Папакін Георгій Володимирович - директор, доктор історичних наук Маврін Олександр Олександрович, заступник директора з наукової роботи, кандидат історичних наук
Археографічна комісія та Інститут — наступники і продовжувачі діяльності Київської археографічної комісії (1843), Археографічної комісії НТШ (1895), Археографічної комісії Всеукраїнської академії наук (1919), Археографічної комісії Центрального Архівного управління (1929), інших наукових, навчальних, культурно-освітніх осередків XIX — початку XX століття.
Директором Інституту від часу заснування до 2013 року був член-кореспондент НАН України Павло Степанович Сохань.
Основні завдання
Основними завданнями закладу стало:
виявлення, опрацювання та публікація документальних джерел вітчизняної історико-культурної спадщини,
координація та науково-методичне керівництво археографічною діяльністю інших наукових, освітніх, культурологічних установ в Україні,
розробка теоретико-методичних засад сучасної археографії та джерелознавства.