Клуб был основан в 1993 году, но как юридическое лицо был зарегистрирован только 5 апреля 1996 года. С 1997 года участвовал в чемпионатах России среди команд Первой лиги/Первого дивизиона. В 1999 году, не доиграв сезон, клуб снялся с соревнований, с 2002 года снова стал выступать в Первом дивизионе. В 2005 году вышел в Высший дивизион, где проиграл все матчи. После вылета из Высшего дивизиона сначала не собирался выступать в Первом дивизионе, но затем заменил отказавшийся от участия московский «Алектан». 2007 год тоже не принес каких либо достижений и из команды в другие клубы ушла большая часть игроков, в том числе и в именитые московские команды. В следующих трёх сезонах клуб был одним из аутсайдеров зоны «Юг» Первого дивизиона. В сезоне 2009 года команда проиграла все матчи в группе, пропустив в среднем по 7,67 мячей за игру, но продолжила выступление в отборочных этапах Первого дивизиона и стала рекордсменом по количеству проведенных в нём сезонов - 21 (1997-1999, 2002-2005, 2007-2020), пропустив за это время более 1000 мячей (с учётом технических результатов).
↑в сезоне 1999 «Виктория» была исключена из соревнований после первого этапа
↑в Первом дивизионе 2003 между участниками Финального этапа учитывались результаты игр Предварительного этапа, но неизвестны результаты 22-х матчей, поэтому статистика по клубу дана согласно итоговой официальной турнирной таблицы
↑после сезона 2006 «Виктория» была заявлена в Первый дивизион 2007 вместо снявшегося по финансовым причинам «Алектана» (Москва)
Кубок России
без учёта мячей забитых в сериях послематчевых пенальти