Карл Теодор Баварський (нім.Carl Theodor in Bayern; 9 серпня1839, Поссенхофен, Верхня Баварія — 30 листопада1909, Кройт, Баварія) — герцог Баварський, представник бічної гілки правлячої династії Віттельсбахів.
У 1865 році Карл Теодор одружився зі своєю кузиною Софією, принцесою Саксонською (1845—1867), дочкою короля Йоганна I. У подружжя народилася дочка Амалія (1865—1912), дружина Вільгельма, 2-го герцога Ураха.
Навчався в Мюнхенському університеті, де вивчав філософію, право, економіку і медицину. Серед його вчителів були фізик Філіпп Жоллі, патолог Людвіг фон Буль і хімік Юстус фон Лібіх. У 1872 році він отримав від університету звання почесного доктора медицини. Потім Карл Теодор продовжив свою освіту, вивчаючи офтальмологію у Відні та Цюриху. Засмучений смертю своєї дружини і війнами, він, попри невдоволення своєї сім'ї, покинув армію і став доктором, а через деякий час і успішним окулістом.
У 1874 році Карл Теодор вступив у другий шлюб з Марією Жозе, інфантою Португальської (1857—1943), дочкою поваленого короля Мігеля. У цьому шлюбі народилися п'ятеро спільних дітей.
У 1877 році він почав лікарську практику. У 1880 році відкрив очну клініку в своєму палаці, а в 1895 році — в Мюнхені. Його дружина часто допомагала йому як асистентка.
Карл Теодор помер 30 листопада 1909 року в Кройті, Баварія.
Родина
Дружина —Софія, принцеса Саксонською (1845—1867), дочкою короля Йоганна I.