IS-елементи

IS-елементи або інсерційні елементи (від англ. insertion sequences) — короткі ділянки ДНК, що діють як прості мобільні генетичні елементи. IS-елементи мають дві головні характеристики: вони менші за решту типів мобільних генетичних елементів (зазвичай від 700 до 2500 пар основ завдовжки) та кодують лише білки, залучені в процес транспозиції (на відміну від транспозонів, що зазвичай несуть допоміжні гени, корисні для організму-хазяїна, такі як гени резистентності). Цими білками зазвичай є транспозаза, яка каталізує процес транспозиції даного IS-елементу, і регуляторний білок, що стимулює або інгібує цю активність. По боках кодуючої ділянки IS-елементу зазвичай розташовуються інвертовані повтори.

Наприклад, відомий IS911 (1250 пар основ) обрамлений двома інвертованими повторами 36 пар основ завдовжки, між якими знаходяться гени orfA і orfAB, що майже перекриваються та кодують транспозазу (OrfAB) і регуляторний білок (OrfA)^[1].

Найчастіше IS-елементи називають у формі ISn, де n — натуральне число (тобто IS1, IS2, IS3, IS10, IS50, IS911 тощо); проте існують і інші схеми найменування. Хоча переважна більшість IS-елементів знайдена в геномах прокаріотів, кілька еукаріотичних послідовностей родини мобільних генетичних елементів Tc1/mariner можуть розглядатися як IS-елементи^[2].

IS-елементи можуть траплятися як поодинці, так і у складі композитних (складних) транспозонів; в такому випадку два IS-елементи обрамляють один або більше допоміжних генів, наприклад генів резистентності (наприклад, Tn10, Tn5). Це не є єдиними типом транспозонів, існують і одиничні транспозони, що не містять IS-елементів (наприклад, Tn7).

Посилання

↑ IS3 family: IS911. Архів оригіналу за 25 листопада 2008. Процитовано 20 січня 2009. [Архівовано 2008-11-25 у Wayback Machine.]
↑ Mahillon J, Chandler M (1998). Insertion sequences. Microbiol Mol Biol Rev. 62 (3): 725—74. PMID 9729608. Архів оригіналу за 31 березня 2009. Процитовано 20 січня 2009.

Література

Campbell, Neil A. and Reece, Jane B. (2002). Biology (6th ed.), pp. 345—346. San Francisco: Benjamin Cummings. ISBN 0-8053-6624-5.
Mahillon, Jacques and Chandler, Michael (1998). «Insertion sequences» [Архівовано 31 березня 2009 у Wayback Machine.]. Microbiology and Molecular Biology Reviews 62 (3), 725—774. Retrieved January 11, 2006.
Prescott, Lansing M.; Harley, John P.; and Klein, Donald A. (2002). Microbiology (5th ed.), pp. 298—299. New York: McGraw-Hill. ISBN 0-07-232041-9.
Shuler, Michael L. and Kargi, Fikret (2002). Bioprocess Engineering: Basic Concepts (2nd ed.), p. 220. Upper Saddle River, NJ: Prentice Hall PTR. ISBN 0-13-081908-5.