Глюкокортикоїдний рецептор
NR3C1
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
1M2Z , 1NHZ , 1P93 , 3BQD , 3CLD , 3E7C , 3H52 , 3K22 , 3K23 , 4CSJ , 4HN5 , 4HN6 , 4LSJ , 4MDD , 4P6W , 4P6X , 5CBY , 5CBX , 4UDC , 4UDD , 5CBZ , 5CC1 , 5EMQ , 5EMC , 5EMP
Ідентифікатори
Символи
NR3C1 , GCCR, GCR, GCRST, GR, GRL, nuclear receptor subfamily 3 group C member 1, Glucocorticoid Receptor
Зовнішні ІД
OMIM : 138040 MGI: 95824 HomoloGene: 30960 GeneCards: NR3C1
Пов'язані генетичні захворювання
glucocorticoid resistance [ 1]
Реагує на сполуку
Мометазон , триамцинолон , преднізолон [ 2]
Будесонід , ciclesonide , clobetasol propionate , Кортизол , deoxycorticosterone , desoximetasone , дексаметазон , difluprednate , fluocinolone acetonide , fluocinonide , fluorometholone , флутіказон , fluticasone propionate , метилпреднізолон , преднізолон , преднізон , RU28362 , триамцинолон , triamcinolone acetonide , бетаметазон , міфепристон [ 3]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• steroid hormone binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • glucocorticoid receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • зв’язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • steroid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • RNA binding • SUMO binding • Hsp90 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein kinase binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • нуклеоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • клітинне ядро • цитоскелет • веретено поділу • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• cellular response to steroid hormone stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glucocorticoid mediated signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • glucocorticoid receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • steroid hormone mediated signaling pathway • клітинний цикл • поділ клітини • GO:0097285 апоптоз • chromosome segregation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to dexamethasone stimulus • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to glucocorticoid stimulus • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 143.28 – 143.44 Mb
Хр. 18: 39.54 – 39.65 Mb
PubMed search
[ 4]
[ 5] Вікідані
NR3C1 (англ. Nuclear receptor subfamily 3 group C member 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [ 6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот , а молекулярна маса — 85 659[ 7] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDSKESLTPG REENPSSVLA QERGDVMDFY KTLRGGATVK VSASSPSLAV
ASQSDSKQRR LLVDFPKGSV SNAQQPDLSK AVSLSMGLYM GETETKVMGN
DLGFPQQGQI SLSSGETDLK LLEESIANLN RSTSVPENPK SSASTAVSAA
PTEKEFPKTH SDVSSEQQHL KGQTGTNGGN VKLYTTDQST FDILQDLEFS
SGSPGKETNE SPWRSDLLID ENCLLSPLAG EDDSFLLEGN SNEDCKPLIL
PDTKPKIKDN GDLVLSSPSN VTLPQVKTEK EDFIELCTPG VIKQEKLGTV
YCQASFPGAN IIGNKMSAIS VHGVSTSGGQ MYHYDMNTAS LSQQQDQKPI
FNVIPPIPVG SENWNRCQGS GDDNLTSLGT LNFPGRTVFS NGYSSPSMRP
DVSSPPSSSS TATTGPPPKL CLVCSDEASG CHYGVLTCGS CKVFFKRAVE
GQHNYLCAGR NDCIIDKIRR KNCPACRYRK CLQAGMNLEA RKTKKKIKGI
QQATTGVSQE TSENPGNKTI VPATLPQLTP TLVSLLEVIE PEVLYAGYDS
SVPDSTWRIM TTLNMLGGRQ VIAAVKWAKA IPGFRNLHLD DQMTLLQYSW
MFLMAFALGW RSYRQSSANL LCFAPDLIIN EQRMTLPCMY DQCKHMLYVS
SELHRLQVSY EEYLCMKTLL LLSSVPKDGL KSQELFDEIR MTYIKELGKA
IVKREGNSSQ NWQRFYQLTK LLDSMHEVVE NLLNYCFQTF LDKTMSIEFP
EMLAEIITNQ IPKYSNGNIK KLLFHQK
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів , регуляторів хроматину , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз , транскрипція , регуляція транскрипції , клітинний цикл , поділ клітини , мітоз, розходження хромосом, поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ліпідами , іонами металів, іоном цинку , ДНК , РНК , стероїдами .
Локалізований у цитоплазмі , цитоскелеті , ядрі , мітохондрії .
Література
Turner J.D., Schote A.B., Keipes M., Muller C.P. (2007). A new transcript splice variant of the human glucocorticoid receptor: identification and tissue distribution of hGR Delta 313-338, an alternative exon 2 transactivation domain isoform. Ann. N. Y. Acad. Sci . 1095 : 334—341. PMID 17404046 doi :10.1196/annals.1397.037
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Govindan M.V., Pothier F., Leclerc S., Palaniswami R., Xie B. (1991). Human glucocorticoid receptor gene promotor-homologous down regulation . J. Steroid Biochem. Mol. Biol . 40 : 317—323. PMID 1958537 doi :10.1016/0960-0760(91)90197-D
Weinberger C., Hollenberg S.M., Rosenfeld M.G., Evans R.M. (1985). Domain structure of human glucocorticoid receptor and its relationship to the v-erb-A oncogene product. Nature . 318 : 670—672. PMID 3841189 doi :10.1038/318670a0
Bamberger C.M., Bamberger A.M., de Castro M., Chrousos G.P. (1995). Glucocorticoid receptor beta, a potential endogenous inhibitor of glucocorticoid action in humans . J. Clin. Invest . 95 : 2435—2441. PMID 7769088 doi :10.1172/JCI117943
Oakley R.H., Sar M., Cidlowski J.A. (1996). The human glucocorticoid receptor beta isoform. Expression, biochemical properties, and putative function. J. Biol. Chem . 271 : 9550—9559. PMID 8621628 doi :10.1074/jbc.271.16.9550
Примітки
Див. також
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші