Трепонемы

Трепонемы
Трепонемы
	;
Научная классификация
	Домен: Бактерии Тип: Spirochaetae Cavalier-Smith 2002 Класс: Spirochaetes Cavalier-Smith 2002 Порядок: Спирохеты Семейство: Spirochaetaceae Род: Трепонемы
Международное научное название
	Treponema (Schaudinn 1905) Abt, Göker and Klenk 2013
Синонимы
	Spironema Vuillemin 1905 non Klebs 1892 non Leger & Hesse 1922 non Rafinesque 1838 non Hochst. 1842 non Lindley 1840 non Meek 1864; Microspironema ; Stiles and Pfender 1905;
ITIS	958350
NCBI	157
EOL	83190

Трепонемы^[2] (лат. Treponema) — род извитых бактерий из семейства Spirochaetaceae порядка спирохет (Spirochaetales)^[3].

Патогенность

Возбудители трепонематозов человека^[4]^[5]:

Подвид или вид бактерий	Болезнь	Географическое распространение	Возраст заболевших	Путь заражения	Врождённые формы
Treponema pallidum subsp. pallidum	Сифилис	Повсеместно	Взрослые, подростки	Половой	Да
Treponema pallidum subsp. carateum	Пинта	Полупустыни с теплым климатом: Северная Америка	Дети, подростки	Контакт с кожей	Нет
Treponema pallidum subsp. endemicum	Беджель	Пустыни: Северная Африка, Ближний восток	Дети, подростки, взрослые	Контакт со слизистыми	Редко
Treponema pertenue	Фрамбезия	Тропики: Африка, Индонезия, Карибский бассейн	Дети	Контакт с кожей	Нет

Treponema paraluiscuniculi вызывает сифилис у кроликов^[6].

Филогения

На основе анализа 16s-рибосомной субъединицы РНК в проекте LTP (выпуск 123) построено филогенетическое дерево всех видов^[7].

T. caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013

T. stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013

T. isoptericolens Dröge et al. 2008

T. azotonutricium Graber et al. 2004

T. primitia Graber et al. 2004

T. zuelzerae (ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 emend. Abt, Göker & Klenk 2013

T. medium

T. m. bovis ♠ Evans et al. 2006

T. m. medium ♠ Umemoto et al. 1997

T. pedis Evans et al. 2009

T. denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993

T. putidum Wyss et al. 2004

T. lecithinolyticum Wyss et al. 1999

T. maltophilum Wyss et al. 1996

T. brennaborense Schrank et al. 1999

T. saccharophilum Paster and Canale-Parola 1986

T. berlinense Nordhoff et al. 2005

T. pectinovorum Smibert and Burmeister 1983

T. bryantii Stanton and Canale-Parola 1980

T. porcinum Nordhoff et al. 2005

T. succinifaciens Cwyk and Canale-Parola 1981

T. parvum Wyss et al. 2001

T. amylovorum Wyss et al. 1997

T. socranskii

T. s. paredis Smibert et al. 1984

T. s. buccale Smibert et al. 1984

T. s. socranskii Smibert et al. 1984

Таксономия

В настоящее время принята классификация на основе номенклатуры названий прокариотов (LPSN)^[8] и Национального центра биотехнологической информации (NBCI)^[9]:

?Candidatus Treponema suis Molbak et al. 2006
?Treponema calligyrum ♠ Noguchi
?Treponema carateum ♥ (pinta causing Treponema)
?Treponema minutum ♦ Dobell 1912
?Treponema pallidum ♦ (Schaudinn and Hoffmann 1905) Schaudinn 1905
- T. p. endemicum ♠ Smibert 1984 (bejel causing Treponema)
- T. p. pallidum ♠ (Schaudinn and Hoffmann 1905) Schaudinn 1905 (syphilis causing Treponema)
- T. p. pertenue ♠ Smibert 1984 (yaws causing Treponema)
?Treponema paraluisleporis ♠ Lumeij et al. 1994
?Treponema paraluiscuniculi ♦ (Jacobsthal 1920) Smibert 1974
?Treponema pertenue ♦ (Castellani 1905) Castellani & Chalmers 1910
?Treponema phagedenis ♠
- T. p. phagedenis ♠ (Noguchi 1912) Brumpt
- T. p. vaccae ♠ Evans et al. 2006
?Treponema refringens ♠ (Schaudinn and Hofmann 1905) Castellani and Chalmers
?Treponema vincentii ♠ Smibert 1984
?Treponema zioleckii ♠ Piknova et al. 2008
Treponema amylovorum Wyss et al. 1997
Treponema azotonutricium Graber et al. 2004
Treponema berlinense Nordhoff et al. 2005
Treponema brennaborense Schrank et al. 1999
Treponema bryantii Stanton and Canale-Parola 1980
Treponema caldarium (Pohlschroeder et al. 1995) Abt, Göker & Klenk 2013
Treponema denticola (ex Flügge 1886) Chan et al. 1993
Treponema isoptericolens Dröge et al. 2008
Treponema lecithinolyticum Wyss et al. 1999
Treponema maltophilum Wyss et al. 1996
Treponema medium ♦ Umemoto et al. 1997
- T. m. bovis ♠ Evans et al. 2006
- T. m. medium ♠ Umemoto et al. 1997
Treponema parvum Wyss et al. 2001
Treponema pectinovorum Smibert and Burmeister 1983
Treponema pedis Evans et al. 2009
Treponema porcinum Nordhoff et al. 2005
Treponema primitia Graber et al. 2004
Treponema putidum Wyss et al. 2004
Treponema saccharophilum Paster and Canale-Parola 1986
Treponema socranskii Smibert et al. 1984
- T. s. paredis Smibert et al. 1984
- T. s. buccale Smibert et al. 1984
- T. s. socranskii Smibert et al. 1984
Treponema stenostreptum (Zuelzer 1912) Abt, Göker & Klenk 2013
Treponema succinifaciens Cwyk and Canale-Parola 1981
Treponema zuelzerae (ex Veldkamp 1960) Canale-Parola 1980 emend. Abt, Göker & Klenk 2013

Примечания:

♦ Типовой штамм утерян или недоступен

♠ Штамм есть в NCBI, но отсутствует в LSPN

♥ Штамм не направлен в NCBI, но есть в списке LPSN

Примечания

↑ ¹ ² ³ Genus Treponema : [англ.] // LPSN. (Дата обращения: 17 сентября 2017).
↑ Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии : Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А. А. Воробьева, А. С. Быкова. — М. : Медицинское информационное агентство, 2003. — С. 78. — 236 с. — ISBN 5-89481-136-8.
↑ Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) : Version 2.0 : [англ.] // LPSN. — 2016. — 2 October.
↑ Медицинская и санитарная микробиология / А. А. Воробьев, Ю. С. Кривошеин, В. П. Широбоков. — М.: Академия, 2003. — С. 52. — ISBN 5-7695-1292-X.
↑ The endemic treponematoses (неопр.) // Microbes Infect.. — 2002. — January (т. 4, № 1). — С. 83—94. — doi:10.1016/S1286-4579(01)01513-1. — PMID 11825779. Архивировано 19 сентября 2019 года.
↑ The sequence of the acidic repeat protein (arp) gene differentiates venereal from nonvenereal Treponema pallidum subspecies, and the gene has evolved under strong positive selection in the subspecies that causes syphilis (англ.) // FEMS Immunol. Med. Microbiol. : journal. — 2008. — August (vol. 53, no. 3). — P. 322—332. — doi:10.1111/j.1574-695X.2008.00427.x. — PMID 18554302. Архивировано 5 января 2013 года.
↑ 'The All-Species Living Tree' Project.16S rRNA-based LTP release 123 (full tree) (неопр.). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Дата обращения: 20 марта 2013. Архивировано 7 июня 2019 года.
↑ J.P. Euzéby; J.P. Euzéby. Treponema (неопр.). List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Дата обращения: 20 марта 2016. Архивировано 4 августа 2020 года.
↑ Sayers; Sayers. Treponema (неопр.). National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Дата обращения: 20 марта 2016. Архивировано 24 октября 2017 года.

[LPSN-1] ¹ ² ³ Genus Treponema : [англ.] // LPSN. (Дата обращения: 17 сентября 2017).

[atlas2003-2] Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии : Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А. А. Воробьева, А. С. Быкова. — М. : Медицинское информационное агентство, 2003. — С. 78. — 236 с. — ISBN 5-89481-136-8.

[LPSN_all-3] Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) : Version 2.0 : [англ.] // LPSN. — 2016. — 2 October.

[4] Медицинская и санитарная микробиология / А. А. Воробьев, Ю. С. Кривошеин, В. П. Широбоков. — М.: Академия, 2003. — С. 52. — ISBN 5-7695-1292-X.

[pmid11825779-5] The endemic treponematoses (неопр.) // Microbes Infect.. — 2002. — January (т. 4, № 1). — С. 83—94. — doi:10.1016/S1286-4579(01)01513-1. — PMID 11825779. Архивировано 19 сентября 2019 года.

[pmid18554302-6] The sequence of the acidic repeat protein (arp) gene differentiates venereal from nonvenereal Treponema pallidum subspecies, and the gene has evolved under strong positive selection in the subspecies that causes syphilis (англ.) // FEMS Immunol. Med. Microbiol. : journal. — 2008. — August (vol. 53, no. 3). — P. 322—332. — doi:10.1111/j.1574-695X.2008.00427.x. — PMID 18554302. Архивировано 5 января 2013 года.

[7] 'The All-Species Living Tree' Project.16S rRNA-based LTP release 123 (full tree) (неопр.). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Дата обращения: 20 марта 2013. Архивировано 7 июня 2019 года.

[8] J.P. Euzéby; J.P. Euzéby. Treponema (неопр.). List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Дата обращения: 20 марта 2016. Архивировано 4 августа 2020 года.

[9] Sayers; Sayers. Treponema (неопр.). National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Дата обращения: 20 марта 2016. Архивировано 24 октября 2017 года.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Трепонемы

Содержание

Патогенность

Филогения

Таксономия

Примечания

Portal di Ensiklopedia Dunia