошкар-Ола: Маркнигоиздат, 1967. — 104 с.: ил.
Пашуков В. Ф., Сануков К. Н. История Марийской АССР. — Йошкар-Ола. 1968.
Пашуков В. Ф. Осуществление ленинской политики индустриализации в Марийской АССР. 1928-1941 гг. — Йошкар-Ола: Маркнигоиздат, 1969. — 312 с.
Пашуков В. Ф. Партийное руководство социалистической индустриализации Марийской АССР 1926 г. — июнь 1941 г.: Автореферат дис. на соискание ученой степени доктора исторических наук. (570) / Моск. гос. пед. ин-т им. В. И. Ленина. - Москва: [б. и.], 1971. — 50 с.
Пашуков В. Ф. История Марийской ССР: учебное пособие для учащихся IX—X классов / В. Ф. Пашуков, С. П. Захарова. — Изд. 5-е, перераб. — Йошкар-Ола: Марийское книжное издательство, 1982. — 76, [2] c.: ил.
С 2004 года имя учёного-историка В. Ф. Пашукова (вместе с языковедом Н. Т. Пенгитовым и историком В. М. Тарасовой) увековечено на мемориальной доске на доме № 42 по улице Кремлёвской в г. Йошкар-Оле, где он жил[1][11].
С 1993 года в Марийском государственном университете проводятся Пашуковские чтения[1][2][12].
Айплатов Г. Н., Сануков К. Н. Профессор В. Ф. Пашуков и его вклад в развитие исторической науки // Марийский археографический вестник. — 1998. — № 8.
Василий Фёдорович Пашуков: Материалы к биобиблиографии учёных. Серия «Исследователи истории Марийского края». Выпуск 5. — Йошкар-Ола, 2001.
Учёные Марийского государственного университета / [сост.: Г. Н. Айплатов, А. А. Иванов; под. общ. ред. А. Г. Иванова]. — Йошкар-Ола: Мар. гос. ун-т, 2002. — 291 c.: ил.
Сануков К. Н.Пашуков Василий Фёдорович // Марийская биографическая энциклопедия / Авт.-сост. В. А. Мочаев. — Йошкар-Ола: Марийский биографический центр, 2007. — С. 275. — 2032 экз. — ISBN 5-87898-357-0.
Пашуков Василий Фёдорович: биобиблиогр. указ. / [сост.: Г. Н. Айплатов, Е. В. Ускова; науч. ред., отв. за вып. В. В. Изыкин]; МарГУ, Науч. б-ка. — Йошкар-Ола: МарГУ, 2008. — 38 c.: ил. — (Материалы к биобиблиографии ученых МарГУ; вып. 13).
Иванов А. А., Иванов А. Г. Историки Марий Эл XX — начала XXI века: биобиблиографический справочник / А. А. Иванов, А. Г. Иванов; М-во образования и науки Российской Федерации, ФГБОУ ВПО «Марийский гос. ун-т». — Йошкар-Ола: Марийский гос. ун-т, 2013. — 215 с.; ISBN 978-5-94808-785-6.
Сануков К. Н.Пашуков Василий Фёдорович // Марийская биографическая энциклопедия / Авт.-сост. В. А. Мочаев. — 2-е изд. — Йошкар-Ола: Марийский биографический центр, 2017. — С. 333. — 606 с. — 1500 экз. — ISBN 978-5-905314-35-3.
Востриков В. История появления в Йошкар-Оле первого марийского вуза — пединститута // Марийская правда. — 2018. — 5 октября.