ATR (ген)

ATR
Ідентифікатори
Символи	ATR, ATR serine/threonine kinase, FCTCS, FRP1, MEC1, SCKL, SCKL1
Зовнішні ІД	OMIM: 601215 MGI: 108028 HomoloGene: 96916 GeneCards: ATR
Реагує на сполуку
	dactolisib
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • kinase activity; • MutSalpha complex binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • MutLalpha complex binding; • ATP binding; • protein serine/threonine kinase activity;
Клітинна компонента	• PML body; • комплекс Ґольджі; • нуклеоплазма; • хромосома; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• interstrand cross-link repair; • фосфорилювання; • establishment of protein-containing complex localization to telomere; • replicative senescence; • cellular response to UV; • DNA damage checkpoint signaling; • positive regulation of telomerase catalytic core complex assembly; • negative regulation of DNA replication; • positive regulation of telomere maintenance via telomerase; • protein localization to chromosome, telomeric region; • multicellular organism development; • реплікація ДНК; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • cellular response to gamma radiation; • regulation of cellular response to heat; • protein autophosphorylation; • positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • GO:0100026 Репарація ДНК; • establishment of RNA localization to telomere; • cellular response to DNA damage stimulus; • telomere maintenance; • regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	545
	245000
	ENSG00000175054
	ENSMUSG00000032409
	Q13535
	Q9JKK8
	NM_001184; NM_001354579
	NM_019864
	NP_001175; NP_001341508
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ATR (англ. ATR serine/threonine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 644 амінокислот, а молекулярна маса — 301 367^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEHGLELAS	MIPALRELGS	ATPEEYNTVV	QKPRQILCQF	IDRILTDVNV
VAVELVKKTD	SQPTSVMLLD	FIQHIMKSSP	LMFVNVSGSH	EAKGSCIEFS
NWIITRLLRI	AATPSCHLLH	KKICEVICSL	LFLFKSKSPA	IFGVLTKELL
QLFEDLVYLH	RRNVMGHAVE	WPVVMSRFLS	QLDEHMGYLQ	SAPLQLMSMQ
NLEFIEVTLL	MVLTRIIAIV	FFRRQELLLW	QIGCVLLEYG	SPKIKSLAIS
FLTELFQLGG	LPAQPASTFF	SSFLELLKHL	VEMDTDQLKL	YEEPLSKLIK
TLFPFEAEAY	RNIEPVYLNM	LLEKLCVMFE	DGVLMRLKSD	LLKAALCHLL
QYFLKFVPAG	YESALQVRKV	YVRNICKALL	DVLGIEVDAE	YLLGPLYAAL
KMESMEIIEE	IQCQTQQENL	SSNSDGISPK	RRRLSSSLNP	SKRAPKQTEE
IKHVDMNQKS	ILWSALKQKA	ESLQISLEYS	GLKNPVIEML	EGIAVVLQLT
ALCTVHCSHQ	NMNCRTFKDC	QHKSKKKPSV	VITWMSLDFY	TKVLKSCRSL
LESVQKLDLE	ATIDKVVKIY	DALIYMQVNS	SFEDHILEDL	CGMLSLPWIY
SHSDDGCLKL	TTFAANLLTL	SCRISDSYSP	QAQSRCVFLL	TLFPRRIFLE
WRTAVYNWAL	QSSHEVIRAS	CVSGFFILLQ	QQNSCNRVPK	ILIDKVKDDS
DIVKKEFASI	LGQLVCTLHG	MFYLTSSLTE	PFSEHGHVDL	FCRNLKATSQ
HECSSSQLKA	SVCKPFLFLL	KKKIPSPVKL	AFIDNLHHLC	KHLDFREDET
DVKAVLGTLL	NLMEDPDKDV	RVAFSGNIKH	ILESLDSEDG	FIKELFVLRM
KEAYTHAQIS	RNNELKDTLI	LTTGDIGRAA	KGDLVPFALL	HLLHCLLSKS
ASVSGAAYTE	IRALVAAKSV	KLQSFFSQYK	KPICQFLVES	LHSSQMTALP
NTPCQNADVR	KQDVAHQREM	ALNTLSEIAN	VFDFPDLNRF	LTRTLQVLLP
DLAAKASPAA	SALIRTLGKQ	LNVNRREILI	NNFKYIFSHL	VCSCSKDELE
RALHYLKNET	EIELGSLLRQ	DFQGLHNELL	LRIGEHYQQV	FNGLSILASF
ASSDDPYQGP	RDIISPELMA	DYLQPKLLGI	LAFFNMQLLS	SSVGIEDKKM
ALNSLMSLMK	LMGPKHVSSV	RVKMMTTLRT	GLRFKDDFPE	LCCRAWDCFV
RCLDHACLGS	LLSHVIVALL	PLIHIQPKET	AAIFHYLIIE	NRDAVQDFLH
EIYFLPDHPE	LKKIKAVLQE	YRKETSESTD	LQTTLQLSMK	AIQHENVDVR
IHALTSLKET	LYKNQEKLIK	YATDSETVEP	IISQLVTVLL	KGCQDANSQA
RLLCGECLGE	LGAIDPGRLD	FSTTETQGKD	FTFVTGVEDS	SFAYGLLMEL
TRAYLAYADN	SRAQDSAAYA	IQELLSIYDC	REMETNGPGH	QLWRRFPEHV
REILEPHLNT	RYKSSQKSTD	WSGVKKPIYL	SKLGSNFAEW	SASWAGYLIT
KVRHDLASKI	FTCCSIMMKH	DFKVTIYLLP	HILVYVLLGC	NQEDQQEVYA
EIMAVLKHDD	QHTINTQDIA	SDLCQLSTQT	VFSMLDHLTQ	WARHKFQALK
AEKCPHSKSN	RNKVDSMVST	VDYEDYQSVT	RFLDLIPQDT	LAVASFRSKA
YTRAVMHFES	FITEKKQNIQ	EHLGFLQKLY	AAMHEPDGVA	GVSAIRKAEP
SLKEQILEHE	SLGLLRDATA	CYDRAIQLEP	DQIIHYHGVV	KSMLGLGQLS
TVITQVNGVH	ANRSEWTDEL	NTYRVEAAWK	LSQWDLVENY	LAADGKSTTW
SVRLGQLLLS	AKKRDITAFY	DSLKLVRAEQ	IVPLSAASFE	RGSYQRGYEY
IVRLHMLCEL	EHSIKPLFQH	SPGDSSQEDS	LNWVARLEMT	QNSYRAKEPI
LALRRALLSL	NKRPDYNEMV	GECWLQSARV	ARKAGHHQTA	YNALLNAGES
RLAELYVERA	KWLWSKGDVH	QALIVLQKGV	ELCFPENETP	PEGKNMLIHG
RAMLLVGRFM	EETANFESNA	IMKKYKDVTA	CLPEWEDGHF	YLAKYYDKLM
PMVTDNKMEK	QGDLIRYIVL	HFGRSLQYGN	QFIYQSMPRM	LTLWLDYGTK
AYEWEKAGRS	DRVQMRNDLG	KINKVITEHT	NYLAPYQFLT	AFSQLISRIC
HSHDEVFVVL	MEIIAKVFLA	YPQQAMWMMT	AVSKSSYPMR	VNRCKEILNK
AIHMKKSLEK	FVGDATRLTD	KLLELCNKPV	DGSSSTLSMS	THFKMLKKLV
EEATFSEILI	PLQSVMIPTL	PSILGTHANH	ASHEPFPGHW	AYIAGFDDMV
EILASLQKPK	KISLKGSDGK	FYIMMCKPKD	DLRKDCRLME	FNSLINKCLR
KDAESRRREL	HIRTYAVIPL	NDECGIIEWV	NNTAGLRPIL	TKLYKEKGVY
MTGKELRQCM	LPKSAALSEK	LKVFREFLLP	RHPPIFHEWF	LRTFPDPTSW
YSSRSAYCRS	TAVMSMVGYI	LGLGDRHGEN	ILFDSLTGEC	VHVDFNCLFN
KGETFEVPEI	VPFRLTHNMV	NGMGPMGTEG	LFRRACEVTM	RLMRDQREPL
MSVLKTFLHD	PLVEWSKPVK	GHSKAPLNET	GEVVNEKAKT	HVLDIEQRLQ
GVIKTRNRVT	GLPLSIEGHV	HYLIQEATDE	NLLCQMYLGW	TPYM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Cimprich K.A., Shin T.B., Keith C.T., Schreiber S.L. (1996). cDNA cloning and gene mapping of a candidate human cell cycle checkpoint protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 2850—2855. PMID 8610130 doi:10.1073/pnas.93.7.2850
Schmidt D.R., Schreiber S.L. (1999). Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4. Biochemistry. 38: 14711—14717. PMID 10545197 doi:10.1021/bi991614n
Kim S.-T., Lim D.-S., Canman C.E., Kastan M.B. (1999). Substrate specificities and identification of putative substrates of ATM kinase family members. J. Biol. Chem. 274: 37538—37543. PMID 10608806 doi:10.1074/jbc.274.53.37538
Hall-Jackson C.A., Cross D.A.E., Morrice N., Smythe C. (1999). ATR is a caffeine-sensitive, DNA-activated protein kinase with a substrate specificity distinct from DNA-PK. Oncogene. 18: 6707—6713. PMID 10597277 doi:10.1038/sj.onc.1203077
Ward I.M., Chen J. (2001). Histone H2AX is phosphorylated in an ATR-dependent manner in response to replicational stress. J. Biol. Chem. 276: 47759—47762. PMID 11673449 doi:10.1074/jbc.C100569200
Cortez D., Guntuku S., Qin J., Elledge S.J. (2001). ATR and ATRIP: partners in checkpoint signaling. Science. 294: 1713—1716. PMID 11721054 doi:10.1126/science.1065521