Изворот на Патагвај е јужно од Дијамантино во Мато Гросо, Бразил. Општо гледано, реката тече југозападно, и поминува низ бразилскиот град Касерес, а потоа свртува јужно, поминувајќи низ долините на Пантанал, градот Корумба, а понатака покрај бразилско-боливиската граница. Од градот Пуерто Бахија Негра, реката е всушност граница помеѓу Бразил и Парагвај. Реката Парагвај ја пресекува државата Парагвај речини на половина. Западниот дел на државата е Гран Чако и е слабо населен, а источнот дел на државата е густо пошумен и доста населен. Реката поминува во главниот град на Парагвај, Асунсион. Од Асунсион јужно на 275 км се соединува со реката Парана во Аргентина.
Bascheck, B. and Hegglin, M. (2004). Plata/Paraná River Basin, A Case Study. Swiss Federal Institute for Environmental Science and Technology.
Da Rosa, J. E. (1983). Economics, politics, and hydroelectric power: the Paraná River Basin. Latin American Research Review, VXVIII (3), pp. 77–107.
Elhance, A. P. (1999). Hydropolitics in the 3rd World, Conflict and Cooperation in International River Basins. Washington, D.C.: United States Institute of Peace.
Gleick, P.H., ed. Water in Crisis. A Guide to the World's Fresh Water Resources, New York: Oxford University Press, pp. 13–24.
Kulshreshtha, S.N. (1993). World Water Resources and Regional Vulnerability: Impact of Future Changes. RR-93-10, IIASA, Laxenburg, Austria.
Lammers, O., Moore, D. and Preakle, K. (1994). Considering the Hidrovia: a preliminary report on the status of the proposed Paraguay/Parana waterway project. Working Paper 3. Berkeley, California: International Rivers Network, July.
Transboundary Freshwater Dispute Database (TFDD) (2007). Oregon State University.