일본의 국보로 지정되어 있는 마쓰모토성과 일본 알프스의 등산 명소로 유명하다. 현청 소재지는 아니지만 나가노 FM 방송의 본사, 일본은행 마쓰모토 지점, 마쓰모토 공항, 나가노현의 가장 큰 대학인 신슈 대학과 육상자위대 마쓰모토 주둔지 등이 있어 사실상 나가노현 중부에 있는 "부현도(副県都)"와 같은 존재가 되었다. 상업 판매액은 나가노시에 이어 현내 2위이지만 시가지형 복합 점포의 수는 현내에서 가장 많다. 또한 공업 생산액이 아즈미노시, 우에다시에 이어 현내 3위로 나가노현의 공업 거점 중 하나이다.
지리
마쓰모토시는 나가노현의 중앙에서 약간 서쪽에 있고 현청 소재지인 나가노시에서 남서쪽으로 75km, 도쿄도 구부에서 서북쪽으로 240km 떨어진 곳에 있다. 2005년 시정촌 합병 후의 시역은 서쪽의 히다산맥(기타알프스, 서산, 3000m급)에서 동쪽의 지쿠마 산지(우쓰쿠시가하라, 동산, 2000m급)까지 광대하고 나가노현 내에서는 가장 넓다. 마쓰모토 시가지(마쓰모토역 주변 등)는 두 개의 산맥(산지)의 사이에 있는 마쓰모토 분지의 중앙부, 복합 선상지상에 있다(해발 약 600m).
강으로는 가미코치 방면에서 흐르기 시작하는 아즈사가와강이 시의 서부를 흐르고 나라이강이 시를 이분하듯이 횡단하고 있다. 또 시가지에는 청류인 메토바강이 횡단하고 있다. 산으로는 합병과 함께 일본 100대 명산 중 다수가 마쓰모토시에 편입되어 산의 도시의 측면이 강해졌다. 주부 산악 국립공원, 야쓰카타케 주신 고원 국립공원이 시내에 있다.
시내에는 다수의 선상지가 형성되어 있다. 또 마쓰모토시는 대지구대 위에 있고 시 서부에는 이토이가와-시즈오카 구조선이 지나고 있다. 삼림 면적은 74,000ha로 마쓰모토시 전체의 약 81%를 차지한다.
기후
쾨펜의 기후 구분으로는 온난 습윤 기후(Cfa)와 냉대 습윤 기후(Df)로 나뉜다. 일본식 기후 구분으로는 아즈미 지구를 제외하고 중앙 고원형의 대륙성 기후, 중앙 고지식 기후가 현저하게 나타나는 곳으로 대부분의 학교 교육용 지도책에서 중앙 고원형 기후의 도시 예시로 다루어지고 있다. 기본적으로 평야부는 강수량이 적고 일조 시간이 많다. 가미코치나 노리쿠라고원, 우쓰쿠시가하라 등의 산악 지대는 약간 강수량이 많아지고 일조 시간은 적어진다. 아즈미 지구는 동해측 기후로 겨울에 눈이 많아 폭설 지대로 지정되어 있다.