Первые упоминания о Черниковщине появляются в XVI веке[4][5]: с 1550 года она принадлежала Радзивиллам и входила в Койдановское староство (позже Койдановское графство). В 1566 году Черниковщина вошла в состав Минского воеводства. В середине 1560-х годов Радзивиллы подарили деревню для нужд «службы Божьей» Койдановскому кальвинистскому сбору. В то время Черниковщина имела 40 крестьянских дворов, более 10 волоков земли.
В результате второго раздела Речи Посполитой (1793) Черниковщина оказалась в составе Российской империи; деревня в Койдановской волости Минского уезда, владение Радзивиллов, Тарасовых, Рафов, Ритеров и других. В 1800 году в деревне 29 дворов и 174 жителя, действовала водяная мельница на реке Уса, а также сукновальня. В 1820 году в фольварке Черниковщина насчитывалось 18 дымов, у всех по 0,5 волока земли. Во второй половине XIX века—начале XX века находилась в составе КойдановскойволостиМинского уездаМинской губернии. В 1870 году насчитывался 71 житель мужского пола. В 1882 году в деревне открылась школа грамоты, где обучалось 10 мальчиков. В 1897 году, по данным переписи насчитывался 61 двор, и проживали 392 жителя, действовали хлебозапасный магазин, неподалёку располагалось имение (28 жителей), где действовали водяная мельница, постоялый двор и корчма. В 1912 году школа грамоты была преобразована в одноклассное народное училище. В 1917 году существовали деревня Черниковщина (58 дворов, 332 жителя) и имение Черниковщина (15 дворов, 91 житель).
С 20 августа 1924 года деревня находилась в составе Байдановского сельсовета (с 29 октября 1924 по 21 августа 1925 года — Ледникского) Койдановского района Минского округа. Затем в составе Дзержинского польского национального района. 31 июля 1937 года полрайон был упразднён и деревня была включена в состав Минского района. С 20 февраля 1938 года находится в составе Минской области, которая была образована после упразднения окружной системы деления Белорусской ССР. С 4 февраля 1939 года в составе восстановленного Дзержинского района. В 1926 году, по данным всесоюзной переписи в деревне Черниковщина-1 насчитывалось 65 дворов, проживали 337 жителей; в деревне Черниковщина-2 насчитывалось 20 дворов и проживали 94 жителя. Действовало мелиоративное товарищество, действовало отделение потребительской кооперации. В годы коллективизации был организован колхоз «Искра», который обслуживала ФанипольскаяМТС, также работала кузница, дом-читальня, шорная мастерская.
Во время Великой Отечественной войны с 28 июня 1941 года по 6 июля 1944 года деревня была оккупирована немецко-фашистскими захватчиками, на фронте погибли 31 житель деревни. В 1960 году в деревне Черниковщина-1 проживали 233 жителя, а в Черниковщине-2 проживали 166 жителей. Впоследствии две деревни были объединены в одну и включена в состав Фанипольского сельсовета. В 1991 году в деревне насчитывалось 135 хозяйств, проживали 354 жителя.
В центре деревни расположена братская могила советских воинов, где погребены 25 воинов, погибших в боях против немецко-фашистских захватчиков на территории сельсовета в июне-июле 1941 года и при освобождении деревни в 1944 году. В 1958 году на могиле был установлен обелиск[9][10].
Курганный могильник расположен в 650 метрах на северо-восток от деревни в поле, возле дороги в направлении д. Тявлово. Восемь насыпей диаметром 5—19 метров, высотой 1,5—3,5 метров. Отдельные курганы повреждены взрывами и ямами. Обнаружил в 1870-х годах Г. Г. Игнатьев, исследовал 1980—1983 годах Ю. А. Заяц. В конце XIX века две насыпи раскопал В. З. Завитневич. Погребальный обряд в одном кургане — трупосожжение, в другом — трупосожжение на горизонте головой на запад. Найдены стеклянное ожерелье и серебряные височные кольца. Датируется IX—XI веками, принадлежал дреговичам. Материалы раскопок хранятся в Государственном историческом музее в Москве. Также в деревне расположен (в 100 м от здания школы) курган высотой 3 метра и диаметром 14,5 метров, повреждён ямами[11][12].
↑І.А. Гапоненка, І.Л. Капылоў, В. П. Лемцюгова і інш. Назвы населеных пунктаў Рэспублікі Беларусь: Мінская вобласць: нарматыўны даведнік. — Минск: Тэхналогія, 2003. — ISBN 985-458-054-7. (бел.)
↑Национальная академия наук Беларуси, Белорусская энциклопедия им. П.Бровки, Институт искусствоведения, этнографии и фольклора.Гарады і вёскі Беларусі. — Минск: Издательство Белорусской энциклопедии им. П.Бровки, 2011. (бел.)
↑Памяць: Гісторыка-дакументальная хроніка Дзяржынскага раёна. — Минск: БЕЛТА, 2004. — 704 с.: іл. ISBN 985-6302-64-1 (бел.)