魔法少女小圓漫畫作品 是日本電視動畫 《魔法少女小圓 》衍生的日本漫畫 系列。
迄2015年，芳文社 已依次出版的正篇、正篇衍生外傳 （〜The different story〜；魔獸篇）、正篇續作（新篇）以及4部獨立外傳。日本總銷售量在2011年5月已累積超過160萬本[ 1] [ 2] 單行本 均由東立出版社 代理，在臺灣 、香港 兩地出版[ 3]
《魔法少女小圓 》（日语：魔法少女まどか☆マギカ ）的漫画化（日语：コミカライズ ）作品，相對於外傳漫畫可謂「正篇」。故事原案：Magica Quartet，绘画：ハノカゲ ，連載於2011年2月12日至5月30日，單行本 全3冊。故事情节基本上与原作電視動畫 相同，但部分內容比起原作，更接近虛淵玄 與蒼樹梅 的本意[ 4]
本作劇本 化之前的台詞被忠實重現，但因媒體 特性，漫畫未能反映原作中的若干設定。此外，基於同一劇本所創作的漫畫、電視動畫2種版本各有其取捨追加，發揮了相互補充的作用[ 4] [ 5] 雜誌 的報導以及作者 的Twitter 皆有提及，以下為列舉：
魔法少女們的武器 形狀、攻擊手段皆有異同[ 5] 曉美焰 的盾 變成菱形 ，美樹沙耶香 手持沒有拳套的雙刃直劍，佐倉杏子 的長槍 呈十字架 形狀，結局中鹿目圓 的弓 呈翅膀 狀[ 4]
戰鬥的描寫皆由漫畫獨創，因劇本並未著墨於此。
原作中丘比為面無表情、皮笑肉不笑的外觀，漫畫中則具有豐富可愛的表情變化，但那只是為了與人類自然溝通所做出的偽裝，在真面目被揭穿後，則用瞳孔變色加上奸笑呈現其本性。
原作曉美焰在因鹿目圓的願望而重組的世界中的髮型跟重組前一樣，只是髮飾換成鹿目圓給的髮帶，漫畫中則是把髮型換成雙馬尾。
結局內容不同。原作被片尾曲分開的B-PART與C-PART橋段在漫畫中合而為一，並增加了圓與焰約定永恆友情 的劇情。
第1冊封面左上角印有馬丁·路德·金 的名言：「黑暗不能驅除黑暗，只有光明可以做到；仇恨不能驅除仇恨，只有愛可以做到。（Darkness cannot drive out darkness; only light can do that. Hate cannot drive out hate; only love can do that.）」
第2冊、第3冊封面左上角均印有本作其中一段劇情概要：「她還不知道這份邂逅是偶然還是必然，但這相遇將會改變她的命運...（She will not know yet if this encounter is a mere coincidence or a necessity. Which would be, an encounter that would change her destiny——）」
《劇場版 魔法少女小圓［新篇］叛逆的物語
《魔法少女小圓~The different story~ 》（日语：魔法少女まどか☆マギカ 〜The different story〜 ），正篇漫画的不同時間軸之版本，2012年8月9日在《MANGA TIME KIRARA MAGICA》第2期开始連載，单行本全3册。
不同於原作 、正篇漫畫的鹿目圓 視角，本书以巴麻美 为中心，讲述麻美与佐倉杏子 從相识、不和到分离的故事。情节由原作BD第5輯的广播剧 “Farewell Story（告别的故事）”改编而成。本書改採麻美在原作第3話生還的設定，立足於此展開獨創的故事。作畫也以原作、正篇為依據。
東立出版社 在本書中文版第1冊初版的書腰上，使用「假如學姊頭沒斷 」做為宣傳噱頭。
巴麻美是獨自一人在見瀧原町討伐魔女的魔法少女 ，某一天，相鄰的風見野町的魔法少女佐倉杏子來到此地。某次遭遇戰之後，杏子請求麻美收自己為徒，2人開始搭擋共同行動。然而，杏子的牧師 父親 偶然得知魔法少女的真相，成為佐倉家崩潰的發端。杏子特有的幻惑魔法 也變得無法使用。家破人亡促使杏子改變想法，進而與麻美對立，分道揚鑣。
一段時日後，麻美在鹿目圓的通知下進入結界討伐零食魔女 ，陷入危機之際因美樹沙耶香 參戰得而解圍，於是3人開始共同行動。此時回到見瀧原町的杏子，為討伐魔女之夜，與曉美焰 暗中結盟......
佐倉杏子結識巴麻美早於鹿目圓、美樹沙耶香。
原作故事開始前，麻美曾從魔女手中拯救杏子，因此杏子向麻美拜師，組成雙人搭檔在見瀧原市行動。
而後佐倉家遭逢變故，兩人因理念不合分道揚鑣。 巴麻美在家庭遭遇死亡車禍時，與丘比締結「維繫自身生命」的契約。
體現為發射緞帶 的魔法。
事後對於當下未許願拯救家人的性命感到懊悔。
初次戰鬥後，接受魔法少女的使命，並決定將魔法用於拯救人命。
多數魔法少女僅為自身利益行動，麻美的無私作風被視為異類，因此內心十分渴望同伴。 佐倉杏子深信父親的理念能為世界帶來幸福，希望世人能聆聽父親傳道，而與丘比締結契約。
體現為「幻惑魔法」，可製造分身 影像迷惑對手。
被麻美命名為「Rosso Fantasma（紅幽靈）」。
家庭遭逢變故後無法使用，丘比歸因於杏子潛意識不再相信當初許下的願望，並拒絕因願望而生的能力。故在原作時間點已遺忘用法。
雖與麻美決裂，內心仍渴望修復關係，認為若未結識麻美，在家庭變故後很可能已經魔女化。 眾人在本次輪迴中所迎來的結局：
沙耶香變為人魚魔女，得知魔法少女殘酷真相的麻美心靈受創，打算進入結界與其同歸於盡。
杏子為阻止麻美尋死，兩人大打出手，杏子慘勝。
杏子獨自進入結界擊敗人魚魔女，隨後將取得的悲嘆之種為麻美淨化靈魂寶石，杏子則因耗盡魔力，在與其他魔女戰鬥時敗北身亡。
在與圓的深談中，麻美坦言自己不願再與魔女戰鬥，圓下定決心成為魔法少女，接替麻美守護城市的使命。
圓以復活魔法少女沙耶加為願望，向丘比締約。
留下託付後，麻美選擇摧毀靈魂寶石來結束生命。
故事最終，焰、圓與沙耶加三人一同迎戰來犯的魔女之夜。
《魔法少女小圓［魔獸篇］ 》（日语：魔法少女まどか☆マギカ［魔獣編］ ），是ハノカゲ 繪製繪製的官方同人漫畫，2015年6月10日在《MANGA TIME KIRARA MAGICA》第20期开始連載。故事發生於原作 最終話的B-PART到C-PART之間（以片尾曲切割的兩部份），描寫魔法少女在「圓環之理」重構的世界中，討伐魔獸的故事。根據結局，故事解釋了美樹沙耶香 死亡到曉美焰 於沙漠戰鬥之間的事情。
在原作結局中，美樹沙耶香 因打敗魔獸力竭而亡，其對手為涅槃魔獸（最強的魔獸），而非在原作現身的普通魔獸。[ 註 3]
在原作結局中，曉美焰 獲得的新魔法為「記憶操縱」，[ 註 4]
魔獸共有4種型態，皆以人類（包括魔法少女）的正負面感情為食糧，會吸收魔法少女的魔力，其餘共通點繼承原作（持有小型立方體形狀的悲嘆之種、沒有眷屬、群體行動）。能力由低至高分別為：[ 9] 魔獸（普通）：原作結局已登場，外表像一群剃髮的男性僧侶，看不出個體差異。攻擊手段為鐳射光。
修道魔獸：本作初登場，外表呈盤腿坐姿，手持燃燒的短槍，全身滾燙呈漂浮狀。攻擊手段為掌心射出銅劍，揮舞短槍。
悟道魔獸：本作初登場，外表是破碎的男性上半身，無頭無手，環繞破碎的方塊狀內臟與幾何狀器官，周身漂浮。攻擊手段是投擲內臟、並使物質發生乾燥、風化、腐蝕與解體現象。
涅槃魔獸：本作初登場，被巴麻美 稱為「大型魔獸」，外表是完全的幾何造型，環繞更多的方塊，周身漂浮。攻擊手段不明，一擊就能打破佐倉杏子 的「穿針引線」結界。
《魔法少女小織 》（日语：魔法少女おりこ☆マギカ ），是ムラ黒江
故事舞台位於原作 的見瀧原町，以新登場的魔法少女 美國織莉子 為中心，杏子 、麻美 、焰 等原作魔法少女皆牽涉其中的嶄新故事。
本書發生於晓美焰不斷輪迴 裡的某次時間軸 。主角織莉子做為「反英雄 」角色在本書登場。因作者不同，畫風也與前2部漫畫完全不同。
注意：部份中文譯名非官方設定。
與丘比 簽約成為魔法少女的美國織莉子，擁有預知 未來的能力，並由此得知自己與見瀧原町的毀滅性結局。決心改變這一切的織莉子開始關注一名丘比感興趣的「擁有極佳魔法少女素質」的少女 。
另一方面，為討伐魔女而來到見瀧原町的佐倉杏子，與雙親 慘遭魔女殺害的少女——千歲由真 相遇。成為孤兒 的由真開始親近杏子，杏子也將她當作妹妹看待。於此同時，已導致多名魔法少女遇害的「獵殺魔法少女」正橫行此地，為了守護杏子、由真與見瀧原町，巴麻美與晓美焰被捲入了「獵殺鹿目圓 」的巨大陰謀 ......。
每集封面左上角均印有：「這將是，一個會改變她命運的事件—— 這將是，完全另一個魔法少女故事的開始——（WHICH WOULD BE, AN INCIDENT THAT WOULD CHANGE HER DESTINY— WHICH WOULD BE, THE BEGINNING OF A WHOLE ANOTHER MAGICAL-GIRL TALE—）」
本作的番外篇作品分別為《魔法少女小織〜noisy citrine〜》（日语：魔法少女おりこ☆マギカ〜noisy citrine〜 ）為搞笑番外篇漫画作品，於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》第2号、第3号連載，全2話。《魔法少女小織〜symmetry diamond～》（日语：魔法少女おりこ☆マギカ～symmetry diamond～ ），於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》第5号至第7号連載，全3話。《[新約] 魔法少女小織〜sadness prayer～》（日语：[新約] 魔法少女おりこ☆マギカ～sadness prayer～ ），於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》第10号至第30号連載，全24話。
單行本收錄兩個衍生作《魔法少女小織〜noisy citrine〜》、《魔法少女小織〜symmetry diamond～》。
魔法少女小織〜noisy citrine〜 描述織莉子的同伴吳希里華 簽約之初的故事。
魔法少女小織〜symmetry diamond〜 描述為戰勝即將到來的魔女之夜，織莉子與吳希里華共同行動著，但織莉子仍無法控制預知能力的魔力消耗。某日夜晚，織莉子隻身外出時在公園 遇到一名少女，彼此飲茶談天。但織莉子隨即以預知見到，她們話別之後，這名少女——千歲由真慘遭母親殺害 的新聞 報導。此時，與丘比重逢的魔法少女優木沙沙（日语：優木沙々 ）為爭奪地盤，將殺意對準了織莉子一行人......
《魔法少女和美 〜The innocent malice〜 》（日语：魔法少女かずみ☆マギカ 〜The innocent malice〜 ），又译《魔法少女和美☆魔力 ～无辜的恶意～》，原作：平松正樹 天杉貴志 Manga Time Kirara Forward 》初次连载。
与《魔法少女小圆 》共享相同的世界观 ，故事舞台位於另一个城市「翌桧市（あすなろ市 失忆 的魔法少女 ——和美 。根據本書原作（平松）的說法，《和美》的故事是對正篇世界觀的反論，以魔法少女的「憤怒 」取代「絕望 」，並試圖脫離「魔法少女的世界＝對丘比 的否定」此一前提。
少女 注意到了，自己置身於黑暗 裡。似乎發出了說話的聲 響，但她看不到講話的男人 。自己為何裸體 、被關在手提箱裡已不復記憶，少女只記得「和美」這個名子而已。
風波過後，和美與找回自己的2名少女——御崎海香 、牧薰 恢復同居 的生活。在隨後發生的惡性事件中，和美想起自己曾是魔法少女的事情。被告知失憶前曾與另外4人共組「昴宿星圣团 」的實情後，和美決定恢復一行7人討伐魔女的生活。
然而某天，出現1名憎恨「昴宿星圣团」的魔法少女，她們自此被捲入殘酷的命運......
魔女MADOKI（魔女モドキ ）
正式名稱不明。人體 埋入恶意之种的一般人出現負面感情後變化而成。與魔女的性質不同，變形的人被打敗後不會死亡 。 惡意之實（イーブルナッツ ）
类似悲叹之种的伪品，在翌桧市流通。惡意之種外觀雖然與悲嘆之種很相似，但不具備悲嘆之種的功能，不能被柔比 和丘比回收。在剧情後期表明是「if」为了消耗昂星团的魔力而制造出来的。
注意：中文譯名非官方設定。
《魔法少女貞德 The Legend of "Jeanne d'Arc" 》（日语：魔法少女たると☆マギカ The Legend of "Jeanne d'Arc" ），或譯《魔法少女塔爾特》，是枡狐 蛙空による
注意：中文譯名非官方設定。
《魔法少女鈴音 》（日语：魔法少女すずね☆マギカ ），是GAN繪製的外傳漫畫，單行本第1冊預定於2013年11月12日發行，並預定於2014年1月開始在《MANGA TIME KIRARA MAGICA》连载之後的故事。
魔法少女小圆 漫画选集（日语：魔法少女まどか☆マギカ アンソロジーコミック ） 魔法少女小圆 四格漫画选集（日语：魔法少女まどか☆マギカ 4コマアンソロジーコミック ）
《巴麻美的平凡日常》（巴マミの平凡な日常 同人誌 作品，更改一些設定後於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》開始連載，定期刊發行終止後，移至《MANGA TIME KIRARA Forward》（まんがタイムきららフォワード
《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》（まんがタイムきらら☆マギカ Manga Time Kirara Carat 》增刊发行，为双月刊，原则上逢偶数月9日发售。
注意：部分中文譯名非官方設定。
魔法少女小圓 小焰復仇記!（日语：魔法少女まどか☆マギカ ほむらリベンジ！ ）（枡狐/蛙空、Vol.1〜）
焰過來（日语：くるほむ ）（みさちゅう/Nash、Vol.1〜2）
歡迎光臨悲嘆之種☆咖啡館（日语：カフェ☆グリーフシードへようこそ！ ）（陽菜コトリ、Vol.1〜）
すてマ！〜魔法少女拾いました〜/〜魔法少女拾わされました〜（山田石人、Vol.1〜） 魔法少女小圓社（日语：魔法少女部まどか☆マギカ ）（ヒゲ、Vol.1〜）
POMU☆魔力（日语：ぽむ☆マギ ）（九十九、Vol.1〜）
まどか☆えんがわ（PAPA、Vol.1〜） 見瀧原幼稚園魔法班（日语：みたきはら幼稚園まほう組 ）（linco、Vol.1〜）
巴麻美的平凡日常（日语：巴マミの平凡な日常 ）（あらたまい、Vol.1〜）
見滝原☆アンチマテリアルズ（みゃま、Vol.1〜） 魔法少女小織 〜noisy citrine〜（日语：魔法少女おりこ☆マギカ 〜noisy citrine〜 ）（ムラ黒江、Vol.2〜3）
漂流小圓（日语：ふわっとまどか ）（青田めい、Vol.4〜）
魔法少女小織 〜symmetry diamond〜（日语：魔法少女おりこ☆マギカ 〜symmetry diamond〜 ）（ムラ黒江、Vol.5〜7）
注意：中文譯名非官方設定。
焰的假日（日语：ほむらの休日 ）（原悠衣 、Vol.1）
魔法少女病（日语：魔法少女病 ）（Koi、Vol.1）
集合！小圓學園（日语：集まれ！まどか☆マギカ学園！ ）（熊ジェット、Vol.1）
GAME OVER〜再也不依靠任何人〜（日语：ゲームオーバー〜もう誰にも頼らない〜 ）（ほた、Vol.1）
魔法少女雲母（日语：魔法少女きらら☆マギカ ）（シュガー、Vol.2）
最佳合作夥伴！（日语：ベストパートナー！ ）（桃屋チカ、Vol.2）
更多！（日语：増える！ ）（青田めい、Vol.3）
晚餐是幸福的味道（日语：晩ご飯は幸せの味 ）（井藤ななみ、Vol.3）
丘比的受難...（日语：キュゥべえの受難… ）（Hisasi、Vol.3）
巴麻美的食慾（日语：食欲マミドモエ ）（川井マコト、Vol.4）
奇蹟與魔法與後悔（日语：奇跡と魔法と後悔と ）（荒井チェリー 、Vol.4）
雪兔與愉快的朋友們（日语：雪うさぎと愉快な仲間たち ）（龍乃亮、Vol.4）
沒用的焰。〜直到她弄丟眼鏡〜（日语：だめほむ。〜彼女がメガネを外すまで〜 ）（ざら
○○丘比（日语：○○なキュゥべえ ）（仏さんじょ
小圓的下一步（日语：まどかのとなり ）（コト、Vol.5）
表演女孩子（日语：パフォーマンスガール ）（橘あゆん、Vol.6）
笑容與鬼與汽水。（日语：笑顔とオバケと炭酸飲料。 ）（龍乃亮、Vol.6）
為我而絕望！（日语：僕のために絶望してよ! ）（ハノカゲ、Vol.7）
夜間潛水（日语：ナイトダイバー ）（袴田めら 、Vol.7）
焰的某次叛亂（日语：ほむらさんのとある叛逆 ）（里好 、Vol.8）
你和我和她（日语：貴方と私と彼女と ）（霜月絹鯊 、Vol.8）
杏子與狗（日语：杏子とわんこ ）（島崎無印、Vol.8）
魔法少女小焰☆田村〜平行世界不一定總是平行的。〜（日语：魔法少女ほむら☆たむら〜平行世界がいつも平行であるとは限らないのだ〜 ）（あfろ、Vol.3）
注意：中文譯名非官方設定。
