DNM1L

DNM1L
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3W6N, 3W6O, 3W6P, 4BEJ, 4H1U, 4H1V
Ідентифікатори
Символи	DNM1L, DLP1, DRP1, DVLP, DYMPLE, EMPF, HDYNIV, dynamin 1-like, dynamin 1 like, EMPF1, OPA5
Зовнішні ІД	OMIM: 603850 MGI: 1921256 HomoloGene: 6384 GeneCards: DNM1L
Пов'язані генетичні захворювання
	lethal encephalopathy due to mitochondrial and peroxisomal fission defect, атрофія зорового нерва
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • protein homodimerization activity; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • identical protein binding; • hydrolase activity; • ubiquitin protein ligase binding; • lipid binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • GTP-dependent protein binding; • microtubule binding; • clathrin binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • BH2 domain binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • microtubule cytoskeleton; • пероксисома; • синапс; • synaptic vesicle membrane; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • міжклітинні контакти; • мітохондрія; • brush border; • perinuclear region of cytoplasm; • clathrin-coated pit; • мікротрубочка; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • система ендомембран; • endoplasmic reticulum membrane; • Golgi membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондріальна мембрана; • GO:0009327 protein-containing complex; • postsynapse; • presynaptic endocytic zone membrane; • mitochondrion-derived vesicle; • secretory vesicle;
Біологічний процес	• mitochondrial fragmentation involved in apoptotic process; • regulation of ATP metabolic process; • positive regulation of mitochondrial fission; • ендоцитоз; • cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis; • mitochondrial fission; • regulation of mitochondrion organization; • regulation of protein oligomerization; • regulation of peroxisome organization; • membrane fusion; • peroxisome fission; • regulation of autophagy of mitochondrion; • positive regulation of protein secretion; • positive regulation of apoptotic process; • protein localization to mitochondrion; • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria; • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз; • dynamin family protein polymerization involved in mitochondrial fission; • heart contraction; • mitochondrion morphogenesis; • protein homotetramerization; • mitochondrial membrane fission; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • release of cytochrome c from mitochondria; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • protein complex oligomerization; • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть; • mitochondrion organization; • endoplasmic reticulum organization; • apoptotic mitochondrial changes; • negative regulation of mitochondrial fusion; • synaptic vesicle recycling via endosome; • intracellular distribution of mitochondria; • synaptic vesicle endocytosis; • protein homooligomerization; • positive regulation of dendritic spine morphogenesis; • cellular response to lipid; • cellular response to oxygen-glucose deprivation; • execution phase of apoptosis; • positive regulation of synaptic vesicle endocytosis; • response to flavonoid; • response to hypobaric hypoxia; • positive regulation of synaptic vesicle exocytosis; • calcium ion transport; • регуляція експресії генів; • GO:1903834 regulation of ubiquitin protein ligase activity; • ритмічний процес;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10059
	74006
	ENSG00000087470
	ENSMUSG00000022789
	O00429
	Q8K1M6
NM_001278463; NM_001278464; NM_001278465; NM_001278466; NM_005690;
	NM_012062; NM_012063; NM_001330380
NM_001025947; NM_001276340; NM_001276341; NM_152816; NM_001360007;
	NM_001360008; NM_001360009; NM_001360010
NP_001265392; NP_001265393; NP_001265394; NP_001265395; NP_001317309;
	NP_005681; NP_036192; NP_036193
NP_001021118; NP_001263269; NP_001263270; NP_690029; NP_001346936;
	NP_001346937; NP_001346938; NP_001346939; NP_001392181; NP_001392182; NP_001392183; NP_001392184; NP_001392185; NP_001392186; NP_001392187; NP_001392188; NP_001392189; NP_001392190; NP_001392191; NP_001392192; NP_001392193; NP_001392194
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DNM1L (англ. Dynamin 1 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 736 амінокислот, а молекулярна маса — 81 877^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEALIPVINK	LQDVFNTVGA	DIIQLPQIVV	VGTQSSGKSS	VLESLVGRDL
LPRGTGIVTR	RPLILQLVHV	SQEDKRKTTG	EENGVEAEEW	GKFLHTKNKL
YTDFDEIRQE	IENETERISG	NNKGVSPEPI	HLKIFSPNVV	NLTLVDLPGM
TKVPVGDQPK	DIELQIRELI	LRFISNPNSI	ILAVTAANTD	MATSEALKIS
REVDPDGRRT	LAVITKLDLM	DAGTDAMDVL	MGRVIPVKLG	IIGVVNRSQL
DINNKKSVTD	SIRDEYAFLQ	KKYPSLANRN	GTKYLARTLN	RLLMHHIRDC
LPELKTRINV	LAAQYQSLLN	SYGEPVDDKS	ATLLQLITKF	ATEYCNTIEG
TAKYIETSEL	CGGARICYIF	HETFGRTLES	VDPLGGLNTI	DILTAIRNAT
GPRPALFVPE	VSFELLVKRQ	IKRLEEPSLR	CVELVHEEMQ	RIIQHCSNYS
TQELLRFPKL	HDAIVEVVTC	LLRKRLPVTN	EMVHNLVAIE	LAYINTKHPD
FADACGLMNN	NIEEQRRNRL	ARELPSAVSR	DKSSKVPSAL	APASQEPSPA
ASAEADGKLI	QDSRRETKNV	ASGGGGVGDG	VQEPTTGNWR	GMLKTSKAEE
LLAEEKSKPI	PIMPASPQKG	HAVNLLDVPV	PVARKLSARE	QRDCEVIERL
IKSYFLIVRK	NIQDSVPKAV	MHFLVNHVKD	TLQSELVGQL	YKSSLLDDLL
TESEDMAQRR	KEAADMLKAL	QGASQIIAEI	RETHLW

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ліпідами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, мітохондрії, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, пероксисомах, апараті гольджі, синапсах.

Література

Shin H.-W., Shinotsuka C., Torii S., Murakami K., Nakayama K. (1997). Identification and subcellular localization of a novel mammalian dynamin-related protein homologous to yeast Vps1p and Dnm1p. J. Biochem. 122: 525—530. PMID 9348079 doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021784
Hong Y.-R., Chen C.-H., Cheng D.-S., Howng S.-L., Chow C.-C. (1998). Human dynamin-like protein interacts with the glycogen synthase kinase 3beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 249: 697—703. PMID 9731200 doi:10.1006/bbrc.1998.9253
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Yoon Y., Pitts K.R., Dahan S., McNiven M.A. (1998). A novel dynamin-like protein associates with cytoplasmic vesicles and tubules of the endoplasmic reticulum in mammalian cells. J. Cell Biol. 140: 779—793. PMID 9472031 doi:10.1083/jcb.140.4.779
Smirnova E., Shurland D.-L., Ryazantsev S.N., van der Bliek A.M. (1998). A human dynamin-related protein controls the distribution of mitochondria. J. Cell Biol. 143: 351—358. PMID 9786947 doi:10.1083/jcb.143.2.351
Smirnova E., Griparic L., Shurland D.-L., van der Bliek A.M. (2001). Dynamin-related protein Drp1 is required for mitochondrial division in mammalian cells. Mol. Biol. Cell. 12: 2245—2256. PMID 11514614 doi:10.1091/mbc.12.8.2245