2011년 5월 4일 ~ 2012년 4월 11일 (피프스 섹터 편) 2012년 4월 18일 ~ 2013년 5월 1일 (크로노 스톤 편) 2013년 5월 8일 ~ 2014년 3월 19일 (갤럭시 편) 2012년 2월 13일 ~ 2012년 9월 30일 (피프스 섹터 편) 2013년 3월 18일 ~ 2013년 9월 3일 (크로노스톤 편) 2014년 1월 13일~9월 (갤럭시 편)
이나즈마 일레븐 시리즈의 후속편이지만, 스토리상으로는 완전 신작이다. 전작의 10년 후의 이야기가 진행되며, 새로운 주인공인 마츠카제 텐마가 나온다. 또한 전작의 주인공이었던 엔도 마모루는 축구부의 감독으로 등장한다.
줄거리
피프스 섹터 편
엔도 마모루가 이끌던 라이몬 일레븐과 함께, 예전에 적이나 라이벌이었던 선수들이 모여서 결성됐던 소년축구 일본대표티메 이나즈마 재팬. 그들은 풋볼 프런티어 인터내셔널(FFI)에 출전하여 각국의 강팀들과의 격돌을 벌여, 드디어 세계의 정점에 섰다. 그 눈부신 영광으로부터 10년 후...
이나즈마 재팬이 FFI 세계제패를 한 후의 효과로 일본에서의 축구의 인기와 지위가 크게 상승했으며, 이나즈마 재팬에 많은 선수들을 배출한 라이몬 중학교는 축구 명문 학교가 되어있었다. 그러나 축구의 인기와 지위가 올라간 반면, 축구의 강함이 그 학교의 사회적 평가로까지 이어지는 결과도 낳게 되었다. 그런 축구계에 수수께끼의 조직 「피프스 섹터」가 등장해 '모든 학교에 공평한 질서가 돌아가기 위해' 전국의 축구를 관리해나가기 시작하고, 중학교는 피프스 섹터의 지시대로 시합을 해야만 했다.
라이몬 중학교로의 입학을 앞두고 기대감에 가슴이 한껏 부풀어올라서 축구부에 들어가기 위해 라이몬 중학교 안을 여기저기 돌아다니던 새로운 주인공 '마츠카제 텐마'는 라이몬 중학교 축구부 고문 교사인 '오토나시 하루나' 와 만나 축구부 훈련을 구경하러 간다. 그러나 경기장에 도착한 텐마와 하루나의 눈에 들어온 것은 단 1명의 선수에 의해 완전히 당해버린 라이몬 축구부원들의 모습이었다.
그 선수는 '피프스 섹터'에서 보내진 자객(시드) '츠루기 쿄스케'. 라이몬중 축구부를 폐부하겠다는 츠루기의 말에, 비록 축구는 서투르지만 뜨겁고도 큰 열정을 마음 속에 품은 텐마는 츠루기와 1:1 축구배틀을 하게 되는데...
소년들이여... 지금 축구를 되찾을 혁명의 바람을 일으켜라!
크로노 스톤 편
텐마는 고엔지에게 요청받아 축구의 즐거움을 아이들에게 가르쳐주고 오키나와에서 일시 돌아왔다. 그리고 라이몬에 돌아 오자 축구동으로 조속히 향하지만, 축구 부원이 전혀 눈에 띄지 않는다. 의심스럽게 생각한 텐마는 그곳을 우연히 지나가던 신도에게 이야기를 듣고, 돌아온 것은 " 축구부 라는 건 원래 이 학교에 없었다"는 충격적인 말이었다.
그 후 다른 부원들을 찾을 수 있지만, 현재 축구의 추억도 텐마에 대한 기억도 모두 잃어 버렸으며, 또한 텐마가 무소속이라고 믿고 자신의 동아리에 영입해 오려 한다. 혼란한 텐마의 앞에 한 명의 이상한 외모의 소년이 나타나 텐마에게 선포한다. "너에서 축구를 삭제 한다"고.
축구를 지키기 위해 ... 텐마의 시공을 넘은 싸움이 시작된다.
새로운 시련(갤럭시) 편
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Part 1
세계 편
소년 축구의 세계 대회 ' 축구 프런티어 인터내셔널 비전 투 " (FFIV2) 라는 이름의 대회가 개최 결정 . 마츠카제 텐마 일행은 「신생 이나즈마 재팬」으로서 드디어 세계로 웅비하게 되었다.
그 대표 선수 선발 을 하기 전에 마음을 뛰게 텐마이었지만, 이나즈마 재팬에 선출 된 이들은 많은 무명의 선수들. 게다가 그들은 모두 축구가 처음인 초보자였다....
마츠카제 텐마, 츠루기 쿄스케, 신도 타쿠토 .... 그리고 마타타기 하야토 등의 새로운 부원을 갖춘 사상 최악의 이나즈마 재팬이라고 평가한 수수께끼의 신생 이나즈마 재팬의 도전이 시작되었다....
처음에는 아마추어 집단 들이 팀 에 익숙해 않은 채, 고전을 강요 당하고 있었지만, 경기마다 부원의 수수께끼가 풀리자 축구의 훌륭함을 깨닫기 시작한 일행. 격전 끝에 멋진 이나즈마 재팬은 아시아 지역 예선 결승전에서 우승을 차지한 것이었다....
Part 2
우주 편
하지만 그런 그들을 기다리고 있던 것은 대회에 숨겨진 충격적인 사실. 경기장 상공 에 정체 불명의 우주선이 나타나고 텐마 일행 앞에 새로운 자객이 온다.
자신을 외계인이라 자칭한 자객인 비트웨이 오즈록은 은하 연방 의회에서 파견 된 지구에서 18 만 8000 광년의 은하에서 열리는 행성 간 축구 대회, 그랜드 셀레스 갤럭시 본선에 지구 대표로 진출 했다고 텐마 일행에게 말한다. 지면 지구 멸망 말해지는 그 축구 대회 야말로 FFIV2의 정체이며, 그들은 이미 외계인 과 축구를 하고 있던 것이다.
그랜드 셀레스 갤럭시에서 우승 하고 지구를 지키려는 팀의 결의 하에 18 만 8000 광년의 우주로 여행을 떠난 텐마 일행. 그래서 텐마가 보았던 것은 이미 멸망했을 어느 행성에 있던 한 명의 공주의 모습이었다 ....
그녀가 말하는 「 은하를 지키는 방법」 이란 .... 지구 대표 "어스 일레븐"으로 더욱 수수께끼인 텐마 일행의 투쟁이 지금 시작된다 ....
본 엔딩곡은 게임 「이나즈마 일레븐 GO 3 갤럭시 Big Bang」의 엔딩 테마이기도 하다.
3기 3-B번째 ED (33화~42화) 폭풍ㆍ회오리ㆍ허리케인 (嵐・竜巻・ハリケーン)
노래 - COLORS(코바야시 유우, 키타하라 사야카)
본 엔딩곡은 게임 「이나즈마 일레븐 GO 3 갤럭시 Super Nova」의 엔딩 테마이기도 하다.
3기 4번째 ED (43화) 정말 고마워! (本当にありがとう)
노래 - 엔도 마모루 (CV: 타케우치 준코), 마츠카제 텐마 (CV: 테라사키 유카)
기타
2011년6월, 레벨파이브 측에서 이나즈마 일레븐 GO에서 등장할 옛 이나즈마 일레븐의 등장인물들의 모습이 등장해서 화제가 됐지만, 그 이미지는 곧장 불법 유포라는 사실이 알려졌다. 그러나 이미 2ch 같은 일본 사이트, 트위터, 최근에는 한국에서까지 해당 이미지가 퍼지자, 히노 아키히로 사장은 이번 유출 사건의 처벌만큼은 엄중하게 해놓겠다고 하여 큰 문제가 되고 있다.