Tay vợt hai lần đương kim vô địch Roger Federer đánh bại Andy Roddick trong trận chung kết, 6–2, 4–6, 7–5, 6–1 để giành chức vô địch Đơn nam tại Giải quần vợt Mỹ Mở rộng 2006.
Đây là kì Grand Slam cuối cùng của Andre Agassi. Anh thi đấu trận cuối cùng trước Benjamin Becker và bỏ cuộc sau khi nhà vô địch tương lai Juan Martín del Potro có lần ra mắt đầu tiên. Đây cũng là kì Grand Slam đầu tiên mà tay vợt số 1 thế giới Novak Djokovic và Andy Murray được xếp hạt giống. Tương ứng xếp hạng 20 và 17.
Hạt giống
Các tay vợt xếp hạt giống được liệt kê bên dưới. Tay vợt thất bại được liệt kê vòng mà họ ra ngoài đường.