В XIX веке границы между провинциями Аргентины не везде были чётко определены на местности. В 1879 году Херонимо Сегундо Руфино приобрёл в этом месте землю у провинции Кордова, однако через некоторое время верховный суд страны принял решение, что эта территория относится к провинции Санта-Фе, и в 1883 году ему пришлось перерегистрировать сделку там. Тем временем через эти земли была проведена железная дорога и началось их стихийное заселение. Чтобы упорядочить положение, был составлен план развития города, и в 1889 году был официально основан населённый пункт, получивший название Руфино в честь землевладельца. В 1929 году был образован муниципалитет.
Известные уроженцы
Гильермо Кориа (род. 1982) — теннисист, третья ракетка мира (май 2004).