Рибосомний білок S3

Рибосомний білок S3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WH9, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 3J7P, 4UJE, 4D5L, 3J7R, 4UJD, 4V5Z, 5FLX, 4D61, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS3, S3, ribosomal protein S3
Зовнішні ІД	OMIM: 600454 MGI: 1350917 HomoloGene: 779 GeneCards: RPS3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• tubulin binding; • DNA N-glycosylase activity; • small ribosomal subunit rRNA binding; • iron-sulfur cluster binding; • transcription factor binding; • oxidized purine DNA binding; • Hsp70 protein binding; • lyase activity; • enzyme binding; • mRNA binding; • structural constituent of ribosome; • damaged DNA binding; • ubiquitin-like protein conjugating enzyme binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • oxidized pyrimidine DNA binding; • endodeoxyribonuclease activity; • protein kinase binding; • supercoiled DNA binding; • DNA binding; • Hsp90 protein binding; • microtubule binding; • protein kinase A binding; • RNA binding; • kinase binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • class III/IV DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Полісома; • мембрана; • focal adhesion; • ruffle membrane; • мітохондрія; • цитоскелет; • клітинне ядро; • рибосома; • ядерце; • екзосома; • клітинна мембрана; • веретено поділу; • мітохондріальний матрикс; • small ribosomal subunit; • mitotic spindle; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • cytosolic small ribosomal subunit; • нуклеоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • ендоплазматичний ретикулум; • NF-kappaB complex; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • Рибонуклеопротеїни; • синапс;
Біологічний процес	• chromosome segregation; • positive regulation of endodeoxyribonuclease activity; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of microtubule polymerization; • клітинний цикл; • GO:0097285 апоптоз; • negative regulation of translation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • viral transcription; • response to TNF agonist; • positive regulation of apoptotic signaling pathway; • GO:0001306 response to oxidative stress; • transcription, DNA-templated; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • positive regulation of DNA N-glycosylase activity; • positive regulation of JUN kinase activity; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • negative regulation of DNA repair; • GO:1900404 positive regulation of DNA repair; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • поділ клітини; • spindle assembly; • negative regulation of protein ubiquitination; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • translational initiation; • regulation of translation; • cellular response to hydrogen peroxide; • Біосинтез білків; • positive regulation of base-excision repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • regulation of apoptotic process; • rRNA processing; • cytoplasmic translation; • positive regulation of protein-containing complex assembly; • positive regulation of interleukin-2 production; • positive regulation of activated T cell proliferation; • positive regulation of T cell receptor signaling pathway; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • cellular response to tumor necrosis factor;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6188
	27050
	ENSG00000149273
	ENSMUSG00000030744
	P23396
	P62908
	NM_001260507; NM_001005; NM_001256802; NM_001260506
	NM_012052
	NP_000996; NP_001243731; NP_001247435; NP_001247436
	NP_036182
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S3 (англ. Ribosomal protein S3) – білок, який кодується геном RPS3, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 26 688^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVQISKKRK	FVADGIFKAE	LNEFLTRELA	EDGYSGVEVR	VTPTRTEIII
LATRTQNVLG	EKGRRIRELT	AVVQKRFGFP	EGSVELYAEK	VATRGLCAIA
QAESLRYKLL	GGLAVRRACY	GVLRFIMESG	AKGCEVVVSG	KLRGQRAKSM
KFVDGLMIHS	GDPVNYYVDT	AVRHVLLRQG	VLGIKVKIML	PWDPTGKIGP
KKPLPDHVSI	VEPKDEILPT	TPISEQKGGK	PEPPAMPQPV	PTA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до ліаз, рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

Zhang X.T., Tan Y.M., Tan Y.H. (1990). Isolation of a cDNA encoding human 40S ribosomal protein s3. Nucleic Acids Res. 18: 6689—6689. PMID 2129557 doi:10.1093/nar/18.22.6689
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tycowski K.T., Shu M.D., Steitz J.A. (1993). A small nucleolar RNA is processed from an intron of the human gene encoding ribosomal protein S3. Genes Dev. 7: 1176—1190. PMID 8319909 doi:10.1101/gad.7.7a.1176
Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Human ribosomal protein S3 interacts with DNA base excision repair proteins hAPE/Ref-1 and hOGG1. Biochemistry. 43: 14211—14217. PMID 15518571 doi:10.1021/bi049234b
Hegde V., Wang M., Deutsch W.A. (2004). Characterization of human ribosomal protein S3 binding to 7,8-dihydro-8-oxoguanine and abasic sites by surface plasmon resonance. DNA Repair. 3: 121—126. PMID 14706345 doi:10.1016/j.dnarep.2003.10.004
Jang C.Y., Lee J.Y., Kim J. (2004). RpS3, a DNA repair endonuclease and ribosomal protein, is involved in apoptosis. FEBS Lett. 560: 81—85. PMID 14988002 doi:10.1016/S0014-5793(04)00074-2