Интерконтинентални куп из 1999. године је била фудбалска утакмица асоцијације одиграна 30. новембра 1999. између Манчестер јунајтеда, победника УЕФА Лиге шампиона 1998/99, и Палмеираса, победника Купа либертадорес 1999. Утакмица је одиграна на неутралном терену Националног стадиона у Токију пред 53.372 гледалаца.
Манчестер јунајтед је победио у мечу резултатом 1:0, а капитен Рој Кин је искористио грешку голмана Палмеираса Маркоса и постигао победнички гол. Ово је био једини тријумф Јунајтеда у Интерконтиненталном купу, који је изгубио од Естудијантеса у такмичењу 1968. године. Ова утакмица је била једино учешће Палмеираса у Интерконтиненталном купу. Рајан Гигс је добио награду за најбољег играча.[2] Победа Манчестер јунајтеда учинила их је првим и јединим тимом из Енглеске и Британских острва који је освојио Интерконтинентални куп.[3]
Двадесету сезону заредом, као резултат спонзорства такмичења од стране Тојоте, утакмица је одиграна на неутралном стадиону, Националном стадиону у Токију, Јапан.[4]