1998년 6월 27일 : 2002년 12월까지 공주 ~ 인풍 구간 신설을 위해 충청남도 공주시 광덕면 원덕리 ~ 정안면 인풍리 3.5km 구간 도로구역 결정[5]
1999년 8월 9일 : 2002년 12월까지 천안 분기점, 남천안 나들목, 정안 나들목 개량, 천안시 광덕면 일대 종단면 변경, 신무교 연장 조정으로 인해 충청남도 천안시 목천면 응원리 ~ 공주시 정안면 내촌리 20.6km 구간 도로구역 변경[6]
2000년 1월 18일 : 2002년 12월까지 정안휴게소, 탄천휴게소 설치를 위해 충청남도 공주시 정안면 내촌리 ~ 논산시 연무읍 고내리 60.8km 구간 도로구역 변경[7]
2001년 4월 2일 : 2002년 12월까지 천안 요금소 건설을 위해 충청남도 천안시 풍세면 미죽리 1.2km 구간, 논산 요금소 건설을 위해 충청남도 논산시 연무읍 마전리 800m 구간 도로구역 결정, 국도 제40호선 선형 변경으로 인해 공주 나들목 접속부 선형 조정을 위해 충청남도 공주시 봉정동 500m 구간 도로구역 변경[8]
2001년 7월 16일 : 2002년 12월까지 탄천휴게소 (논산방향) 설치를 위해 충청남도 공주시 탄천면 광명리 ~ 장선리 1.18km 구간 도로구역 변경[9]
2001년 8월 25일 : 기점과 종점을 각각 천안 → 논산에서 논산 → 천안으로 변경, 노선 번호와 노선명을 고속국도 제25호선 논산천안고속도로로 변경.[10]
2002년 7월 27일 : 2002년 12월까지 국가지원지방도 제68호선 확장 및 나들목 연결 램프 선형 조정을 위해 충청남도 논산시 연무읍 신화리 1.21km 구간 도로구역 변경[11]
건설 당시에는 고속도로 번호 부여 방식이 개설 순서대로 부여하였기 때문에 호남고속도로와 다른 별개의 노선으로 번호가 부여되었으나 2001년 고속국도 노선 지정령 전부개정으로 축 개념의 번호 부여방식을 취하게 되면서 호남고속도로와 같이 고속국도 제25호선으로 지정되었다. 두 고속도로는 2023년 2월 10일 고시상으로만 통합되었다.
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나들목 · 분기점
여기서 숫자는 진출입교차점 (IC 및 JC) 번호를 말하고, TG는 요금소(Tollgate), SA는 휴게소(Service Area)를 뜻한다.
2011년12월 24일 오전 10시 10분 경 논산 방향 연무 나들목 인근에서 100중 연쇄 추돌사고가 일어나 34명 부상 당하는 사고가 발생하였다.[30][31] 사고의 원인은 야간에 내린 눈과 새벽에 발생한 짙은 안개이다.[32] 이 사건 이후 이 민간투자고속도로 관리회사인 천안논산고속도로주식회사는 국토해양부 (현재의 국토교통부)로부터 대형 사고 발생 원인의 책임을 물어 대한민국민간투자고속도로 회사 사상 처음으로 정부로부터 처벌 및 징계 조치를 받았다. 이 대형 사건을 계기로 이 노선의 관리회사인 천안논산고속도로주식회사는 50억원을 들여 시설물을 보완하겠다는 계획을 국토해양부에 제출하였으며 이 계획에는 교통정보와 교통상황을 실시간으로 알려주는 도로전광표지 (VMS), 사고위험 표지, 안개 표지 증설 방안, 긴급 상황에서 나들목 / 인터체인지 (IC) 차단 등을 포함한 위기 대응 매뉴얼도 새로 만들었다.[33]
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