від здавлено-кулястого до коротко-циліндричного, 5 см заввишки і в діаметрі, (Хант стверджує до 10 см заввишки, 7 см в діаметрі в природних умовах), з віком стають трохи подовженими, бічні пагони з'єднані з основою дуже незначною, маленькою крапкою.
від зеленого до зеленувато-коричневого кольору c фіолетовим відтінком (за даними К. Марсдена «Книга кактусів» — епідерміс яскраво-листяно-зелений, коли росте в приміщенні — темніший, коли зростає на відкритому повітрі — стає яскраво-червоно пурпуровим при прямому сонці).
(соски) короткі, широкі, конічні, м'які, часто стають червонуватого або багрянистого відтінку, без молочного соку, 6-7 мм завдовжки, 8-9 мм шириною біля основи.
з рідкісними щетинками (в описі Пілбіма без щетинок; за даними К. Марсдена «Книга кактусів» аксили з білою шерстю, але без щетинок) і невеликою кількістю пуху.
2-6 (за даними К. Марсдена «Книга кактусів» — зазвичай 4, але може бути 2-6), голчасті, строкато-коричневі до майже чорних на кінцях, 8-12 мм завдовжки, 1-2 довше і з гачками на кінці.
Радіальні колючки
12-15 (за даними К. Марсдена «Книга кактусів» — 13-15), тонкі, прямі, голчасті, жорсткі, гладкі, білі або жовті, з більш темними коричневими кінцями, завдовжки 6-8 мм.
великі, подносовидної форми, темно-жовтого відтінку, 20-25 мм завдовжки, до 30 мм в діаметрі, нитки тичинок помаранчеві. Квіти Mammillaria beneckei відрізняються від інших видів Mammillaria і це одна з причин її розміщення в окремому підроді Oehmea.
дуже велике, 2,5 мм завдовжки, темно-коричневе (за даними К. Марсдена «Книга кактусів» — чорне, блискуче, 3 мм завдовжки, 2 мм в діаметрі — незвично великі для роду Mammillaria), нерівне.