Станція відкрита у 1871 році під первинною назвою Бар. У 1891 році станцію біля Вовковинців перейменовано на Комарівці — за назвою села, що нині перебуває у Жмеринському районіВінницької області. Справа в тому, що залізниця мала пролягати саме через село Комарівці, проте Вовковинецький поміщик, розуміючи, що залізниця — це прогрес і для того, щоб показати свою могутність, підкупив будівельників і тим самим залізниця була прокладена через Вовковинці, проте назва станції так залишилась Комарівці через те, що ніхто не захотів переробляти безліч державних документів[2].
Пасажирське сполучення
На станції Комарівці зупиняються приміські електропоїзди сполученням Жмеринка — Гречани[3].