계속 승승장구하던 마침내 박준형은 2003년에 KBS 연예대상을 수상했는데, 지금까지의 수상자들은 대부분이 신동엽, 강호동처럼 버라이어티 진행자였던 것에 반해 수상자 중 유일무이하게 개그맨으로 연예대상을 받은 연예인이다.
그 후, MC, 방송인으로서의 활동도 하고 서울종합예술학교의 개그/MC과의 교수를 맡게 되었다. 그러나 그는 계속 《개그콘서트》를 떠나지 않고 '우비 삼남매', '마빡이', '사랑의 가족', '까다로운 변선생', '패션 7080' 등의 무수한 히트 코너에 출연하고 《개그콘서트》내에서도 가장 존경받는 대 선배로 자리매김한다.
그가 공전의 히트를 기록한 코너는 셀 수 없을 정도로 많은데 그 중 연예대상에서 최우수 작품상을 수상한 코너는 박준형의 생활 사투리, 사랑의 가족, 골목대장 마빡이 등이고 단일 개그맨의 최우수작품상 수상횟수도 그의 기록은 아직 깨지지 않을 수도 있다.
그가 그리 많은 코너를 히트시킬 수 있었던 원동력은 그가 개발한 "대학로 극장 시스템"에서 찾을 수 있는데 방송을 위한 개그를 미리 소극장에서 실험해보고 첨삭하는 과정을 계속 반복하는 형식이었다.
훗날 이 시스템은 많은 개콘후배들에게도 도움을 주었으며, 또 다른 공개코미디 《웃찾사》가 발전하는데도 크게 일조한다.
그러나 그는 콤비였던 정종철이 당시 개콘PD와의 불화로 출연정지를 당하게 되고 3개월뒤 《개그콘서트》를 떠나게되자 동생을 혼자 보낼수는 없다며 새로운 도전을 감행. 2008년 정종철, 오지헌과 함께 《개그콘서트》를 떠나 MBC 《개그야》, 《하땅사》등의 프로그램에 출연하였다.
2008년 4월 정종철과 오지헌MBC 개그맨 처음 첫 데뷔 처음 첫 전향 하여 데뷔 자리 옮기고 데뷔 이전 하였고 개그야로 출연하였는데 MBC TV 개그맨 콘테스트 6기 시험에 응시했으나[4] 탈락했다.
2011년에는 SBS의 신설 개그프로그램인 《개그투나잇》에서 강성범과 함께 공동 MC 역할을 맡아 소위 개그콘서트가 아니라 다른 방송의 코미디를 살리기 위해 노력했으며 강성범과 함께 SBS 공채 개그맨 5기에 응시했으나 본인(박준형)은 탈락했고[5] 본인(박준형) 외에도 정종철이 SBS 공채 5기에 응시했지만[6] 탈락하기도 했다.
2012년 《코미디빅리그》로 다시 둥지를 옮기고 새로운 개그실험을 하고 있는 그는 현재 공개방송 코미디를 하고있는 모든 개그맨 중 유일하게 방송3사 코미디를 다 경험한 개그맨이고 동기이자 절친인 개그맨박성호와 함께 공개 코미디 서열 1위에 올라있다.