В 1986—1993 годах закончил Цхинвальский педагогический институт (в 1987 году был призван в ВС СССР, служил на территории Литовской ССР). По специальности — преподаватель математики и физики средней школы.
В 1993 году начал работать начальником финансового отдела министерства обороны непризнанной Республики Южная Осетия (РЮО). С мая 1996 года министр РЮО по чрезвычайным ситуациям и обороне. В 1998—2001 годах также вице-премьер правительства. В июле-декабре 2001 года премьер-министр РЮО. Высказывался за реинтеграцию с Грузией.
Что наша независимость? Уже 11 лет, как её провозгласили, 9 лет, как с грузинами воевали, а не смогли ни с Северной Осетией объединиться, ни экономических благ получить. Давайте честно: без экономики Грузии нам не выжить.
В декабре 2001 года возглавляемое Санакоевым правительство Южной Осетии, согласно Конституции Южной Осетии, сложило свои полномочия в связи с выборами нового президента[8], которым был избран Эдуард Кокойты. После отставки Санакоев жил в Южной Осетии, затем в Северной Осетии — Алании.
Союз национального спасения Южной Осетии
В сентябре 2006 года брат Дмитрия Санакоева[9][10] Владимир основал «Союз национального спасения Южной Осетии» (впоследствии — движение «Народ Южной Осетии за мир»). В его состав вошли также Майя Чигоева-Цабошвили (глава грузино-осетинского объединения «Ибер-Ирон»), Георгий Чигоев, Теймураз Джерапов, Джемал Каркусов (бывший министр внутренних дел непризнанной РЮО), Ян Каркусов и Уразмаг Каркусов.
12 ноября 2006 года «Союз национального спасения» организовал в неподконтрольных югоосетинским властям сёлах Южной Осетии президентские выборы, в которых участвовали пять кандидатов, в основном представлявших сам Союз (это были Майя Чигоева-Цабошвили, Георгий Чигоев, Теймураз Джерагоев, Тамара Чараева и Дмитрий Санакоев). Санакоев получил около 80 % голосов.
Курс будущего правительства уже определён народом, избравшим нас. Я рад, что избиратели, в том числе и грузинская часть населения Южной Осетии, таким образом, участвовали в определении будущего государственного устройства Южной Осетии. Это в первую очередь установление мира в зоне конфликта. Именно с этого мы и начнём разговор с властями Грузии, а также с представителями мирового сообщества, в том числе России.
Инаугурация прошла в южноосетинском этнически-грузинском селе Курта 1 декабря 2006 года. Санакоев принёс клятву на действующей конституции Южной Осетии, в которой записано, что Южная Осетия является независимым государством, произнеся её на грузинском и осетинском языках. В частности, он пообещал «служить интересам осетинского народа и установлению мира между грузинами и осетинами». Официально Грузия не признала выборы и инаугурацию[11]. По поводу этого мероприятия Марина Перевозкина в журнале «Профиль» утверждала: «лидер осетинского землячества Грузии, который был членом „альтернативного“ ЦИК, „избравшего“ Южной Осетии „альтернативного“ президента Санакоева, не скрывал в беседе со мной, что его вынудили принять участие в этом мероприятии сотрудники Министерства полиции и общественной безопасности, продержавшие его у себя пять часов».[12]
Руководитель администрации Временной административно-территориальной единицы на территории бывшей Юго-Осетинской автономной области (2007—2022)
Указом президента ГрузииМихаила Саакашвили от 10 мая 2007 года в Грузии была создана временная административно-территориальная единица на территории бывшей Юго-Осетинской автономной области, Дмитрий Санакоев был назначен руководителем её администрации (неофициально — администрации Южной Осетии)[13][14][15][16][6][17].
Бывший министр обороны Грузии Ираклий Окруашвили назвал Санакоева «карикатурной персоной» и «абсолютно неавторитетным среди осетинского народа», считая его появление в политике единственным результатом попыток Михаила Саакашвили «объединения страны»[18].
В сентябре 2009 года принимал участие в переговорах о безопасности Закавказского региона в Женеве в составе грузинской делегации[19], в ноябре встречался с белорусскими парламентариями[20].
11 октября 2022 года Дмитрий Санакоев сложил с себя полномочия руководителя администрации Временной административно-территориальной единицы на территории бывшей Юго-Осетинской автономной области[21].
Покушения
3 июля 2008 года на Дмитрия Санакоева было совершено покушение: по пути из Курта в Батуми для участия в международной конференции машина его кортежа подорвалась на мине. Были тяжело ранены трое охранников Санакоева, он сам не пострадал.
20 декабря 2008 года информационное агентство REGNUM заявило об убийстве Санакоева[9]. 21 декабря МВД Грузии опровергло эту информацию[22].
Альтернативный лидер Южной Осетии Дмитрий Санакоев назначен руководителем Временной административно-территориальной единицы Цхинвальского региона. Указ об этом подписал президент Грузии Михаил Саакашвили до отправления с визитом в Польшу.
В апреле 2007 года парламент Грузии принял закон «О создании соответствующих условий для урегулирования конфликта в бывшей Юго-Осетинской автономной области», который заложил основу создания в Цхинвальском регионе временной территориально-административной единицы и её администрации. Среди основных функций администрации временной административно-территориальной единицы было: * Осуществление государственного правления в рамках делегированных полномочий; * Переговоры по определению статуса бывшей Юго-Осетинской автономной области; * Сотрудничество с государственными органами Грузии и международными организациями, для проведения соответствующих мероприятий в рамках своей компетенции, с целью мирного урегулирования конфликта; * Создание и разработка соответствующих планов и проектов для мирного урегулирования конфликта и обеспечение участия местного населения в процессе их подготовки; * Содействие населению проживающему на территории бывшей Юго-Осетинской автономной области в восстановлении доверия; * Координация осуществления международных и гуманитарных проектов; * Содействие в реабилитации местной инфраструктуры. На основании этого закона, для достижения соглашения, руководство Грузии приступило к консультациям с представителями различных интерес-групп местного населения Цхинвальского региона. С учётом договорённостей достигнутых в процессе переговоров, распоряжением президента Грузии от 10 мая 2007 года (который затем был утверждён парламентом Грузии) была создана временная административно-территориальная единица и её администрация. Новую структуру возглавил один из бывших лидеров сепаратистского движения Дмитрий Санакоев.
«დროებითი ადმინისტრაციულ-ტერიტორიული ერთეულის შექმნის შესახებ» საქართველოს პარლამენტის 2007 წლის 8 მაისის #4735 დადგენილების 1-ლი პუნქტის შესაბამისად, განისაზღვრა: «ყოფილი სამხრეთ ოსეთის ავტონომიური ოლქის ტერიტორიაზე შეიქმნას დროებითი ადმინისტრაციულ-ტერიტორიული ერთეული». საქართველოს პრეზიდენტის 2007 წლის 10 მაისის #297 ბრძანებულებით ერთეულის ტერიტორიაზე სახელმწიფო მმართველობის განხორციელების უფლებამოსილება მიენიჭა დიმიტრი სანაკოევს. პრეზიდენტის #296 ბრძანებულებით «ყოფილი სამხრეთ ოსეთის ავტონომიური ოლქის ტერიტორიაზე როებითი ადმინისტრაციულ-ტერიტორიული ერთეულის ადმინისტრაციის შექმნის, საქმიანობის წესისა და ფარგლების შესახებ» განისაზღვრა დროებითი ადმინისტრაციის ფუნქციები. ამავე უწყებას დაეკისრა «დროებითი ადმინისტრაციულ-ტერიტორიული ერთეულის ტერიტორიაზე კანონიერებისა და მართლწესრიგის დაცვის უზრუნველყოფა; ამ ტერიტორიაზე მცხოვრები პირებისა და ეთნიკური ჯგუფების უფლებებისა და თავისუფლებების, აგრეთვე მათი ინტერესების დაცვა» (მე-3 პუნქტის «გ» ქვეპუნქტი). ასევე, განისაზღვრა, რომ ადმინისტრაციის ხელმძღვანელი არის ადგილობრივი პოლიტიკური ძალებისა და საზოგადოების წარმომადგენელი, რომელსაც ენიჭება დროებითი ადმინისტრაციულ-ტერიტორიული ერთეულის ტერიტორიაზე სახელმწიფო მმართველობის განხორციელების უფლებამოსილება.