Rozmanov sklop

Primer Rozmanovog sklopa, strukturnog domena dekarboksilaznog proteina iz bakterije Staphylococcus epidermidis (1G5Q) sa vezanim flavinskim mononukleotidnim kofaktorom.

Rozmanov sklop je proteinski strukturni motiv prisutan u proteinima koji vezuju nukleotide, posebno kofaktor NAD. Struktura sa dva ponavljanja se sastoji od šest paralelnih beta lanaca vezanih za dva para alfa heliksa u topološkom redosledu beta-alfa-beta-alfa-beta. Pošto se svaki Rozmanov sklop može vezati samo za jedan nukleotid, vezujući domeni dinukleotida kao što je NAD se sastoje od para Rozmanovaih sklopova. Pojedinačni Rozmanovi sklopovi mogu da vežu mononukleotide kao što je kofaktor FMN.

Motiv je dobio ime po Majklu Rozmanu, koji je prvi opisao ovaj motif u proteinima koji vezuju nukleotide, kao što su dehidrogenaze.^[1] Poznato je da se konsenzus sekvenca za mesto NADP vezivanja nekih enzima koji koriste NADP razlikuje od NAD vezujućeg motiva.^[2]^[3]

Reference

^ Rao S, Rossmann M (1973). „Comparison of super-secondary structures in proteins”. J Mol Biol. 76 (2): 241—56. PMID 4737475. doi:10.1016/0022-2836(73)90388-4.
^ Hanukoglu, I.; Gutfinger, T. (1989). „cDNA sequence of adrenodoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases.”. Eur J Biochem. 180 (2): 479—84. PMID 2924777. doi:10.1111/j.1432-1033.1989.tb14671.x.
^ Scrutton NS, Berry A, Perham RN (1990). „Redesign of the coenzyme specificity of a dehydrogenase by protein engineering.”. Nature. 343 (6253): 38—43. PMID 2296288. doi:10.1038/343038a0.

[1] Rao S, Rossmann M (1973). „Comparison of super-secondary structures in proteins”. J Mol Biol. 76 (2): 241—56. PMID 4737475. doi:10.1016/0022-2836(73)90388-4.

[pmid2924777-2] Hanukoglu, I.; Gutfinger, T. (1989). „cDNA sequence of adrenodoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases.”. Eur J Biochem. 180 (2): 479—84. PMID 2924777. doi:10.1111/j.1432-1033.1989.tb14671.x.

[pmid2296288-3] Scrutton NS, Berry A, Perham RN (1990). „Redesign of the coenzyme specificity of a dehydrogenase by protein engineering.”. Nature. 343 (6253): 38—43. PMID 2296288. doi:10.1038/343038a0.

[1]

[2]

[3]

Rozmanov sklop

Reference

Portal di Ensiklopedia Dunia