В 1987 году экстерном окончил Московскую духовную академию, защитив кандидатскую диссертацию на тему «К вопросу о границах Церкви». 16 декабря того же года ему присвоено учёное звание доцента.
В декабре 1988 года утверждён в должности ответственного секретаря учебного комитета с возведением в сан протоиерея.
23 апреля 1997 года за труд «Церковное право. Курс лекций» удостоен степени магистра богословия.
12 октября 1998 года удостоен учёной степени доктора церковной истории за труд «История Русской Церкви. 1917—1997» и утверждён в звании профессора.
10 декабря 2008 года решением Священного синода назначен членом созданной тогда же комиссии по подготовке Поместного собора[3]. Как член комиссии стал участником Собора, прошедшего в январе 2009 года.
23 декабря 2009 года на епархиальном собрании Московской городской епархии был избран Епархиальный суд из пяти лиц, в число которых вошёл и Владислав Цыпин[4].
До 2018 года являлся заведующим кафедрой церковно-практических дисциплин Московской духовной академии. Преподаёт в Московской духовной академии предметы: «Каноническое право», «Церковная история» и «История Западной Европы». В Сретенской духовной академии преподаёт «Каноническое право», «Церковную историю». В настоящее время является председателем историко-правовой комиссии Русской Православной Церкви. Входит в состав Синодальных комиссий: по канонизации святых, богословской. Член редакционной коллегии научно-богословского альманаха «Богословские труды» и редакционного совета «Православной энциклопедии». Научный руководитель нескольких диссертаций, выполняемых в Общецерковной аспирантуре и докторантуре. Сфера научных интересов: каноническое право, церковная история, история России.
К вопросу о границах Церкви // Богословские труды. — 1986. — Сб. МДА. — С. 193—225.
Празднование 300-летия Московской Духовной Академии // Журнал Московской Патриархии. — 1986. — № 4. — с. 11—33. (в соавторстве)
Выпускной акт в Московской Духовной Семинарии // Журнал Московской Патриархии. — 1987. — № 7. — С. 28—30.
Таинство Брака. Брак в древней Церкви // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 2. — С. 75—76.
Таинство Брака // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 3. — С. 75—76; № 4. — С. 73—74.
Жизнь и учение преподобного Максима Грека // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 4. — С. 55—56.
Жизнь и учение преподобного Максима Грека // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 5. — С. 65—70; № 6. — С. 64—68.
Таинство Брака // Журнал Московской Патриархии. — 1989. — № 5. — С. 75—76; № 6. — С. 75—76; № 7. — С. 75—76. (в соавторстве с протоиереем Геннадием Нефёдовым)
Филаретовский вечер в Московских Духовных школах // Журнал Московской Патриархии. — 1990. — № 4. — С. 35—36.
Таинство Брака. Расторжение брака // Журнал Московской Патриархии. — 1990. — № 8. — С. 75—76; № 9. — С. 76; № 10. — С. 74—75.
Воплощение Сына Божия (Рождество Христово) // О вере и нравственности по учению Православной Церкви. — М. : Московская патриархия, 1991. — 365 с. — С. 123—125
О Лице Иисуса Христа и об образе соединения двух естеств во Христе // О вере и нравственности по учению Православной Церкви. — М. : Московская патриархия, 1991. — 365 с. — С. 125—130
О Богородице и Присновдеве Марии // О вере и нравственности по учению Православной Церкви. — М. : Московская патриархия, 1991. — 365 с. — С. 142—145
О распределении выпускников Духовных Академий // Журнал Московской Патриархии. — 1991. — № 3. — С. 38.
Православная Церковь на Украине в годы немецкой оккупации (1941—1944) // Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского богословского института. — М., 1992—1996. — С. 381—397.
Определения и постановления Поместного Собора Православной Российской Церкви 1917—1918 гг. Перепеч. документов Собора с предисл. прот. В. Цыпина // Богословский вестник. — М., 1993. — Т. 1. — № 1. № 1—2. — С. 102—224.
Преподобный Сергий и русское монашество // Журнал Московской Патриархии. — 1993. — № 7. — С. 52—56.
Протопресвитер Александр Хотовицкий (1872—1937) // Журнал Московской Патриархии. — 1994. — № 7—8. — С. 98—104.
Поместный Собор Русской Православной Церкви 1917—1918 годов (актовая речь) // Журнал Московской Патриархии. — 1994. — № 1. — С. 19—30.
«Декларация» 1927 года // Журнал Московской Патриархии. — 1994. — № 5. — С. 107—118.
Православная Церковь в Польше между первой и второй мировой войной // Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского богословского института. — М., 1997. — №. — С. 144—163.
Митрополит Филарет и Московские Духовные школы // Журнал Московской Патриархии. — 1997. — № 7. — С. 55—65.
Проблемы канонического устроения Церкви // Богословские труды. — 1997. — № 33. — С. 207—232.
Православная церковь и другие конфессии // Православие и экуменизм: Документы и материалы 1902—1997: Сборник. — М. : МФТИ, 1998. — 432 с. — С. 449—458
Львовский собор 1946 г. и его последствия // Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского богословского института. — М., 1998. — №. — С. 261—267.
Примат чести и примат юрисдикции: (Канонический аспект генезиса католицизма) // Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского богословского института. — М., 1999. — №. — С. 22—25.
Каноны и церковная жизнь: К вопросу о полномочии Архиерейского собора // Православ. беседа. — 2000. — № 5. — С. 14-18.
О календарных спорах и церковных канонах // Календарный вопрос: сборник статей / ред.-сост. А. Чхартишвили. — М. : Изд-во Сретенского монастыря, 2000. — 345 с. — С. 96-102
Алексий II, патриарх Московский и всея Руси: (По страницам «Православной энциклопедии») // Исторический вестник. — 2000. — № 3—4 (7—8). — С. 19—35.
Взаимодействие Церкви и государства: Канонические принципы и историческая действительность // Исторический вестник. — 2000. — № 5—6 (9—10). — С. 49—63.
Правовой статус Церкви и духовенства при Екатерине Второй // Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского богословского института. — М., 2000. — №. — С. 146—156.
О ситуации в церковной жизни 20-30-х годов // Альфа и Омега. 2002. — № 3 (33). — С. 109—119.
Концепция права в свете христианской антропологии // Церковь и время. — 2002. — № 1 (18). — С. 29-41.
Актуальные проблемы канонического права: общие вопросы и проблемы межправославных отношений // Альфа и Омега. 2003. — № 3 (37). — С. 132—146.
Церковь и нравственность: общественная и личная // Церковь и время. — 2003. — № 4 (25). — С. 17-28.
Симфония Церкви и государства // Православная государственность: 12 писем об Империи: Сборник статей / ред.: А. М. Величко, М. Б. Смолин. — СПб. : Издательство Юридического института, 2003. — 304 с. — С. 10-29.
Третий Рим: попытка аутентичного изложения учения старца Филофея // Православная государственность: 12 писем об Империи: Сборник статей / ред.: А. М. Величко, М. Б. Смолин. — СПб. : Издательство Юридического института, 2003. — 304 с. — С. 78-93.
Актуальные проблемы канонического права: Государственно-церковные отношения // Альфа и Омега. 2003. — № 4 (38). — С. 131—148.
Идея этой канонизации — провокационная // Царь Иван Васильевич: Грозный или святой: Аргументы против канонизации Ивана Грозного и Григория Распутина. — Москва : Издательский Совет Русской Православной Церкви, 2003. — 64 с. — С. 19-23.
Идея этой канонизации — провокационная // Искушения наших дней: в защиту церковного единства / Ред.-сост. А. Добросоцких. — М.: Даниловский благовестник, 2003. — С. 211—215.
Вопрос о епархиальном управлении на Поместном соборе 1917—1918 годов // Церковь и время. 2004. — № 1 (26). — С. 156—167.
К вопросу о соборности и соборах // Православное учение о церкви: богословская конференция Русской Православной Церкви (Москва, 17-20 ноября 2003 г.): Материалы. — М. : Синодальная богословская комиссия, 2004. — 359 с. — С. 81-89.
Отзыв на канд. дисс. игум. Герасима (Поповича) на тему: «Расколы в Сербской Православной Церкви (1945—1995 гг.) и их каноническая оценка» // Богословский вестник. 2003. — №. 3. — С. 388—389.
Отзыв на канд. дисс. иером. Иосифа (Павлинчука) на тему: «Кишиневско-Молдавская епархия в период с 1944 по 1989 год». // Богословский вестник. 2004. — №. 4. — С. 536—539.
Отзыв на канд. дисс. прот. Александра Степанченко на тему: «Проблемы кодификации законодательства, действующего в Русской Православной Церкви». // Богословский вестник. 2004. — №. 4. — С. 570—574.
Русская Православная Церковь в Великую Отечественную войну // Журнал Московской Патриархии. — 2005. — № 5. — С. 66—71.
Высшее управление Римско-католической церкви // Хрестоматия по сравнительному богословию: учебное пособие для III курса Духовной семинарии. — М. : Издательство подворья Свято-Троицкой Сергиевой Лавры, 2005. — 847 с. — С. 753—758.
Отзыв на канд. дисс. свящ. Германа Григорьева на трему: «Патриарший экзарх Латвии и Эстонии митр. Виленский и Литовский Сергий (Воскресенский)». // Богословский вестник. 2006. — № 5/6. — С. 740—745.
Внутрицерковные отношения конца 1920-х — начала 1930-х годов // Меневские чтения. — Т. 1 : Церковная жизнь XX века: Протоиерей Александр Мень и его духовные наставники : сборник материалов Первой научной конференции «Меневские чтения» (9-11 сентября 2006 г.). — Сергиев Посад : Приход Сергиевской церкви в Семхозе, 2007. — 188 с. — С. 23-38.
Канонические основания сакраментологии // Православное учение о Церковных Таинствах: V Международная богословская конференция Русской православной церкви (Москва, 13-16 ноября 2007 г.). — Т. 1 : Таинства в целом. Крещение и Миропомазание. Евхаристия: литургические аспекты. — М. : Синодальная библейско-богословская комиссия, 2009. — 478 с. — С. 152—178.
Русская Православная Церковь в февральские дни 1917 г. // Материалы церковно-научной конференции «100-летие начала эпохи гонений на Русскую православную церковь» (Храм Христа Спасителя, г. Москва, 16 июня 2017 г.) / Организационный комитет по реализации программы общецерковных мероприятий к 100-летию начала эпохи гонений на Русскую Православную Церковь. — М. : Издательство Московской Патриархии Русской Православной Церкви, 2018. — 160 с. — С. 13-30
Значение и итоги Совещания 1948 года. О форуме собравшем глав и представителей автокефальных Православных Церквей в Москве // Журнал Московской патриархии. 2018. — № 7 (920). — С. 52-58
Книги
Каноническое право: лекции 1-4. — М. : РОУ, 1991. — 52 с.
История Русской православной церкви, 1917—1990: Учеб. для православ. духов. семинарий. — М. : Изд. дом «Хроника», 1994. — 251 с. — ISBN 5-88017-001-2
Церковное право. Курс лекций. — М.: Круглый стол по религиозному образованию в Русской Православной церкви, 1994. — 440 с.
Церковное право : Учеб. пособие. — [2-е изд.]. — М. : Круглый стол по религиоз. образованию в Рус. православ. церкви : Изд-во МФТИ, 1996. — 442 с. — ISBN 5-89155-005-9
Русская церковь (1917—1925): учебное пособие. — М. : Изд. Сретенского монастыря, 1996. — 336 с.
Русская церковь (1925—1938): учебное пособие. — М. : Изд. Сретенского монастыря, 1999. — 442 с.
10-летие интронизации и 50-летие священства святейшего патриарха Московского и всея Руси Алексия II / текст прот. В. Цыпин. — М. : Софрино, 2000. — 264 с.
История Русской Православной Церкви : синодальный и новейший периоды : (1700—2005). — 2-е изд., перераб. — Москва : Сретенский монастырь : Московская духовная академия, 2006. — 815 с. — ISBN 5-7533-0406-0
История Русской Православной Церкви. Синодальный и новейший периоды, (1700—2005). — 3-е изд., испр. — Москва : Сретенский монастырь, 2007. — 815 с. — ISBN 978-5-7533-0142-0.
Христианские корни европейской цивилизации и Россия : статьи разных лет; Фонд изучения исторической перспективы. — Москва : Изд-во Сретенского монастыря, 2019. — 575 с. — ISBN 978-5-7533-1389-8