Фрагмент Кленова

Функціональні домени фрагмента Кленова (зліва) та ДНК-полімерази I (зправа).

Фрагмент Кленова – білок, штучний ензим, який був отриманий контрольованим протеолітичним розщепленням ДНК-полімерази I, виділеної з E. coli за допомогою протеази субтілізину. Вперше отриманий в 1970 році,^[1] фрагмент Кленова зберігає 5' → 3'-полімеразну та 3’ → 5’-екзонуклеазну вихідної полімерази, тоді як 5' → 3'-екзонуклеазна активність відсутня.

Застосування

Оскільки 5' → 3'-екзонуклеазна активність ДНК-полімерази I з E. coli робить її малопридатною для багатьох застосувань, фрагмент Кленова, позбавлений цього недоліку, знайшов широке коло застосувань в молекулярній біології, а саме:

синтез дволанцюгової ДНК у пробірці із використанням одноланцюгової ДНК як матриці
Нарощення 3'-вкорочених кінців, щоб затупити липкі кінці з 5'-виступаючим фрагментом
Видалення 3'-виступаючих кінців
Приготування радіоактивних ДНК-зондів

Фрагмент Кленова використовувався також в найпершому оригінальному варіанті полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР),^[2] допоки не був замінений термостабільними аналогами, такими як Taq-полімераза.^[3]

exo- фрагмент Кленова

Якщо 3' → 5'-екзонуклеазна активність фрагмента Кленова є небажаною, її можна позбутись точковим мутагенезом. Ензим, що утворюється в результаті, має лише 5' → 3'-полімеразну активність, без будь-якої екзонуклеазної (5' → 3' і 3' → 5'). Він отримав назву exo- фрагмент Кленова.

exo- фрагмент Кленова використовується в деяких реакціях флуоресцентного мічення для ДНК-мікромасивів.

Див. також

ДНК-полімераза I

Посилання

↑ Klenow H and Henningsen I (1970). Selective Elimination of the Exonuclease Activity of the Deoxyribonucleic Acid Polymerase from Escherichia coli B by Limited Proteolysis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Т. 65, № 1. с. 168—175. doi:10.1073/pnas.65.1.168. PMC 286206. PMID 4905667.
↑ Saiki RK та ін. (1985). Enzymatic Amplification of β-globin Genomic Sequences and Restriction Site Analysis for Diagnosis of Sickle Cell Anemia. Science. Т. 230. с. 1350—54. doi:10.1126/science.2999980. PMID 2999980.
↑ Saiki та ін. (1988). Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Science. Т. 239. с. 487—91. doi:10.1126/science.2448875. PMID 2448875.

[1] Klenow H and Henningsen I (1970). Selective Elimination of the Exonuclease Activity of the Deoxyribonucleic Acid Polymerase from Escherichia coli B by Limited Proteolysis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. Т. 65, № 1. с. 168—175. doi:10.1073/pnas.65.1.168. PMC 286206. PMID 4905667.

[Saiki1-2] Saiki RK та ін. (1985). Enzymatic Amplification of β-globin Genomic Sequences and Restriction Site Analysis for Diagnosis of Sickle Cell Anemia. Science. Т. 230. с. 1350—54. doi:10.1126/science.2999980. PMID 2999980.

[Saiki3-3] Saiki та ін. (1988). Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Science. Т. 239. с. 487—91. doi:10.1126/science.2448875. PMID 2448875.

[1]

[2]

[3]

Фрагмент Кленова

Застосування

exo- фрагмент Кленова

Див. також

Посилання

Portal di Ensiklopedia Dunia