Зелените несулфурни бактерии (Chloroflexia) се една од шестте класи на бактерии во коленотоChloroflexi, кои се исто така познати како филаментозни аноксигени фототрофи. Тие произведуваат енергија од светлината и се именувани според зелениот пигмент бактериохлорофил с кој се наоѓа во посебни фотосинтетски тела наречени хлорозоми.
Класата Chloroflexia е група на длабоко разгранувачки фототрофни бактерии (со исклучок на видовите на Herpetosiphon и Kallotenue), која опфаќа три реда: Chloroflexales, Herpetosiphonales, и Kallotenuales.[4][5][6][7][8] Редовите Herpetosiphonales и Kallotenuales содржат по една фамилија и по еден род: Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) и Kallotenuaceae (Kallotenue), соодветно; додека Chloroflexales се филогенетски поразнообразни.
Компаративните геномски анализи неодамна ја имаат ажурирано таксономијата на класата Chloroflexia, делејќи го редот Chloroflexalesво подредот Chloroflexineaeкој ги содржи фамилиитеOscillachloridaceaeи Chloroflexaceae, и подредотRoseiflexineaeкој ја содржи фамилијатаRoseiflexaceae. Ревидираната таксономија беше заснована на идентификација на бројни CSIs (анг. соnserved signature inserts and deletions) кои претставуваат ефикасни молекуларни маркери за одредување на заедничко потекло.[9][10][11][12] Дополнителна поддршка за поделбата на Chloroflexales во двата подреда се разликите во физиолошките одлики, каде што секој подред има различен профил на каротиноиден, хинонски, и масно киселиниски состав.[13][14] Во прилог на демаркирање на таксономската припадност, CSIs може да играат улога во специфичните одлики на членовите во рамките на одреден таксон. На пример, сегмент од четири аминокиселини во ензимотпируват флаводоксин/фередоксин оксидоредуктаза, белковина која игра важна улога во фотосинтетските организми, најдена е исклучиво кај членовите на родот Chloroflexus, и се смета дека игра значајна функционална улога.[15][16] Со користењето на CSIs дополнителна истрага е направена за демаркација на филогенетската позиција на Chloroflexia во однос на соседните фотосинтетски групи како што е Cyanobacteria.[17] Најдено е дека Chloroflexia и Chlorobi споделуваат CSI, а се толкува дека настанал како резултат на хоризонтален трансфер на гени.[18]
Таксономија
Ова е моментално прифатената таксономија на зелените несулфурни бактерии:[19]
Ред Chloroflexales
Подред Chloroflexineae
Фамилија Chloroflexaceae Trüper 1976 emend. Gupta et al. 2013
Род Chloroflexus Pierson and Castenholz 1974
C. aggregans Hanada et al. 1995
C. aurantiacus Pierson and Castenholz 1974
Фамилија Oscillochloridaceae Keppen 2000 emend. Gupta et al. 2013
Род Oscillochloris Gorlenko and Pivovarova 1989 emend. Keppen et al. 2000
O. chrysea Gorlenko and Pivovarova 1989
O. trichoides (ex Szafer) Gorlenko and Korotkov 1989 emend. Keppen et al. 2000
Род Chloronema Dubinina and Gorlenko 1975
Chloronema giganteum Dubinina and Gorlenko 1975
Подред Roseiflexineae
Фамилија Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
Род Roseiflexus Hanada et al. 2002
Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002
Род Heliothrix Pierson et al. 1986
Heliothrix oregonensis Pierson et al. 1986
Ред "Herpetosiphonales"
Фамилија "Herpetosiphonaceae"
Род Herpetosiphon Холт and Lewin 1968
H. aurantiacus Холт and Lewin 1968
H. geysericola (Copeland 1936) Lewin 1970
Дополнително, "Kouleothrix aurantiaca" и "Dehalobium chlorocoercia" не се целосно опишани.
Потекло на поимот
Името "Chloroflexi" е неолатински множина од "Chloroflexus", што е името на првиот опишан род. Именката е комбинација од грчкиот збор chloros (χλωρός)[20] што значи "зеленикаво-жолт" и латинскиот flexus (од flecto)[21] што значи "виткање", со значење "зелено свиткување".[22] Името нема врска со хемискиот елемент хлор.
Наводи
↑Sutcliffe, I. C. (2010). „A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture“. Trends in Microbiology. 18 (10): 464–470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID20637628.
↑Rokas, A.; Holland, P. W. (2000). „Rare genomic changes as a tool for phylogenetics“. Trends in Ecology & Evolution. 15 (11): 454–459. doi:10.1016/S0169-5347(00)01967-4. PMID11050348.
↑Gupta, R. S.; Griffiths, E. (2002). „Critical issues in bacterial phylogeny“. Theoretical population biology. 61 (4): 423–434. doi:10.1006/tpbi.2002.1589. PMID12167362.
↑Hanada S, Pierson BK (2006) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes: a handbook on the biology of bacteria, pp. 815-842. Eds Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH, Stackebrandt E Springer-: New York.
↑Pierson BK, Castenholz RW (1992) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes, pp. 3754-3775. Eds Balows A, Truper HG, Dworkin M, Harder W, Schleifer KH Springer-: New York.
↑χλωρός. Henry George Liddell, Robert Scott. A Greek-English Lexicon - Perseus Project
↑Lewis, Charlton T. and Charles Short, A Latin Dictionary. Oxford: Clarendon Press, 1879. Online version at Perseus
↑Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (July 26, 2005) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (уред.). Introductory Essays. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 2A (2. изд.). New York: Springer. стр. 304. ISBN978-0-387-24143-2. British Library no. GBA561951.
Литература
Garrity GM, Holt JG (2001). „Phylum BVI. Chloroflexi phy. nov“. Во D.R. Boone and R.W. Castenholz, eds. (уред.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (2. изд.). New York: Springer Verlag. стр. 169. ISBN978-0-387-98771-2.CS1-одржување: излишен текст: список на уредници (link)
