Ботта спроєктував свою першу будівлю у шістнадцятилітньому віці, після чого навчався у Мілані та Венеції. Ще тоді він познайомився з Ле Корбюзьє і Луїсом Каном, які справили на нього значний вплив. Після закінчення університету Ботта відкрив архітектурне бюро, яке займалося будівництвом вілл. Великі замовлення почали надходити у 1980-х. Тоді Ботта спроєктував будівлі медіатеки у Віллербанні (1984—1988) та катедрального собору у Еврі під Парижем. Незадовго до цього він пробує себе і в дизайні.
Розквіт творчості Ботта припав на межу XX і XXI століть. В цей час він створив багато культових та культурних споруд, вільно змішуючи традиції античної та середньовічної архітектури зі знахідками сучасності, не забуваючи і про теоретичні побудови — у цей час він відвідував з лекціями безліч навчальних закладів у Європі та Америці. Серед створених за проєктами Ботта будівель — музеї у Сан-Франциско (1990—1994), Базелі (1993—1996) і Роверето (1988—2002), синагога в Тель-Авіві (1996—1998), бібліотека в Дортмунді (1995-99) і Бергамо (2004), церкви і каплиці в Монте-Тамаро (1990—1996) і Моньо (1986—1998).
Emilio Battisti Mario Botta: architetture e progetti negli anni 70. — Mailand: Electa, 1981. (італ.)
Harriet S. Bee Mario Botta: exhibition. — New York: MOMA, 1987. — ISBN 0-87070-258-0. (англ.)
Helena Bernal Mario Botta / Andreas Kotte // Theaterlexikon der Schweiz — Dizionario Teatrale Svizzero. Band 1 — , Zürich: Chronos 2005. — S. 251. — ISBN 3-0340-0715-9. (італ.)