В 1952 году была введена классификация дорог Японии национального значения — они были разделены на дороги 1-го класса и дороги 2-го класса. Дорогам 1-го класса были присвоены номера из одной или двух цифр, дорогам 2-го класса — номера из трёх цифр. Всего на тот момент существовало 459 дорог национального значения.
В 1964 году было убрано разделение на классы, а новым дорогам стали присваивать только трёхзначные номера, в результате чего номера с 58 по 100 остались неиспользованными.
Из-за объединения дорог или изменения маршрутов некоторые номера стали вакантными.
Маркировка
Щит с символикой японских национальных дорог
Символом дорог является перевёрнутый синий треугольный щит с закруглёнными краями. В верхней части щита нанесены иероглифы 国道 («дорога национального значения»), в нижней — английское слово «route» («маршрут»). В центральной части щита помещается номер дороги.