Хипоксијом изазвани фактори

Хипоксијом изазвани фактор 1, подјединица алфа
Идентификатори
СимболHIF1A
Entrez3091
HUGO4910
OMIM603348
RefSeqNM_001530
UniProtQ16665
Остали подаци
ЛокусХромозом 14 q21-q24
Нуклеарни транслокатор рецептора арил угљоводоника
Идентификатори
СимболARNT
Алт. симболиHIF1B, bHLHe2
Entrez405
HUGO700
OMIM126110
RefSeqNM_001668
UniProtP27540
Остали подаци
ЛокусХромозом 1 q21
протеин ендотелног ПАС домена 1
Идентификатори
СимболEPAS1
Алт. симболиHIF2A, MOP2, PASD2, HLF
Entrez2034
HUGO3374
OMIM603349
RefSeqNM_001430
UniProtQ99814
Остали подаци
ЛокусХромозом 2 p21-p16
Нуклеарни транслокатор рецептора арил-угљоводоника 2
Идентификатори
СимболARNT2
Алт. симболиHIF2B, KIAA0307, bHLHe1
Entrez9915
HUGO16876
OMIM606036
RefSeqNM_014862
UniProtQ9HBZ2
Остали подаци
ЛокусХромозом 1 q24
Хипоксијом изазвани фактор 3, подјединица алфа
Идентификатори
СимболHIF3A
Entrez64344
HUGO15825
OMIM609976
RefSeqNM_152794
UniProtQ9Y2N7
Остали подаци
ЛокусХромозом 19 q13

Хипоксијом изазвани фактори (ХИФ) су елементи транскрипције који реагују на смањење доступног кисеоника у ћелијском окружењу, или на хипоксију.[1][2] Они такође реагују на случајеве псеудохипоксије, као што је то случај код недостатак тиамина.[3][4]

И хипоксија и псеудохипоксија доводе до оштећења производње аденозин трифосфата (АТП) од стране митохондрија.

Опште информације

Фактор који је изазван хипоксијом (ХИФ)-1 је димерни протеински комплекс који игра интегралну улогу у одговору тела на ниске концентрације кисеоника, или хипоксију. ХИФ-1 је међу примарним генима укљученим у хомеостатски процес, који може повећати васкуларизацију у хипоксичним подручјима као што су локализована исхемија и тумори. То је фактор транскрипције за десетине циљних гена; док је ХИФ-1 неопходан за имунолошке одговоре и кључни је физиолошки регулатор хомеостазе, васкуларизације и анаеробног метаболизма. Штавише, ХИФ-1 се све више проучава због свог уоченог терапеутског потенцијала. Пошто изазива ангиогенезу, побољшање овог гена код пацијената са исхемијом могло би да подстакне пролиферацију крвних судова потребну за оксигенацију. Насупрот томе, како ХИФ-1 омогућава преживљавање и пролиферацију ћелија рака због својих ангиогених својстава, њгова инхибиција би потенцијално могла спречити ширење рака.

Уз растуће разумевање пута ХИФ-1, инхибиција и стимулација његове транскрипционе активности преко малих молекула тренутно је атрактиван циљ. Генска терапија за постизање и пролиферације крвних судова и регресију рака је демонстрирана у студијама на животињама, али захтева значајно побољшање и модификацију пре него што постане комерцијално доступна.[5]

Метаболизам кисеоника код сисара

Кисеоник је потребан ћелијама већине организама да би произвеле адекватне количине АТП-а неопходне за метаболичке активности. Хипоксија, или недостатак кисеоника, јавља се у људским ткивима и ћелијама због разних стања, укључујући поремећаје срца и плућа, анемију и проблеме са циркулацијом. У зависности од тежине, може доћи до трајног оштећења ткива и ћелија.[6]

Међутим, хипоксија такође може играти важну и корисну улогу у људској физиологији и развоју. Неопходан је за правилан развој ембриона. Иако су тачни механизми непознати, тензија кисеоника је повезана са затварањем неуралне цеви, посредовањем апоптозе и правилним морфолошким развојем током гестације. Овакви налази указују на то да поред генетских знакова, услови средине као што је хипоксија служе као сигнали у ембрионалном развоју.[7][8]

Многи организми су развили механизме прилагођавања за хипоксична стања. Промена нивоа кисеоника може довести до активације или потискивања одређених хомеостатских регулаторних гена, омогућавајући опстанак ткива и ћелија упркос флуктуирајућим условима животне средине. Гени као што је ХИФ-1, чија је активација подстакнута хипоксичним условима, могу да ступе у интеракцију са ензимима и другим факторима транскрипције како би контролисали васкуларизацију и раст ткива. Док су микроокружења која окружују канцерогене туморе изузетно хипоксична, пролиферација таквих маса често је омогућена активацијом ХИФ-1, што доводи до повећане ангиогенезе и, самим тим, до повећаног снабдевања кисеоником у том подручју.[9]

С обзиром на његову истакнуту функцију, манипулација активношћу ХИФ-1 у областима исхемије и туморских маса постала је фокус у настојању да се развију неинвазивне, фармацеутске опције лечења за пацијенте са раком и срчаним обољењима. Иако ниједан такав људски протеин није успешно регулисан научним средствима, контрола активности ХИФ-1 је све изводљивија како се разјашњавају детаљи његове структуре, функције и генетског пута.

Структура

Врсте које дишу кисеоник изражавају високо конзервирани транскрипциони комплекс ХИФ-1, који је хетеродимер састављен од алфа и бета подјединице, при чему је последња конститутивно експримирани нуклеарни транслокатор рецептора арил угљоводоника (ARNT).[10] ХИФ-1 припада Per-ARNT-Sim (ПАС) потфамилији основне хеликс-лооп-хелик (bHLH) фамилије транскрипционих фактора. Алфа и бета подјединица су сличне структуре и обе садрже следеће домене:[11][12][13]

  • Н-терминус – bHLH домен за везивање ДНК
  • централни регион – Per-ARNT-Sim (ПАС) домен, који олакшава хетеродимеризацију
  • Ц-терминус – регрутује транскрипционе корегулационе протеине

Чланови породице

У табели су наведени чланови људске ХИФ породице:

Име ген протеина
ХИФ-1α ХИФ1А Фактор 1 изазван хипоксијом , алфа подјединица
ХИФ-1β АРНТ Нуклеарни транслокатор АХР
ХИФ-2α ЕПАС1 протеин ендотелног домена ПАС1
ХИФ-2β АРНТ2 Нуклеарни транслокатор АХР рецептора 2
ХИФ-3α ХИФ3А Фактор 3 изазван хипоксијом , алфа подјединица
ХИФ-3β АРНТЛ Нуклеарни транслокатор АХР рецептора 3

Механизам деловања

Нобелова награда за физиологију и медицину 2019: Како ћелије осећају и прилагођавају се доступности кисеоника. У нормоксичним условима, Хиф-1 алфа је хидроксилиран на два остатка пролина. Протеин се затим повезује са ВХЛ-ом и након тога је означен убиквитином. Означени Хиф-1 алфа се затим транслоцира у протеазом, где се разграђује. У условима хипоксије, кисеоник није доступан за хидроксилацију пролина. У овој ситуацији Хиф-1 алфа се транслоцира у ћелијско језгро и повезује се са Хиф-1 бета, који се такође назива АРНТ. Овај комплекс се затим везује за ДНК регион који се назива ХРЕ (елемент који реагује на хипоксију). Као последица тога, циљни гени су транскрибовани. Ови гени су укључени у регулацију мноштва процеса, укључујући еритропоезу, гликолизу и ангиогенезу.

ХИФ алфа подјединице су хидроксиловане на конзервираним остацима пролина помоћу ХИФ пролил хидроксилазе, омогућавајући им да буду препознате и убиквитиниране од стране ВХЛ убиквитин Е3 лигазе, што их означава за брзу деградацију од стране протеазома  . Ово се дешава само у нормоксичним условима. У хипоксичним условима, инхибитор ХИФ-пролил хидроксилазе је инхибиран јер користи кисеоник као косубстрат  . Инхибиција преноса електрона у комплексу сукцинат дехидрогеназе услед мутација у генима SDHB или SDHD може изазвати акумулацију сукцината, који инхибира пролиферацију ХИФ хидроксилазе, чиме се стабилизује ХИФ-1α. Ово стање се назива псеудохипоксија .

ХИФ-1, стабилизован хипоксичним условима, активира неколико гена који промовишу преживљавање у условима ниског кисеоника. То укључује гликолитичке ензиме, који омогућавају синтезу АТП-а на начин независан од кисеоника, и фактор раста васкуларног ендотела (ВЕГФ), који промовише ангиогенезу . ХИФ-1 делује тако што се везује за елементе одговора на хипоксију (ХРЕ) у промотерима који садрже секвенцу 5'-РЦГТГ-3' (где је Р пурин , било А или Г ). Студије показују да хипоксија модулира метилацију хистона и репрограмира хроматин  . Овај рад је објављен истовремено са радом добитника Нобелове награде за физиологију или медицину Вилијама Келина млађег за 2019.  . Овај рад је забележен у независном уводнику  .

Показало се да протеин антагониста мишићне киназе А (мАКАП) регрутује убиквитин Е3 лигазу, утичући на стабилност и позиционирање ХИФ-1 унутар места деловања у језгру. Смањење мАКАП-а или поремећај његовог циљања на перинуклеарни (у кардиомиоцитима ) регион мења стабилност ХИФ-1 и транскрипциону активацију гена повезаних са хипоксијом. Дакле, „компартментализација“ сигналних компоненти осетљивих на кисеоник може утицати на хипоксични одговор  .

Напредно познавање молекуларних регулаторних механизама активности ХИФ1 у условима хипоксије у оштрој је супротности са недостатком информација о механичким и функционалним аспектима који утичу на регулацију ХИФ1 посредовану НФ-κБ у нормоксичним условима. Међутим, стабилизација ХИФ-1α се такође детектује у нехипоксичним условима кроз раније непознат механизам. Показало се да је НФ-κБ (нуклеарни фактор κБ) директни модулатор експресије ХИФ-1α у присуству нормалне тензије кисеоника. Студије сиРНА ( мале интерферирајуће РНК ) за појединачне чланове НФ-κБ откриле су диференцијалне ефекте на нивоу ХИФ-1α мРНА , што сугерише да НФ-κБ може регулисати базалну експресију ХИФ-1α. Коначно, показано је да када се ендогени НФ-κБ индукује ТНФ-α (фактор некрозе тумора α), нивои ХИФ-1α се такође мењају, на начин који зависи од НФ-κБ . ХИФ-1 и ХИФ-2 имају различите физиолошке улоге. ХИФ-2 регулише производњу еритропоетина у одраслом животу.

Поправка, регенерација и подмлађивање ткива

У нормалним условима, након повреде, ХИФ-1α се разграђује пролил хидроксилазама (ПХД). У јуну 2015, научници су открили да дуготрајна активација ХИФ-1α коришћењем ПХД инхибитора регенерише изгубљено или оштећено ткиво код сисара који имају одговор на поправку; и даље смањење нивоа ХИФ-1α резултира зарастањем ожиљака код сисара са претходним регенеративним одговором на губитак ткива. Регулација ХИФ-1а може или да искључи или укључи кључни процес у регенерацији сисара  . Један такав регенеративни процес у који је укључен ХИФ1А је зарастање коже  . Истраживачи са Медицинског факултета Универзитета Станфорд показали су да активирање ХИФ1А може спречити и лечити хроничне ране код старијих мишева са дијабетесом. Не само да су ране мишева брже зарасле, већ је и квалитет нове коже био чак и бољи од оригиналне. Даље, описан је регенеративни ефекат модулације ХИФ-1А на старе ћелије коже  , а код пацијената је показано дејство подмлађивања на остарелу кожу лица. ХИФ модулација такође има позитиван ефекат на губитак косе. Овај механизам користи биотехнолошка компанија из Беча која је на основу патентираног активног састојка ХСФ (ХИФ Енханцемент Фацтор), развила производи за које се верује да промовишд регенерацију коже и косе  .

ХИФ у истраживању

Цео спектар функције ХИФ-1 још није схваћен. Сходно томе, регулација активације фактора транскрипције код људи још није постигнута. Тек недавно је описано да различите ХИФ-1α хидроксилазе утичу и регулишу нивое овог транскрипционог фактора другачије. Остаје још много да се научи о селективности и својствима фактора који утичу на ХИФ-1 пут.[14]

Иако су тренутни напори да се манипулише путем ХИФ-1 углавном усредсређени на потребу за лечењем рака и исхемије, сугерисано је да ХИФ-1α може играти улогу у настанку плућне фиброзе.[15] Како молекуларни механизми који доводе до појаве ове болести остају непознати, инактивација ХИФ-1α у респираторним ћелијама може бити важна линија истраживања. Упркос таквим сивим зонама у знању о ХИФ-1, контрола овог фактора транскрипције заправо остаје циљ високог приоритета. Модулација пута ХИФ-1 обећава да ће имати значајне ефекте на лечење рака и срца, и тако потенцијално утицати на животе милиона људи који су погођени овим болестима.

Референце

  1. ^ Smith TG, Robbins PA, Ratcliffe PJ (мај 2008). „The human side of hypoxia-inducible factor”. British Journal of Haematology. 141 (3): 325—34. PMC 2408651Слободан приступ. PMID 18410568. doi:10.1111/j.1365-2141.2008.07029.x. 
  2. ^ Wilkins SE, Abboud MI, Hancock RL, Schofield CJ (април 2016). „Targeting Protein-Protein Interactions in the HIF System”. ChemMedChem. 11 (8): 773—86. PMC 4848768Слободан приступ. PMID 26997519. doi:10.1002/cmdc.201600012. 
  3. ^ Rl, Sweet; Ja, Zastre (2013). „HIF1-α-mediated gene expression induced by vitamin B1 deficiency”. International Journal for Vitamin and Nutrition Research (на језику: енглески). 83 (3): 188—197. ISSN 0300-9831. PMID 24846908. doi:10.1024/0300-9831/a000159. 
  4. ^ Marrs, C; Lonsdale, D (2021-09-29). „Hiding in Plain Sight: Modern Thiamine Deficiency”. Cells (на језику: енглески). 10 (10): 2595. ISSN 2073-4409. PMC 8533683Слободан приступ. PMID 34685573. doi:10.3390/cells10102595Слободан приступ. 
  5. ^ Jennifer E. Ziello, S. Jovin, Yan Huanga (јун 2007). „Hypoxia-Inducible Factor (HIF)-1 Regulatory Pathway and its Potential for Therapeutic Intervention in Malignancy and Ischemia”. Yale J Biol Med. 80 (2): 51—60. .
  6. ^ Semenza, Gregg L. (2000-04-01). „HIF-1: mediator of physiological and pathophysiological responses to hypoxia”. Journal of Applied Physiology. 88 (4): 1474—1480. ISSN 8750-7587. doi:10.1152/jappl.2000.88.4.1474. 
  7. ^ Genbacev, Olga; Zhou, Yan; Ludlow, John W.; Fisher, Susan J. (1997-09-12). „Regulation of Human Placental Development by Oxygen Tension”. Science. 277 (5332): 1669—1672. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.277.5332.1669. 
  8. ^ Iyer, Narayan V.; Kotch, Lori E.; Agani, Faton; Leung, Sandra W.; Laughner, Erik; Wenger, Roland H.; Gassmann, Max; Gearhart, John D.; Lawler, Ann M. (1998-01-15). „Cellular and developmental control of O2 homeostasis by hypoxia-inducible factor 1α”. Genes & Development. 12 (2): 149—162. ISSN 0890-9369. doi:10.1101/gad.12.2.149. 
  9. ^ Carmeliet, Peter; Dor, Yuval; Herbert, Jean-Marc; Fukumura, Dai; Brusselmans, Koen; Dewerchin, Mieke; Neeman, Michal; Bono, Françoise; Abramovitch, Rinat (1998-07-30). „Role of HIF-1α in hypoxia-mediated apoptosis, cell proliferation and tumour angiogenesis”. Nature. 394 (6692): 485—490. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/28867. 
  10. ^ Jiang BH, Rue E, Wang GL, Roe R, Semenza GL (јул 1996). „Dimerization, DNA binding, and transactivation properties of hypoxia-inducible factor 1”. The Journal of Biological Chemistry. 271 (30): 17771—8. PMID 8663540. S2CID 33729273. doi:10.1074/jbc.271.30.17771Слободан приступ. 
  11. ^ Zhulin IB, Taylor BL, Dixon R (септембар 1997). „PAS domain S-boxes in Archaea, Bacteria and sensors for oxygen and redox”. Trends in Biochemical Sciences. 22 (9): 331—3. PMID 9301332. doi:10.1016/S0968-0004(97)01110-9. 
  12. ^ Yang J, Zhang L, Erbel PJ, Gardner KH, Ding K, Garcia JA, Bruick RK (октобар 2005). „Functions of the Per/ARNT/Sim domains of the hypoxia-inducible factor”. The Journal of Biological Chemistry. 280 (43): 36047—54. PMID 16129688. S2CID 46626545. doi:10.1074/jbc.M501755200Слободан приступ. 
  13. ^ Ponting, Chris P.; Aravind, L. (1997). „PAS: a multifunctional domain family comes to light”. Current Biology. 7 (11): R674—R677. ISSN 0960-9822. doi:10.1016/s0960-9822(06)00352-6. 
  14. ^ Appelhoff, R. J.; Tian, Y. M.; Raval, R. R.; et al. (2004). „Differential function of the prolyl hydroxylases PHD1, PHD2, and PHD3 in the regulation of hypoxia-inducible factor”. J Biol Chem. 279: 38458—38465. 
  15. ^ Andrew, Angeline S.; Klei, Linda R.; Barchowsky, Aaron (2001-09-01). „Nickel requires hypoxia-inducible factor-1α, not redox signaling, to induce plasminogen activator inhibitor-1”. American Journal of Physiology-Lung Cellular and Molecular Physiology. 281 (3): L607—L615. ISSN 1040-0605. doi:10.1152/ajplung.2001.281.3.l607. 

Спољашње везе

Молимо Вас, обратите пажњу на важно упозорење
у вези са темама из области медицине (здравља).
Prefix: a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9

Portal di Ensiklopedia Dunia

Kembali kehalaman sebelumnya