У 1997 році закінчив Військово-повітряну інженерну академію імені Жуковського за фахом «льотчик-інженер-дослідник».
У 2010 році закінчив Російську академію державної служби при Президенті Російської Федерації за фахом «Юриспруденція»
Досвід роботи
З 1997 по 1998 рік — служба в стройовій частині ВПС в Калузькій області.
З 1998 року — старший льотчик-інструктор пілотажної групи «Небесні гусари» Центру показу авіаційної техніки ВПС, потім — командир ескадрильї авіаполку ВПС в місті КубинкаМосковської області. Літає на літаках Л-39 і МіГ-29. 29 травня 2003 року рішенням Міжвідомчої комісії з відбору космонавтів був зарахований до загону космонавтів для проходження загальнокосмічної підготовки. Є 521-м космонавтом світу і 111-м космонавтом Росії.
З 16 червня 2003 року по 28 червня 2005 року пройшов курс загальнокосмічної підготовки і 5 липня 2005 року рішенням Міжвідомчої кваліфікаційної комісії йому присвоєно кваліфікацію «космонавт-випробувач».
У липні 2008 року з'явилися повідомлення про його призначення в дублюючий екіпаж 22-й експедиції на МКС. 21 вересня 2008 це призначення було підтверджено в опублікованому пресслужбою Роскосмоса плані польотів на МКС.
У липні 2009 року з'явилася інформація про його призначення в дублюючий екіпаж 27-ї експедиції і про можливість його призначення в основний екіпаж 29-ї експедиції на МКС. 7 жовтня 2009 року це призначення було підтверджено НАСА (прес-реліз № 09-233).
У листопаді 2009 року пройшов клініко-фізіологічне обстеження і на засіданні ГМК 19 листопада 2009 був визнаний придатним до космічного польоту. 19 грудня 2009 року Міжвідомчою комісією затверджено командиром дублюючого екіпажу корабля «Союз ТМА-17» і члена 22/23-й основних екіпажів МКС.
Під час старту ТК «Союз ТМА-17» 21 грудня 2009 року був дублером командира корабля. На засіданні Міжвідомчої комісії з відбору космонавтів і їх призначенням до складу пілотованих кораблів і станцій 26 квітня 2010 року було атестовано як космонавт загону ФГБУ «НДІ ЦПК імені Ю. А. Гагаріна».
Був призначений в довготривалі екіпажі МКС-29 і МКС-30.
У 2021 році призначений до складу екіпажів МКС-66/МКС-67. Старт ТПК «Союз МС-19» з учасниками проекту «Виклик» (зйомка фільму у космосі) в складі МКС-66 успішно здійснений 5 жовтня 2021 року.
Екіпаж корабля "Союз ТМА-15М" на МКС. Антон праворуч.
У серпні 2017 в Зоряному містечку в Росії, незадовго до польоту Союз МС-05, у якому Шкаплеров був дублером.
Перший раз стартував 14 листопада2011 року командиром космічного корабля «Союз ТМА-22» і бортінженера екіпажу МКС за програмою 29-ї і 30-ї основної космічної експедиції. Політ завершений 28 квітня 2012 року — спуск ТПК «Союз-ТМА»[3][4].
Другий раз стартував 24 листопада2014 року командиром космічного корабля «Союз ТМА-15М». Політ завершений 11 червня 2015 року — спуск ТПК «Союз-ТМА».[5]
орден «За заслуги перед Вітчизною» IV ступеня (26 січня2017 року) — за мужність і високий професіоналізм, проявлені при здійсненні тривалого космічного польоту на Міжнародній космічній станції[10];
медалі Міністерства оборони Російської Федерації: «За військову доблесть» II ступеня, «За зміцнення бойової співдружності», «За відзнаку у військовій службі» I, II, III ступеня, «За службу у Військово-повітряних силах», «100 років Військово повітряним силам»;
медаль Олексія Леонова (Кемеровська область, 2015) — за здійснений в 2011 році вихід у відкритий космос[11];
знак преподобного Сергія Радонезького (Московська область, 15 січня2021 року) — за особливо плідну державну, благодійну та громадську діяльність на благо Московської області[12];
Космонавт 1-го класу (14.08.2018, «За зразкове виконання пілотованих космічних польотів за програмою МКС, а також відповідно до Положення про космонавтів РФ»)[13];
з 9 березня2013 року почесний громадянин міста Гагарін «за великі заслуги в області дослідження, освоєння і використання космічного простору, багаторічну сумлінну працю, активну громадську діяльність, продовження зоряного подвигу Юрія Олексійовича Гагаріна»[14].