Цвинтар заснований у 1859 році та отримав свою назву від колишнього села Владичино, розташованого неподалік від Кускова. Тоді ця земля належала Златоустенському чоловічому монастирю.
Храм Пресвятої Богородиці був побудований у Владичино ще у 1770 році за фінансової допомоги графа К. Г. Розумовського, пізніше до нього була прибудована дзвіниця. Ікони були перенесені з сусіднього Нікольського храму.
Поступово церква старіла, і у 1854 році було прийнято рішення про його реконструкції. Гроші на це дав купець Г. М. Толоконников. 2 лютого1859 року було освячено відреставрований та добудований храм.
Основна святиня храму — шанована ікона Смоленської Божої Матері з частинками мощей Святителів Василія Великого та Миколая Чудотворця і великомучениці Варвари.
У північній частині цвинтаря у 1913 році проектом архітектора С. М. Ільїнського була збудована кам'яна каплиця на честь Матрони Анемнясевської, що збереглася до наших днів.
Матрона Анемнясевська (нар. 1864 — пом. 1936) — свята Російської Православної Церкви. При знесенні частини цвинтаря могила перенесена на Долгопрудненський цвинтар.