Човечка Y-ДНК филогена и распространетост на хаплогрупа.[1] *(а) Филогенетско дрво. „ка“ значи „пред илјада години“. *(б) Географските распределби на хаплогрупите се прикажани во боја. *(в) Легенда за географска боја.
Хаплогрупа на ДНК на човечки Y-хромозом — хаплогрупа дефинирана со мутации во не- рекомбинирачките делови на ДНК од машкиот специфичен Y хромозом (наречен Y-ДНК). Многу луѓе во хаплогрупата споделуваат сличен број на кратки тандем повторувања (STR) и типови на мутации наречени еднонуклеотидни полиморфизми (SNPs).[2]
Човечкиот Y-хромозом акумулира приближно две мутации по генерација.[3] Y-ДНК хаплогрупите претставуваат главни гранки на филогенетското дрво на Y-хромозомот кои споделуваат стотици или дури илјадници мутации уникатни за секоја хаплогрупа.
Најновиот заеднички предок на Y-хромозомот (Y-MRCA, неформално познат како Y-хромозомски Адам) е најновиот заеднички предок (MRCA) од кој сите моментално живи луѓе потекнуваат патрилинеално. Се проценува дека Y-хромозомскиот Адам живеел пред околу 236.000 години во Африка. Со испитување на другите тесни грла, повеќето евроазиски мажи (мажи од населенија надвор од Африка) потекнуваат од човек кој живеел во Африка пред 69.000 години (Хаплогрупа КТ). Други големи тесни грла се случија пред околу 50.000 и 5.000 години и последователно потеклото на повеќето евроазиски мажи може да се проследи наназад до четири предци кои живееле пред 50.000 години, кои биле потомци на Африканците (E-M168).[4][5][6]
Конвенција за именување
Шематска илустрација на конвенцијата за именување на хаплогрупи Y-ДНК. Хаплогрупите се дефинираат преку мутации (SNP).
Y-ДНК хаплогрупите се дефинирани со присуство на серија Y-ДНК SNP маркери. Поткладите се дефинирани со терминален SNP, SNP најдалеку во филогенетското стебло на Y-хромозомот.[7][8] Конзорциумот на хромозомот Y (YCC) разви систем за именување на главните хаплогрупи на Y-ДНК со големи букви од А до Т, со понатамошни поткладови именувани со помош на броеви и мали букви (номенклатура на долга рака YCC). Стенографската номенклатура на YCC ги именува Y-ДНК хаплогрупите и нивните поткладови со првата буква од главната хаплогрупа Y-ДНК проследена со цртичка и името на дефинирачкиот терминал SNP.[9]
Номенклатурата на хаплогрупата на Y-ДНК се менува со текот на времето за да се приспособи на зголемениот број на SNP што се откриваат и тестираат, и како резултат на проширувањето на филогенетското дрво на Y-хромозомот. Оваа промена во номенклатурата резултираше со неконзистентна номенклатура која се користи во различни извори.[2] Оваа недоследност и сè понезгодната долга номенклатура, поттикна движење кон користење на поедноставната стенографија.
Хаплогрупата А е макрохаплогрупата NRY (некомбинирачка Y) од која потекнуваат сите современи татковски хаплогрупи. Ретко е распространето во Африка, концентрирано меѓу населенијата Коисани на југозапад и нилотските населенија на североисток во долината на Нил. БТ е потклад на хаплогрупата А, поточно на кладот A1b (A2-T во Круциани и сор. 2011), и тоа:
Дефинитивните мутации што го одвојуваат КТ (сите хаплогрупи освен А и Б) се M168 и M294. Местото на потекло е веројатно во Африка. Неговата старост се проценува на приближно 88.000 години,[11][12] а во поново време на околу 100.000[13] или 101.000 години.[14]
Хаплогрупата C1b1a2a (B67) пронајдена меѓу луѓето Лебо во Борнео, Индонезија
Хаплогрупа C1b1a2b (F725) пронајдена кај Хан Кинезите (Гуангдонг, Хунан и Шанкси), луѓето Даи (Јунан), луѓето Мурут (Брунеи), Малајците (Сингапур) и луѓето Аета (Филипини)
Хаплогрупа C1b1a3 (Z16582) пронајдена со ниска честота во Саудиска Арабија и Ирак
Хаплогрупата C1b1b (B68) пронајдена кај луѓето од Дусун (Брунеи)
Групите кои потекнуваат од хаплогрупата F се наоѓаат кај околу 90% од светското население, но речиси исклучиво надвор од Потсахарска Африка.
Ф xG, H, I, J, K е ретка кај современите населенија и врвови во Јужна Азија, особено Шри Ланка.[10] Исто така, се чини дека одамна е присутна во Југоисточна Азија; пријавен е со стапки од 4-5% во Сулавеси и Лембата. Една студија, која не проверуваше сеопфатно за други поткладови на F-M89 (вклучувајќи некои поткладови на GHIJK), покажа дека индонезиските мажи со SNP P14/PF2704 (што е еквивалентно на M89), сочинуваат 1,8% од мажите во Западен Тимор, 1,5% од Флорес 5,4% од Лембата 2,3% од Сулавеси и 0,2% во Суматра.[15][16] F* (Ф xF1, F2, F3) е забележано кај 10% од мажите во Шри Ланка и Јужна Индија, 5% во Пакистан, како и пониски нивоа кај народот Таманг (Непал) и во Иран. F1 (P91), F2 (M427) и F3 (M481; претходно F5) сите се многу ретки и практично ексклузивни за регионите/етничките малцинства во Шри Ланка, Индија, Непал, Јужна Кина, Тајланд, Бурма и Виетнам. Меѓутоа, во такви случаи, можноста за погрешна идентификација се смета за релативно висока и некои може да припаѓаат на погрешно идентификувани поткладови на Хаплогрупата GHIJK.[17]
Хаплогрупа G (M201)
Хаплогрупата G (M201) настанала пред околу 48.000 години, а нејзиниот најнов заеднички предок најверојатно живеел пред 26.000 години на Блискиот Исток. Во Европа се прошири со неолитската револуција.
Хаплогрупата H (M69) веројатно се појавила во Јужна Средна Азија, Јужна Азија или Западна Азија, околу 48.000 години БП, и останува во голема мера распространета таму во облиците на H1 (M69) и H3 (Z5857). Нејзините поткладови се наоѓаат и на пониски честоти во Иран, Средна Азија, низ Блискиот Исток и Арапскиот полуостров.
Сепак, H2 (P96) е присутен во Европа од неолитот и H1a1 (M82) се шират на запад во средновековната ера со преселбата на Ромите.
Хаплогрупа I (M170)
Хаплогрупата I (M170, M258) се наоѓа главно во Европа и Кавказ.
Хаплогрупа I1 нордиски/нордиски европиди (M253) Пронајден главно во северна Европа
Хаплогрупа I2 Динариди/Динариски европиди (Р215) Се среќава главно на Балканот, југоисточна Европа и Сардинија освен за I2B1 (m223) кој се среќава со умерена честота во Западна, Централна и Северна Европа.
Хаплогрупата Ј* (J-M304*) е ретка надвор од островот Сокотра.
Хаплогрупата Ј1 Семити/Бедуини Арабиди (М267) се поврзани со североисточните кавкаски народи во Дагестан и семитските јазици кои зборуваат луѓе на Блискиот Исток, Етиопија и Северна Африка, а исто така се наоѓаат во Медитеранска Европа на помали честоти слично како хаплогрупата Т.
K(xLT, K2a, K2b) - односно K*, K2c, K2d или K2e - се наоѓа главно во Меланезија, Абориџините Австралијци, Индија, Полинезија и островот Југоисточна Азија.
Хаплогрупи L и T (K1)
Хаплогрупата L (M20) се наоѓа во Јужна Азија, Средна Азија, Југозападна Азија и Медитеранот.
Единствените живи мажи пријавени дека ја носат основната парагрупа К2* се домородните Австралијци. Големите студии објавени во 2014 и 2015 година сугерираат дека до 27% од Абориџините мажи од Австралија носат К2*, додека други носат потклад на К2.
Хаплогрупата N веројатно потекнува од источна Азија и се проширила и на север и на запад во Сибир, што е најчестата група пронајдена кај некои народи што зборуваат уралски.
Хаплогрупа O1a (M119, CTS31, F589/Page20, L246, L466) Пронајдена во источна, централна и јужна континентална Кина, Тајван и Југоисточна Азија, особено кај австронезиските и таи-кадаи народи
Хаплогрупа O1b2 (SRY465, M176) пронајдена во Јапонија, Кореја, Манџурија и Југоисточна Азија
Хаплогрупа О2 (М122) пронајдена низ Источна Азија, Југоисточна Азија и Австронезија вклучувајќи ја Полинезија
Хаплогрупи K2b1, M & S
Не се идентификувани примери на базалната парагрупа K2b1*. Мажите кои носат потклади на K2b1 се наоѓаат првенствено кај папуанските народи, микронезиските народи, домородните Австралијци и Полинезијците.
Нејзините примарни поткладови се две главни хаплогрупи:
Хаплогрупа М (P256) позната и како K2b1b: пронајдена во Нова Гвинеја и Меланезија.
Хаплогрупа P (K2b2)
Хаплогрупата P (P295) има две примарни гранки: P1 (P-M45) и исклучително ретката P2 (P-B253).[21]
P*, P1* и P2 се наоѓаат заедно само на островот Лузон на Филипините.[21] Особено, P* и P1* се наоѓаат со значителни стапки меѓу членовите на народот Аета (или Агта) од Лузон.[22] Додека, P1* сега е почеста кај живите поединци во Источен Сибир и Средна Азија, исто така се наоѓа на ниски нивоа во копното Југоисточна Азија и Јужна Азија. Разгледани заедно, овие дистрибуции имаат тенденција да сугерираат дека P* се појавил од K2b во Југоисточна Азија.[22][23]
P1 е исто така главен јазол на два примарни клада:
Хаплогрупа Q (Q-M242) и;
Хаплогрупа R (R-M207). Тие го делат заедничкиот маркер M45 како додаток на најмалку 18 други SNP.
Q е дефиниран од SNP M242. Се верува дека се појавил во Средна Азија пред околу 32.000 години.[24][25] Поткладовите на Хаплогрупата Q со нивните дефинирани мутации, според ISOGG дрвото од 2008 година[26] се дадени подолу. ss4 bp, rs41352448, не е претставена во дрвото ISOGG 2008 бидејќи е вредност за STR. Оваа вредност на ниска честота е пронајдена како нова лоза Q (Q5) кај индиските населенија.[27]
Q1a3a1 (M19) Пронајден кај некои домородни народи во Јужна Америка, како што се Тикуна и Вајуу[32]
Q1a3a2 (M194)
Q1a3a3 (M199, P106, P292)
Q1a4 (P48)
Q1a5 (P89)
Q1a6 (M323) Пронајден во значително малцинство јеменски Евреи
Q1b (M378) Пронајден на ниска честота меѓу примероците на Хазара и Синди
Хаплогрупа R (M207)
Хипотетичката дивергенција на Хаплогрупата Р и нејзините потомци.
Хаплогрупата R е дефинирана со SNP M207. Најголемиот дел од Хаплогрупата R е претставена во потомокот R1 (M173), кој потекнува од Сибир. R1 има два потклада: R1a и R1b.
Хаплогрупата R1b е доминантна хаплогрупа во Западна Европа и исто така се среќава ретко распространета меѓу различни народи од Азија и Африка. Нејзиниот потклад R1b1a2 (M269) е хаплогрупата која најчесто се среќава кај современите западноевропски населенија и е поврзана со итало-келтските и германските народи.
Хаплогрупа R1 (M173) Пронајдена низ западна Евроазија
Хаплогрупа R1a (M420) пронајдена во Средна Азија, Јужна Азија и Централна, Северна и Источна Европа, Балканот
↑Karmin; и др. (2015). „A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture“. Genome Research. 25 (4): 459–66. doi:10.1101/gr.186684.114. PMC4381518. PMID25770088. "we date the Y-chromosomal most recent common ancestor (MRCA) in Africa at 254 (95% CI 192–307) kya and detect a cluster of major non-African founder haplogroups in a narrow time interval at 47–52 kya, consistent with a rapid initial colonization model of Eurasia and Oceania after the out-of-Africa bottleneck. In contrast to demographic reconstructions based on mtDNA, we infer a second strong bottleneck in Y-chromosome lineages dating to the last 10 ky. We hypothesize that this bottleneck is caused by cultural changes affecting variance of reproductive success among males."
↑„Something Weird Happened to Men 7,000 Years Ago, And We Finally Know Why“. 31 May 2018. Around 7000 years ago - all the way back in the Neolithic - something really peculiar happened to human genetic diversity. Over the next 2,000 years, and seen across Africa, Europe and Asia, the genetic diversity of the Y chromosome collapsed, becoming as though there was only one man for every 17 women.
↑Underhill and Kivisild; Kivisild, T (2007). „Use of Y Chromosome and Mitochondrial DNA Population Structure in Tracing Human Migrations“. Annu. Rev. Genet. 41 (1): 539–64. doi:10.1146/annurev.genet.41.110306.130407. PMID18076332.
↑This was, for instance, the case with the original subclade F3 (M96), which has since been renamed Haplogroup H2.
↑Passarino, Giuseppe; Cavalleri, Gianpiero L; Lin, Alice A; Cavalli-Sforza, LL; Børresen-Dale, AL; Underhill, PA (2002). „Different genetic components in the Norwegian population revealed by the analysis of mtDNA and Y chromosome polymorphisms“. European Journal of Human Genetics. 10 (9): 521–29. doi:10.1038/sj.ejhg.5200834. PMID12173029.
↑Karlsson, Andreas O; Wallerström, Thomas; Götherström, Anders; Holmlund, Gunilla (2006). „Y-chromosome diversity in Sweden – A long-time perspective“. European Journal of Human Genetics. 14 (8): 963–70. doi:10.1038/sj.ejhg.5201651. PMID16724001.
↑Nogueiro, Inês (2009). „Phylogeographic analysis of paternal lineages in NE Portuguese Jewish communities“. American Journal of Physical Anthropology. 141 (3): 373–81. doi:10.1002/ajpa.21154. PMID19918998.
↑Fagundes, Nelson J.R.; Ricardo Kanitz; Roberta Eckert; Ana C.S. Valls; Mauricio R. Bogo; Francisco M. Salzano; David Glenn Smith; Wilson A. Silva; Marco A. Zago (2008). „Mitochondrial Population Genomics Supports a Single Pre-Clovis Origin with a Coastal Route for the Peopling of the Americas“(PDF). American Journal of Human Genetics. 82 (3): 583–92. doi:10.1016/j.ajhg.2007.11.013. PMC2427228. PMID18313026. Архивирано од изворникот(PDF) на 2009-03-25. Посетено на 2013-05-22. Since the first studies, it has been found that extant Native American populations exhibit almost exclusively five "mtDNA haplogroups" (A–D and X)6 classified in the autochthonous haplogroups A2, B2, C1, D1, and X2a.7 Haplogroups A–D are found all over the New World and are frequent in Asia, supporting a northeastern Asian origin of these lineages
↑Zegura, S. L.; Karafet, TM; Zhivotovsky, LA; Hammer, MF (2003). „High-Resolution SNPs and Microsatellite Haplotypes Point to a Single, Recent Entry of Native American Y Chromosomes into the Americas“. Molecular Biology and Evolution. 21 (1): 164–75. doi:10.1093/molbev/msh009. PMID14595095.
↑ 43,043,1Sharma, Swarkar; Rai, Ekta; Sharma, Prithviraj; Jena, Mamata; Singh, Shweta; Darvishi, Katayoon; Bhat, Audesh K.; Bhanwer, A J S.; Tiwari, Pramod Kumar (2009). „The Indian origin of paternal haplogroup R1a1* substantiates the autochthonous origin of Brahmins and the caste system“. Journal of Human Genetics. 54 (1): 47–55. doi:10.1038/jhg.2008.2. PMID19158816.
„Y-Haplogroup A Phylogenetic Tree“. March 2013. Архивирано од изворникот на 2018-08-18. Посетено на 30 March 2013. (chart highlighting new branches added to the A phylotree in March 2013)